رناز هتش

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
اذهب إلى: تصفح، ‏ ابحث
رناز هتش
RNase H fix.png
بنية البلورات من إي. القولونية ريبونوكلياز هتش أي.[1]
أرقام التعريف
رقم التصنيف الإنزيمي 3.1.26.4
رقم التسجيل CAS 9050-76-4
قواعد البيانات
قاعدة بيانات الإنزيم راجع IntEnz
قاعدة بيانات براونشفايغ راجع BRENDA
إكسباسي راجع NiceZyme
موسوعة كيوتو راجع KEGG
ميتاسيك المسار الاستقلابي
بريام ملف التعريف
تركيب بنك بيانات البروتين RCSB PDB PDBe PDBsum
الأونتولوجيا الجينية AmiGO / EGO
فيروسات ريبونوكلياز هتش (رناز هتش)
أرقام التعريف
رقم التصنيف الإنزيمي 3.1.26.13
قواعد البيانات
قاعدة بيانات الإنزيم راجع IntEnz
قاعدة بيانات براونشفايغ راجع BRENDA
إكسباسي راجع NiceZyme
موسوعة كيوتو راجع KEGG
ميتاسيك المسار الاستقلابي
بريام ملف التعريف
تركيب بنك بيانات البروتين RCSB PDB PDBe PDBsum

رناز هتشأو ريبونوكلياز هتش (بالإنجليزية: RNase H)هو إنزيم تفكيك الرنا (وهو جزء من إنزيم الاستناخ العكسي الذي يفصل دنا الڤيروس HIV، الذي ركب للتو، في الرنا) .حيث يقوم بتفكيك قسم من رنا من قطعة اوكازاكي و يركب DNA PM قطعة DNA بدلا ً منها .

الوظيفة[عدل]

يبدأ إنزيم رناز هتش في تحليل الحامض النووي الريبوزى المهجن الناتج عن عملية النسخ العكسي في نشاط ريبونوكلياز وريبونوكلياز H ليشق السند 3'-OP من الحمض ريبي نووي في DNA / RNA المزدوج لإنتاج منتجات 3'-الهيدروكسيل و5'-الفوسفات وإنهاؤها. في تكرار الحمض النووي ، إنزيم رناز هتش هو المسؤولة عن إزالة التمهيدي رنا ، مما يتيح الانتهاء من الحمض النووي وتوليفها حديثا.

الهيكل[عدل]

هيكل 3-D من ريبونوكلياز H يتكون عادة من 5 تقاطعات β ورقة البيتا (β sheet أوβ-pleated sheet ) α-اللوالب أو ألفا الحلزون(Alpha helix). [2] وفي بعض ريبونوكلياز H، مثل تلك التي تظهرت في HIV-1، و انزيم مفقود واحد من اللوالب المعروفة باسم C-الحلزون، وهو موجب الشحنة في ألفا الحلزون الذي يزيد من قدرة الركيزة لملزم شكل تبارزي. [3] و الذي يتركز الإنزيم حوله ليعزر DEDD الحفظ (التي تتألف من المخلفات: D443، E478، D498 ، وD549) الذي يؤدي إلى التحلل من ركيزة الحمض ريبي نووي. [4] المغنيسيوم يستخدم أيون عادة باعتباره العامل المساعد خلال خطوات التحلل . [5] والذي هو أيضا آلية ممكنة ولكن غير مؤكدة في الأيونات المتعددة والتي هي ضرورية لأداء التحلل. [6] يحتوي أيضا إنزيم ملزمة الحمض النووي المشقوق حوالي 60 ألف في طول التي يمكن أن تشمل منطقة من 18 منضم للرنا RNA / في أزواج قاعدة الحمض النووي.

آلية العمل[عدل]

المقترح HIV-1 ريبونوكلياز H آلية

آلية مقترحة لعمل رناز هتش



الجينات[عدل]

الجينات البشرية التالية ترمز للبروتينات المرتبطة مع نشاط رناز هتش:

صبغي 19q12)ERVK6 )

صبغي ريناو هتش 1(RNASEH1)

صبغي ريناز هتش2الفا(RNASEH2A )

صبغي ريناز هتش2بي(RNASEH2B)

صبغي ريناز هتش2سي(RNASEH2C)

المراجع[عدل]

  1. ^ بنك بيانات البروتين 1JL1; Goedken ER, Marqusee S (December 2001). "Native-state energetics of a thermostabilized variant of ribonuclease HI". J. Mol. Biol. 314 (4): 863–871. doi:10.1006/jmbi.2001.5184. PMID 11734003. 
  2. ^ Schmitt TJ, Clark JE, Knotts TA (December 2009). "Thermal and mechanical multistate folding of ribonuclease H". J Chem Phys 131 (23): 235101. doi:10.1063/1.3270167. PMID 20025349. 
  3. ^ Schultz SJ, Champoux JJ (June 2008). "RNase H activity: structure, specificity, and function in reverse transcription". Virus Res. 134 (1–2): 86–103. doi:10.1016/j.virusres.2007.12.007. PMC 2464458. PMID 18261820. 
  4. ^ Tadokoro T, Kanaya S (March 2009). "Ribonuclease H: molecular diversities, substrate binding domains, and catalytic mechanism of the prokaryotic enzymes". FEBS J. 276 (6): 1482–1493. doi:10.1111/j.1742-4658.2009.06907.x. PMID 19228197. 
  5. ^ Davies JF, Hostomska Z, Hostomsky Z, Jordan SR, Matthews DA (April 1991). "Crystal structure of the ribonuclease H domain of HIV-1 reverse transcriptase". Science 252 (5002): 88–95. doi:10.1126/science.1707186. PMID 1707186. 
  6. ^ Klumpp K, Hang JQ, Rajendran S et al. (December 2003). "Two-metal ion mechanism of RNA cleavage by HIV RNase H and mechanism-based design of selective HIV RNase H inhibitors". Nucleic Acids Res. 31 (23): 6852–9. doi:10.1093/nar/gkg881. PMC 290251. PMID 14627818. 

وصلات اضافية[عدل]