سودويوريدين

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
اذهب إلى التنقل اذهب إلى البحث
سودويوريدين
سودويوريدين

الاسم النظامي (IUPAC)

5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione

التسمية المفضلة للاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية

5-(β-D-ribofuranosyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione

أسماء أخرى

psi-Uridine, 5-Ribosyluracil, beta-D-Pseudouridine, 5-(beta-D-Ribofuranosyl)uracil

المعرفات
رقم CAS 1445-07-4 ☒N
بوب كيم (PubChem) 15047

الخواص
صيغة جزيئية C9H12N2O6
الكتلة المولية 244.20 g/mol
المظهر مسحوق حُبَيبي أبيض.
الذوبانية في ماء شديد الذوبان في الماء.
في حال عدم ورود غير ذلك فإن البيانات الواردة أعلاه معطاة بالحالة القياسية (عند 25 °س و 100 كيلوباسكال)

السودويوريدين (بالإنجليزية: Pseudouridine ) ويختصر بالرمز الإغريقي بسي Ψ [1] هو مماكب نوكليوسيد اليوريدين تكون فيه قاعدة اليوراسيل مرتبطة بالريبوز عن طريق رابطة كربون-كربون بدل الرابطة الغليكوسيدية نيتروجين-كربون (يسمى أحيانا اليوراسيل في هذا التركيب سودويوراسيل) وهو أكثر النوكليوسيدات المعدلة انتشارا من بين المئات الموجودة في الحمض النووي الريبوزي [2]. يوجد Ψ في جميع الأجناس وفي العديد من أنواع الرنا [3][4] [5][6] ويتم إنتاجه بواسطة إنزيم يسمى Ψ سينثاز الذي يماكب نوكليوسيدات يوريدين محددة أثناء تعديلات ما بعد النسخ في عملية تسمى السودويوريدينلة (pseudouridylation) [7]. تم حتى الآن تحديد حوالي 9500 تعديل سودويوريدين (Ψ) لدى الثديات والخميرة وتم وضعها في قاعدة بيانات RMBase.[8]

يتم اصطناع السودويوريدين حيويا بواسطة Ψ سينثاز.

يتواجد عادة في الرنا الناقل مرتبطا مع الثيميدين والسايتوسين في الذراه TΨC وهو أحد مناطق الرنا الناقل غير المتغيرة، وظيفته غير واضحة تماما لكن يُتوقع لعبه دورا مع أمينوسيكل ترانسفيراز أثناء تفاعلهما مع الرنا الناقل ومنه ابتداء الترجمة، تقترح دراسات حديثة أنه يمنح حماية ضد الإشعاعات [9].

الرنا الناقل للألانين لدى السكيراء الجعوية.
Ψ = سودويوريدين

مراجع[عدل]

  1. ^ IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature (1970). "Abbreviations and symbols for nucleic acids, polynucleotides, and their constituents". Biochemistry. 9 (20): 4022–4027. PMC 1179624Freely accessible. PMID 5499957. doi:10.1021/bi00822a023. 
  2. ^ Hamma T، Ferré-D'Amaré AR (2006). "Pseudouridine synthases". Chem. Biol. 13 (11): 1125–1135. PMID 17113994. doi:10.1016/j.chembiol.2006.09.009. 
  3. ^ Charette M، Gray MW (2000). "Pseudouridine in RNA: what, where, how, and why". IUBMB Life. 49 (5): 341–351. PMID 10902565. doi:10.1080/152165400410182. 
  4. ^ Liang XH، Xu YX، MIchaeli S (2002). "The spliced leader-associated RNA is a trypanosome-specific sn(o) RNA that has the potential to guide pseudouridine formation on the SL RNA". RNA. 8 (2): 237–246. PMC 1370245Freely accessible. PMID 11911368. doi:10.1017/S1355838202018290. 
  5. ^ Carlile، Thomas (2014-09-05). "Pseudouridine profiling reveals regulated mRNA pseudouridylation in yeast and human cells". نيتشر (مجلة). 515: 143–6. PMC 4224642Freely accessible. PMID 25192136. doi:10.1038/nature13802. 
  6. ^ Schwartz، Schraga (2014-09-11). "Transcriptome-wide Mapping Reveals Widespread Dynamic-Regulated Pseudouridylation of ncRNA and mRNA". Cell. 159: 148–62. PMC 4180118Freely accessible. PMID 25219674. doi:10.1016/j.cell.2014.08.028. 
  7. ^ Ferré-D'Amaré AR (2003). "RNA-modifying enzymes". Curr. Opin. Struct. Biol. 13 (1): 49–55. PMID 12581659. doi:10.1016/S0959-440X(02)00002-7. 
  8. ^ Sun، WJ؛ Li، JH؛ Liu، S؛ Wu، J؛ Zhou، H؛ Qu، LH؛ Yang، JH (4 January 2016). "RMBase: a resource for decoding the landscape of RNA modifications from high-throughput sequencing data.". Nucleic Acids Research. 44 (D1): D259–65. PMC 4702777Freely accessible. PMID 26464443. doi:10.1093/nar/gkv1036. 
  9. ^ Monobe, Manami؛ Arimoto-Kobayashi, Sakae؛ Ando, Koichi (2003). "β-Pseudouridine, a beer component, reduces radiation-induced chromosome aberrations in human lymphocytes". Mutation Research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis. 538 (1–2): 93–99. PMID 12834758. doi:10.1016/S1383-5718(03)00094-9. 
Nuvola apps edu science.svg
هذه بذرة مقالة عن الكيمياء بحاجة للتوسيع. شارك في تحريرها.