فولدكس بروتين

هو خوارزمية تصميم البروتين الذي يستخدم في مجال القوة التجريبية.^[1] يستطيع ان يحدد التأثير الحيوي للطفرات النقطية وطاقة التفاعل بين مركبات البروتين (بما فيها بروتين الحمض النووي)

فولدكس يستطيع تحويل السلاسل الجانبية للبروتين والحمض النووي باستخدام مكتبة روتامير التي تكون قائمة على الاحتمالات مع استكشاف المطابقات البديلة للسلاسل الجانبية المحيطة.^[2]^[3]

المراجع[عدل]

^ Guerois، Raphael؛ Nielsen، Jens Erik؛ Serrano، Luis (5 يوليو 2002). "Predicting changes in the stability of proteins and protein complexes: a study of more than 1000 mutations". Journal of Molecular Biology. ج. 320 ع. 2: 369–387. DOI:10.1016/S0022-2836(02)00442-4. ISSN:0022-2836. PMID:12079393. مؤرشف من الأصل في 2022-10-28.
^ Schymkowitz, J.; Borg, J.; Stricher, F.; Nys, R.; Rousseau, F.; Serrano, L. (1 Jul 2005). "The FoldX web server: an online force field". Nucleic Acids Research (بالإنجليزية). 33 (Web Server): W382–W388. DOI:10.1093/nar/gki387. ISSN:0305-1048. PMC:1160148. PMID:15980494. Archived from the original on 2023-06-12.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: تنسيق PMC (link)
^ Schymkowitz، Joost W. H.؛ Rousseau، Frederic؛ Martins، Ivo C.؛ Ferkinghoff-Borg، Jesper؛ Stricher، Francois؛ Serrano، Luis (19 يوليو 2005). "Prediction of water and metal binding sites and their affinities by using the Fold-X force field". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 102 ع. 29: 10147–10152. DOI:10.1073/pnas.0501980102. ISSN:0027-8424. PMC:1177371. PMID:16006526. مؤرشف من الأصل في 2022-08-08.

بوابة خوارزميات

هذه بذرة مقالة عن الحاسوب أو العاملين في هذا المجال، بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[1] Guerois، Raphael؛ Nielsen، Jens Erik؛ Serrano، Luis (5 يوليو 2002). "Predicting changes in the stability of proteins and protein complexes: a study of more than 1000 mutations". Journal of Molecular Biology. ج. 320 ع. 2: 369–387. DOI:10.1016/S0022-2836(02)00442-4. ISSN:0022-2836. PMID:12079393. مؤرشف من الأصل في 2022-10-28.

[2] Schymkowitz, J.; Borg, J.; Stricher, F.; Nys, R.; Rousseau, F.; Serrano, L. (1 Jul 2005). "The FoldX web server: an online force field". Nucleic Acids Research (بالإنجليزية). 33 (Web Server): W382–W388. DOI:10.1093/nar/gki387. ISSN:0305-1048. PMC:1160148. PMID:15980494. Archived from the original on 2023-06-12.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: تنسيق PMC (link)

[3] Schymkowitz، Joost W. H.؛ Rousseau، Frederic؛ Martins، Ivo C.؛ Ferkinghoff-Borg، Jesper؛ Stricher، Francois؛ Serrano، Luis (19 يوليو 2005). "Prediction of water and metal binding sites and their affinities by using the Fold-X force field". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 102 ع. 29: 10147–10152. DOI:10.1073/pnas.0501980102. ISSN:0027-8424. PMC:1177371. PMID:16006526. مؤرشف من الأصل في 2022-08-08.

[1]

[2]

[3]