انتقل إلى المحتوى

الأنواع الفرعية لفيروس العوز المناعي البشري: الفرق بين النسختين

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
This article was translated by I Believe in Science & Ideas beyond borders & Beit al Hikma 2.0
(لا فرق)

نسخة 01:52، 11 ديسمبر 2019

يشكّل التنوع الجيني الكبير لفيروس العوز المناعي البشري عقبة في علاجه.[1] يمكن تقسيم الفيروس إلى نوعين رئيسيّين، إتش آي في النوع الأوّل (إتش آي في 1) وإتش آي في النوع الثاني (إتش آي في 2). يرتبط إتش آي في 1 بالفيروسات الموجودة عند الشيمبانزي والغوريلا القاطنة في أفريقيا الغربيّة، بينما يرتبط إتش أي في 2 بالفيروسات الموجودة بشكل رئيسيّ عند منجبي أسخم المهددة للانقراض في جنوب أفريقيا.[2] يمكن تقسيم إتش آي في 1 إلى مجموعات أكثر. تكوّن المجموعة إم من إتش آي في 1 المسيطرة والمسؤولة عن جائحة الإيدز. يمكن تجزيء المجموعة إم إلى أنواع فرعيّة أكثر حسب بيانات التسلسل الجينيّ. تُعرف بعض الأنواع الفرعيّة بفوعتها العالية (الحدّة الجرثوميّة) أو بمقاومتها لمعالجاتٍ مختلفة. وكذلك، يُعتقد أن فيروسات إتش آي في 2 أقل خبثًا وقدرة على الانتقال من المجموعة إم لإتش آي في 1، على الرغم من معرفة أن الإتش آي في 2 هو المسبّب للإيدز.

الأنواع الرئيسيّة

إتش آي فشي 1

هو السلالة الأكثر شيوعًا وإمراضًا من الفيروس. يقسّم العلماء إتش أي في 1 إلى مجموعة رئيسيّة (المجموعة إم) ومجموعتين فرعيّتين أو أكثر، هما المجموعة إن وأو وربّما المجموعة بّي. يُعتقد أن كل مجموعة تمثل ناقل مستقل لفيروس العَوَز المناعيّ القرديّ (إس أي في) إلى البشر (ولكنّ الأنواع الفرعيّة ضمن المجموعة ليست كذلك). بلغ مجموع قوالب القراءة المفتوحة 39 في أُطر القراءة الستّة جميعها لمتوالية الجينوم الكاملة للإتش آي في 1، ولكنّ عددًا قليلًا منها فقط وظيفي.[3]

المجموعة إم

«إم» من «major الرئيسي»، هي المجموعة الأكثر شيوعًا من أنماط الإتش آي في على الإطلاق، فأكثر من 90% من حالات الإيدز/إتش آي في تعود إلى الإنتان بالمجموعة إم لإتش آي في 1. بدأ فيروس الإتش آي في الرئيسي هذا والذي هو مصدر الجائحات الفيروسيّة لما قبل 1960  في عشرينيّات القرن العشرين في ليوبولدفيل في كونغو البلجيكية، والمعروفة حاليًا بكينشاسا، عاصمة جمهوريّة كونغو الديمقراطية (دي أر سي) حاليًا.[4] تُجزئ المجموعة إم إلى فروعٍ حيويّةٍ أكثر، تُدعى الأنواع الفرعيّة، والتي تُعطى أيضًا حرفًا. يوجد أيضًا «أشكالًا مأشوبة جائلة» أو «سي أر إفز» مشتقّةً من تأشّب أنواعٍ فرعية مختلفة من الفيروسات تُعطى كلّ واحدة منها رقمًا. فعلى سبيل المثال، سي أر إف 12_بي إف (CRF12_BF) هو التأشّب بين الأنواع الفرعيّة لإف وبي.

  • يكون النوع الفرعيّ إيه شائعًا في أفريقيا الشرقيّة.[5]
  • يكون النوع الفرعيّ بي الشكل المسيطر في أوروبا، والأميركيّتين، واليابان، وأستراليا. بالإضافة لذلك، يكون النوع الفرعيّ بي الشكل الأكثر شيوعًا في الشرق الأوسط وشمال أفريقيا. انتقل من أفريقيا عندما زار المهنيون الهاييتيّون كينشاسا في ستينيّات القرن العشرين وجلبوه إلى هاييتي في عام 1964.[6]
  • يكون النوع الفرعيّ سي الشكل المسيطر في أفريقيا الجنوبيّة، وأفريقيا الشرقيّة، والهند، ونيبال، وأجزاء من الصين.[7]
  • يُرى النوع الفرعيّ دي بشكلٍ عام فقط في أفريقيا الوسطى والشرقيّة.
  • يوجد النوع الفرعيّ إي في جنوب شرق آسيا وهو الشكل المسيطر عند متغايري الجنس ومن حيث معدّل الانتقال هو أعلى بكثير من الأنماط الفرعيّة الأخرى.
  • يوجد النوع الفرعيّ إف في أفريقيا الوسطى، وجنوب أميركا، وأوروبا الغربية.[8]
  • يوجد النوع الفرعيّ جي (وسي أر إف 2 0_أيه جي CRF02_AG) في أفريقيا وأوروبا الوسطى.
  • يكون النوع الفرعيّ إتش محدودًا في أفريقيا الوسطى.[9]
  • استُخدم النوع الفرعيّ آي لوصف سلالة تُمثّل بسي أر إف 0 4 _ سي بي إكس (CRF04_cpx)،  مع cpx لتأشب «معقد» لأنواع فرعيّة متعدّدة.
  • يوجد النوع الفرعيّ جاي بشكل رئيسي في شمال ووسط وغرب أفريقيا،  والكاريبي.
  • يكون النوع الفرعيّ كي محدودًا في جمهوريّة كونغو الديمقراطيّة والكاميرون.
  • يكون النوع الفرعيّ إل محدودًا في جمهوريّة كونغو الديمقراطيّة.[10]

انتقلت هذه الأنواع الفرعيّة بفضل حركتها الفراغيّة على طول السكك الحديديّة والممرات المائيّة لجمهوريّة كونغو الديمقراطيّة قادمة من كينشاسا نحو هذه المناطق الأخرى. تنقسم هذه الأنواع الفرعيّة في بعض الأوقات إلى المزيد من الأنواع تحت الفرعيّة مثل إيه 1 وإيه 2 أو إف 1 وإف 2. في عام 2015، وُجد ارتباطٌ قويّ للسلالة سي أر إف 19، وهي النوع الفرعيّ إيه والنوع الفرعيّ دي والنوع الفرعي جي  المؤشبة مع ببتيداز النوع الفرعيّ دي، مع تقدم الإيدز السريع في كوبا. يُعتقد أن هذه القائمة ليست كاملة أو نهائية، ومن المتوقع إيجاد أنواع اكثر.[11]

المجموعة إن

ترمز إن إلى «بلا إم وبلا أو». اكتشف هذه المجموعة فريق فرانكو كاميرونيّ في عام 1998، عندما  حدّدوا وعزلوا السلالة المتغايرة لإتش آي في 1، والتي هي واي بي إف 380 (YBF380)، من امرأة كاميرونيّة ماتت بالإيدز في عام 1995. عندما أجروا الاختبارات، تفاعل واي بي إف 380 المتغاير مع مستضدّ غلافي من إس آي في سي بّي زيد (SIVcpz) بدلًا من تلك المجموعات إم وأو، ما يشير إلى أنّها بالفعل سلالة جديدة للإتش آي في 1. وحسب 2015، سُجّل أقل من 20 إنتان للمجموعة إن.[12]

المجموعة أو

أصابت المجموعة أو («الشاذّة» نحو 100.000 شخص بالعدوى من القاطنين في غرب وسط أفريقيا ولا تُشاهد عادةً خارج هذه المنطقة. وهي أكثر شيوعًا في الكاميرون حسب المعلومات، حيث وجد مسحٌ في عام 1997 أن 2% من العينات إيجابيّة الإتش آي في تعود للمجموعة أو. سبّب هذا الفيروس بعض القلق لأنّه لم يكن من الممكن كشفه من خلال الإصدارات الباكرة لمجموعة اختبارات إتش آي في 1. طُوّرت الآن اختبارات إتش آي في متقدّمة لكشف المجموعتين أو وإن.[13]

المجموعة بّي

في عام 2009، أبلغ استقصاء جديد عن متتالية لإتش آي في تملك تشابهًا كبيرًا مع فيروس العوز المناعي القردي المكتشف مؤخرًا عند الغوريلا  أكثر من فيروس العوز المناعي القردي عند الشيمبانزي. عُزل الفيروس من امرأة كاميرونية مقيمة في فرنسا مشخصة بإنتان بالإتش آي في 1 في عام 2004. وضعها العلماء االمبلغين عن هذه المتتالية في مجموعة بّي المقترحة «بانتظار تحديد حالات أكثر عند البشر».[14][15][16]

إتش أي في 2

لم يُعرف انتشار لإتش آي في 2 خارج أفريقيا. ظهرت أول حالة في الولايات المتّحدة في عام 1987. يمكن للعديد من مجموعات اختبار الإتش آي في 1 الكشف عن الإتش آي في 2.[17]

وحسب عام 2010، يوجد ثمانية مجموعات معروفة للإتش آي في 2 (من إيه إلى إتش). تشكل فقط إيه وبي من هذه المجموعات جائحة. وُجدت المجموعة إيه بشكل رئيسي في غرب أفريقيا، ولكنّها انتشرت عالميًا إلى أنغولا، وموزمبيق، والبرازيل، والهند، وأوروبا، والولايات المتّحدة الأميركيّة. وعلى الرغم من الوجود العالمي للإتش آي في 2، تقتصر المجموعة بي بشكل رئيسيّ على غرب أفريقيا. ورغم انحصاره النسبيّ، يجب ان يُؤخذ الإتش آي في 2 بعين الاعتبار عند كل المرضى المطوّرين أعراضًا للإتش آي في وليس فقط القادمين من غرب أفريقيا، بل أيّ شخص تعرض لتماسٍّ مع سوائل جسم عند شخص من غرب أفريقيا (أي مشاركة إبرة، أو اتصال جنسي، الخ..).[18]

يرتبط إتش آي في 2 بشكل وثيق بفيروس العَوَز المناعيّ القرديّ المستوطن عند منجبي أسخم، وهم من أنواع القرود القاطنين في غابات ايتورال غرب أفريقيا. تظهر تحاليل التطوّر السلالي أنّ الفيروس الأكثر ارتباطًا بسلالتين من الإتش آي في 2 المنتشرة كثيرًا عند البشر (مجموعات الإتش آي في 2 إيه وبي) هو فيروس عَوَز المناعة القرديّ الموجود عند منجبي أسخم غابات تاي، في ساحل العاج الغربيّ.[19]

المراجع

  1. ^ Robertson DL، Hahn BH، Sharp PM (مارس 1995). "Recombination in AIDS viruses". Journal of Molecular Evolution. ج. 40 ع. 3: 249–59. Bibcode:1995JMolE..40..249R. DOI:10.1007/BF00163230. PMID:7723052.
  2. ^ Sharp PM، Hahn BH (سبتمبر 2011). "Origins of HIV and the AIDS pandemic". Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. ج. 1 ع. 1: a006841. DOI:10.1101/cshperspect.a006841. PMC:3234451. PMID:22229120.
  3. ^ Dhar¹, D. V., Amit, P., & Kumar, M. S. (2012). “In-Silico Identification of New Genes in HIV-1 by ORF Prediction Method”. I. Res. J. Biological Sci., 1(7), 52–54
  4. ^ Faria NR، Rambaut A، Suchard MA، Baele G، Bedford T، Ward MJ، Tatem AJ، Sousa JD، Arinaminpathy N، Pépin J، Posada D، Peeters M، Pybus OG، Lemey P (أكتوبر 2014). "HIV epidemiology. The early spread and epidemic ignition of HIV-1 in human populations". Science. ج. 346 ع. 6205: 56–61. Bibcode:2014Sci...346...56F. DOI:10.1126/science.1256739. PMC:4254776. PMID:25278604.
  5. ^ Bobkov AF، Kazennova EV، Selimova LM، Khanina TA، Ryabov GS، Bobkova MR، Sukhanova AL، Kravchenko AV، Ladnaya NN، Weber JN، Pokrovsky VV (أكتوبر 2004). "Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A". Journal of Medical Virology. ج. 74 ع. 2: 191–96. DOI:10.1002/jmv.20177. PMID:15332265. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |displayauthors= تم تجاهله يقترح استخدام |إظهار المؤلفين= (مساعدة)
  6. ^ Goudsmit J (1997). Viral Sex; The Nature of AIDS. New York: Oxford University Press. ص. 51–58.
  7. ^ Goudsmit J (1997). Viral Sex; The Nature of AIDS. New York: Oxford University Press. ص. 51–58.
  8. ^ "Introduction to HIV types, groups and subtypes". 3 مارس 2008. مؤرشف من الأصل في 2008-09-13. اطلع عليه بتاريخ 2008-05-25.
  9. ^ "First New HIV Strain in 19 Years Identified".
  10. ^ HIV types, subtypes, groups & strains
  11. ^ Kouri V، Khouri R، Alemán Y، Abrahantes Y، Vercauteren J، Pineda-Peña AC، Theys K، Megens S، Moutschen M، Pfeifer N، Van Weyenbergh J، Pérez AB، Pérez J، Pérez L، Van Laethem K، Vandamme AM (مارس 2015). "CRF19_cpx is an Evolutionary fit HIV-1 Variant Strongly Associated With Rapid Progression to AIDS in Cuba". EBioMedicine. ج. 2 ع. 3: 244–54. DOI:10.1016/j.ebiom.2015.01.015. PMC:4484819. PMID:26137563.
  12. ^ D'arc M، Ayouba A، Esteban A، Learn GH، Boué V، Liegeois F، Etienne L، Tagg N، Leendertz FH، Boesch C، Madinda NF، Robbins MM، Gray M، Cournil A، Ooms M، Letko M، Simon VA، Sharp PM، Hahn BH، Delaporte E، Mpoudi Ngole E، Peeters M (مارس 2015). "Origin of the HIV-1 group O epidemic in western lowland gorillas". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 112 ع. 11: E1343–52. Bibcode:2015PNAS..112E1343D. DOI:10.1073/pnas.1502022112. PMC:4371950. PMID:25733890.
  13. ^ "Archived copy" (PDF). مؤرشف من الأصل (PDF) في 2007-09-21. اطلع عليه بتاريخ 2008-05-18.{{استشهاد ويب}}: صيانة الاستشهاد: الأرشيف كعنوان (link)
  14. ^ Plantier JC، Leoz M، Dickerson JE، De Oliveira F، Cordonnier F، Lemée V، Damond F، Robertson DL، Simon F (أغسطس 2009). "A new human immunodeficiency virus derived from gorillas". Nature Medicine. ج. 15 ع. 8: 871–72. DOI:10.1038/nm.2016. PMID:19648927.
  15. ^ "New HIV strain discovered". Associated Press. CBC News. 3 أغسطس 2009. اطلع عليه بتاريخ 2009-08-03.
  16. ^ McNeil DG (16 سبتمبر 2010). "Precursor to H.I.V. Was in Monkeys for Millennia". New York Times. اطلع عليه بتاريخ 2010-09-17. But P appears to have crossed over from a gorilla; it was discovered only last year, and in only one woman, who was from Cameroon, where lowland gorillas are hunted for meat.
  17. ^ CBER – Donor Screening Assays for Infectious Agents and HIV Diagnostic Assays
  18. ^ Santiago ML، Range F، Keele BF، Li Y، Bailes E، Bibollet-Ruche F، Fruteau C، Noë R، Peeters M، Brookfield JF، Shaw GM، Sharp PM، Hahn BH (أكتوبر 2005). "Simian immunodeficiency virus infection in free-ranging sooty mangabeys (Cercocebus atys atys) from the Taï Forest, Côte d'Ivoire: implications for the origin of epidemic human immunodeficiency virus type 2". Journal of Virology. ج. 79 ع. 19: 12515–27. DOI:10.1128/JVI.79.19.12515-12527.2005. PMC:1211554. PMID:16160179.
  19. ^ Santiago ML، Range F، Keele BF، Li Y، Bailes E، Bibollet-Ruche F، Fruteau C، Noë R، Peeters M، Brookfield JF، Shaw GM، Sharp PM، Hahn BH (أكتوبر 2005). "Simian immunodeficiency virus infection in free-ranging sooty mangabeys (Cercocebus atys atys) from the Taï Forest, Côte d'Ivoire: implications for the origin of epidemic human immunodeficiency virus type 2". Journal of Virology. ج. 79 ع. 19: 12515–27. DOI:10.1128/JVI.79.19.12515-12527.2005. PMC:1211554. PMID:16160179.