ORF9b: الفرق بين النسختين
فيروس كورونا |
(لا فرق)
|
نسخة 00:43، 12 يناير 2022
| بروتين فيروس كورونا بيتا المرتبط بالليبيد | |
|---|---|
| |
| بنية علم البلورات السيني لمثنوي بروتين ORF9b الخاص بسارس-كوف، تُظهر جزيء الليبيد في التجويف المركزي (أصفر). من ببب: 2CME.[1] | |
| معرف | |
| رمز | bCoV_lipid_BD |
| قاعدة بيانات عوائل البروتينات | PF09399 |
| إنتربرو | IPR018542 |
ORF9b (سمي سابقا في بعض الأحيان ORF13) هو جين يشفر بروتينا ملحقا في جُنيس فيروسات كورونا البائية السارسية (Sarbecovirus) الذي يشمل سارس-كوف وسارس-كوف-2. وهو جين متداخل إطار القراءة المفتوح الخاص به مضمن كليا في جين بروتين القفيصة النووية لفيروس كورونا.[2][3][4] طول البروتين الناتج منه 97 حمض أميني في سارس-كوف[2][3] و98 حمض أميني في سارس-كوف-2 وفي كلا الفيروسين ييشكل مثنوي بروتين.
التسمية
كان هنالك عدم تواقف في المنشورات العلمية حول التسمية المستخدمة للإشارة إلى هذا الجين. أُشيرإليه في بعض الأعمال حول سارس-كوف بالـORF13. وأُشير إليه أحيانا بـORF9a وهو ما نتج عنه تسمية إطار آخر مع الاتجاه طوله 76 كودونا في سارس كوف بـORF9b والذي يتداخل كذلك مع جين القفيصة النووية. التسمية الموصى بها تشير إلى الإطار الأكبر بـORF9b وإلى الإطار الأصغر مع الاتجاه بـORF9c.[5]
البنية
التعبير والتموقع
الوظيفة
مراجع
- ^ Meier، Christoph؛ Aricescu، A. Radu؛ Assenberg، Rene؛ Aplin، Robin T.؛ Gilbert، Robert J.C.؛ Grimes، Jonathan M.؛ Stuart، David I. (يوليو 2006). "The Crystal Structure of ORF-9b, a Lipid Binding Protein from the SARS Coronavirus". Structure. ج. 14 ع. 7: 1157–1165. DOI:10.1016/j.str.2006.05.012. PMC:7126280. PMID:16843897.
- ^ أ ب Liu، Ding Xiang؛ Fung، To Sing؛ Chong، Kelvin Kian-Long؛ Shukla، Aditi؛ Hilgenfeld، Rolf (سبتمبر 2014). "Accessory proteins of SARS-CoV and other coronaviruses". Antiviral Research. ج. 109: 97–109. DOI:10.1016/j.antiviral.2014.06.013. PMC:7113789. PMID:24995382.
- ^ أ ب McBride، Ruth؛ Fielding، Burtram (7 نوفمبر 2012). "The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus Pathogenesis". Viruses. ج. 4 ع. 11: 2902–2923. DOI:10.3390/v4112902. PMC:3509677. PMID:23202509.
- ^ Redondo، Natalia؛ Zaldívar-López، Sara؛ Garrido، Juan J.؛ Montoya، Maria (7 يوليو 2021). "SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns". Frontiers in Immunology. ج. 12: 708264. DOI:10.3389/fimmu.2021.708264. PMC:8293742. PMID:34305949.
- ^ Jungreis، Irwin؛ Nelson، Chase W.؛ Ardern، Zachary؛ Finkel، Yaara؛ Krogan، Nevan J.؛ Sato، Kei؛ Ziebuhr، John؛ Stern-Ginossar، Noam؛ Pavesi، Angelo؛ Firth، Andrew E.؛ Gorbalenya، Alexander E.؛ Kellis، Manolis (يونيو 2021). "Conflicting and ambiguous names of overlapping ORFs in the SARS-CoV-2 genome: A homology-based resolution". Virology. ج. 558: 145–151. DOI:10.1016/j.virol.2021.02.013. PMC:7967279. PMID:33774510.
