ORF9c: الفرق بين النسختين
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
فيروس كورونا |
(لا فرق)
|
نسخة 04:37، 14 يناير 2022
| بروتين فيروس كورونا غير الموصوف 14 | |
|---|---|
| معرف | |
| رمز | bCoV_Orf14 |
| قاعدة بيانات عوائل البروتينات | PF17635 |
| إنتربرو | IPR035113 |
ORF9c (ويسمى كذلك ORF14) هو إطار قراءة مفتوح (ORF) في جُنيس فيروسات كورونا البائية السارسية (Sarbecovirus).[1] طوله 73 كودون في جينوم سارس-كوف-2.[2] رغم أنه مضمن في قائمة جينات البروتينات الملحقة الخاصة بالفيروسات السارسية، إلا أن دلائل من المعلوماتية الحيوية تقترح بأن الـORF9c قد لا يكون جينا مشفرا لبروتين وظيفي.[3]
التسمية
كان هنالك عدم توافق في التسمية المستخدمة لهذا الجين في المنشورات العلمية. أُشير إليه في بعض الأبحاث حول سارس-كوف بالاسم ORF14.[4] وسمي في بعض الأحيان ORF9b، بينما جاره الطويل ORF9b المتواجد عكس الاتجاه سُمي ORF9a. التسمية الحالية الموصى بها هي أن يُشار إلى هذا الجين بـORF9c وللجين الموجود عكس الاتجاه بـORF9b.[2]
التعبير والتآثرات
التطور
مراجع
- ^ Redondo، Natalia؛ Zaldívar-López، Sara؛ Garrido، Juan J.؛ Montoya، Maria (7 يوليو 2021). "SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns". Frontiers in Immunology. ج. 12: 708264. DOI:10.3389/fimmu.2021.708264. PMC:8293742. PMID:34305949.
{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ أ ب Jungreis، Irwin؛ Nelson، Chase W.؛ Ardern، Zachary؛ Finkel، Yaara؛ Krogan، Nevan J.؛ Sato، Kei؛ Ziebuhr، John؛ Stern-Ginossar، Noam؛ Pavesi، Angelo؛ Firth، Andrew E.؛ Gorbalenya، Alexander E.؛ Kellis، Manolis (يونيو 2021). "Conflicting and ambiguous names of overlapping ORFs in the SARS-CoV-2 genome: A homology-based resolution". Virology. ج. 558: 145–151. DOI:10.1016/j.virol.2021.02.013. PMC:7967279. PMID:33774510.
- ^ Jungreis، Irwin؛ Sealfon، Rachel؛ Kellis، Manolis (ديسمبر 2021). "SARS-CoV-2 gene content and COVID-19 mutation impact by comparing 44 Sarbecovirus genomes". Nature Communications. ج. 12 ع. 1: 2642. DOI:10.1038/s41467-021-22905-7. PMC:8113528.
- ^ Marra، Marco A.؛ Jones، Steven J. M.؛ Astell، Caroline R.؛ Holt، Robert A.؛ Brooks-Wilson، Angela؛ Butterfield، Yaron S. N.؛ Khattra، Jaswinder؛ Asano، Jennifer K.؛ Barber، Sarah A.؛ Chan، Susanna Y.؛ Cloutier، Alison؛ Coughlin، Shaun M.؛ Freeman، Doug؛ Girn، Noreen؛ Griffith، Obi L.؛ Leach، Stephen R.؛ Mayo، Michael؛ McDonald، Helen؛ Montgomery، Stephen B.؛ Pandoh، Pawan K.؛ Petrescu، Anca S.؛ Robertson، A. Gordon؛ Schein، Jacqueline E.؛ Siddiqui، Asim؛ Smailus، Duane E.؛ Stott، Jeff M.؛ Yang، George S.؛ Plummer، Francis؛ Andonov، Anton؛ Artsob، Harvey؛ Bastien، Nathalie؛ Bernard، Kathy؛ Booth، Timothy F.؛ Bowness، Donnie؛ Czub، Martin؛ Drebot، Michael؛ Fernando، Lisa؛ Flick، Ramon؛ Garbutt، Michael؛ Gray، Michael؛ Grolla، Allen؛ Jones، Steven؛ Feldmann، Heinz؛ Meyers، Adrienne؛ Kabani، Amin؛ Li، Yan؛ Normand، Susan؛ Stroher، Ute؛ Tipples، Graham A.؛ Tyler، Shaun؛ Vogrig، Robert؛ Ward، Diane؛ Watson، Brynn؛ Brunham، Robert C.؛ Krajden، Mel؛ Petric، Martin؛ Skowronski، Danuta M.؛ Upton، Chris؛ Roper، Rachel L. (30 مايو 2003). "The Genome Sequence of the SARS-Associated Coronavirus". Science. ج. 300 ع. 5624: 1399–1404. DOI:10.1126/science.1085953.
