ميتاسيك

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
اذهب إلى: تصفح، ‏ ابحث
MetaCyc
قاعدة بيانات ميتاسيك
MetaCyc.png
عنوان الموقع metacyc.org
نوع الموقع قاعدة بيانات للمسارات الأيضية
مالك معهد أبحاث ستانفورد الدولي (en)
أنشأه رون كاسبي
تاريخ الإطلاق 2009


ميتاسيك (بالإنجليزية: MetaCyc) هي قاعدة بيانات تحتوي على معلومات شاملة عن المسارات الأيضية والإنزيمات من العديد من الكائنات الحية. ميتاسيك تخزن المسارات الأيضية الموصوفة تجريبياً.[1][2][3]

يمكن أن تكون ميتاسيك بمثابة البيانات المرجعية المحددة للمسارات الأيضية المتوقعة حسابياً لكائنات حية من تسلسل الجينوم الخاص بها، واستخدمت لتنبؤ مسار الآلاف من الكائنات الحية، بما في ذلك تلك الموجودة في مجموعة قاعدة معطيات BioCyc.

تحتوي ميتاسيك على بيانات واسعة النطاق على لكل إنزيم، لتصف بنية وحداته الثانوية والعوامل المساعدة المحفزات والمثبطات خصوصية الركيزة وفي بعض الحالات الثوابت الحركية. كما يوفر مراجع التعليق والمصادر.

المصادر[عدل]

  1. ^ Caspi R, Altman T, Dale JM, Dreher K, Fulcher CA, Gilham F, Kaipa P, Karthikeyan AS, Kothari A, Krummenacker M, Latendresse M, Mueller LA, Paley S, Popescu L, Pujar A, Shearer AG, Zhang P, Karp PD (January 2010). "The MetaCyc database of metabolic pathways and enzymes and the BioCyc collection of pathway/genome databases". Nucleic Acids Res. 38 (Database issue): D473–9. doi:10.1093/nar/gkp875. PMC 2808959. PMID 19850718. 
  2. ^ "MetaCyc Publications". 
  3. ^ Karp PD, Caspi R (September 2011). "A survey of metabolic databases emphasizing the MetaCyc family". Arch. Toxicol. 85 (9): 1015–33. doi:10.1007/s00204-011-0705-2. PMC 3352032. PMID 21523460. 

روابط خارجية[عدل]