تنبؤ بالبنية البروتينية

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
اذهب إلى: تصفح، ‏ ابحث

التنبؤ بالبنية البروتينية إحدى الطرق المعلوماتية الحيوية والكيمياء النظرية لاستخراج نموذج لشكل البنية البروتينية في شكلها الثلاثي الأبعاد للبروتينات انطلاقا من المعلومات عن تسلسل الحموض الأمينية ضمن البروتين. بشكل آخر، يمكن أن نقول أنه التنبؤ بالبنية الثالثية اعتبارا من البنية الأولية. مثل هذا الموضوع وتشكيل نماذج للبنية الثالثية للبروتين له تطبيقات عملية كثيرة مثل تصميم الدواء المنطقي rational drug design الذي يعد أحد أكثر الحقول نشاطا بحثيا في الوقت لاراهن كل عامين يتم تقييم فعالية الطرق الحالية من خلال تجربة كاسب CASP.

انظر أيضا[عدل]

مراجع[عدل]

Bonneau R, Baliga NS, Deutsch EW, Shannon P, Hood L. (2004) Comprehensive de novo structure prediction in a systems-biology context for the archaea Halobacterium sp. NRC-1.Genome Biology. 5(8):R52-68


طرق تحديد البنية البروتينية
دقة عالية: دراسة البلورات بالأشعة السينية | مطيافية الرنين المغناطيسي النووي للبروتين | Electron crystallography
دقة متوسطة: Cryo-electron microscopy | Fiber diffraction | مطيافية الكتلة
مطيافية: NMR | ازدواج اللون الدائري | امتصاصية | تألق | Fluorescence anisotropy
انتشار انتقالي: Analytical ultracentrifugation | Size exclusion chromatography | Light scattering | NMR
انتشار دوراني: لاتماثل المناحي التألقي Fluorescence anisotropy | انكسار التدفق الثنائي Flow birefringence | إرخاء ثنائي الكهربية | NMR
طرق كيميائية: مبادلة هيدروجين-دوتيريوم | استطفار موجه-الموقع | تعديل كيميائي
طرق ترموديناميكية: فك تطوي توازني Equilibrium unfolding
طرق حاسوبية: التنبؤ بالينية البروتينية | إقحام جزيئي Molecular docking
→بنية ثالثية البنية الرابعية←