ذاكرة النسخ: الفرق بين النسختين

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
أُنشئَت بترجمة الصفحة "Transcriptional memory"
(لا فرق)

نسخة 20:57، 26 مارس 2023

مبدأ ذاكرة النسخ. ينتج عن نبضة محفز (فتيلة) التعبير عن الجينات المستهدفة ، والتي تنحسر عند الانسحاب. خلال فترة عدم الاستقراء (نافذة الذاكرة) ، تحافظ بعض الجينات على حالة متوازنة ولكنها صامتة نسبيًا مما ينتج عنه تنشيط جيني أقوى عند التحدي الثاني.

ذاكرة النسخ هي ظاهرة بيولوجية ، اكتُشفت في البداية في الخميرة ، [1] حيث تُظهر الخلايا التي تم تحضيرها بإشارة معينة معدلات متزايدة من التعبير الجيني بعد إعادة التنبيه في وقت لاحق. تم إثبات حدوث هذا الحدث: في الخميرة أثناء النمو في الجالاكتوز [1] [2] وتجويع الإينوزيتول ؛ [3] نباتات أثناء الإجهاد البيئي. [4] [5] [6] في خلايا الثدييات أثناء LPS [7] والإنترفيرون [8] [9] [10] الحث. أظهر العمل السابق أن بعض خصائص الكروماتين قد تساهم في حالة النسخ المتوازنة التي تسمح بإعادة الحث بشكل أسرع. وتشمل هذه: نشاط عوامل النسخ المحددة ، [11] [12] [13] الاحتفاظ بـ RNA polymerase II عند محفزات الجينات المتوازنة ، [9] نشاط معقدات إعادة تشكيل الكروماتين ، [2] انتشار H3K4me2 [8] [13] و H3K36me3 [10] تعديلات هيستون ، شغل متغير هيستون H3.3 ، [10] بالإضافة إلى ربط مكونات المسام النووية . [9] [14] علاوة على ذلك ، تبين أن cohesin المرتبط محليًا يمنع إنشاء ذاكرة النسخ في الخلايا البشرية أثناء تحفيز الإنترفيرون جاما . [15]

مراجع

  1. ^ أ ب Acar، Murat؛ Becskei، Attila؛ van Oudenaarden، Alexander (12 مايو 2005). "Enhancement of cellular memory by reducing stochastic transitions". Nature. ج. 435 ع. 7039: 228–232. Bibcode:2005Natur.435..228A. DOI:10.1038/nature03524. ISSN:1476-4687. PMID:15889097.
  2. ^ أ ب Kundu، Sharmistha؛ Horn، Peter J.؛ Peterson، Craig L. (15 أبريل 2007). "SWI/SNF is required for transcriptional memory at the yeast GAL gene cluster". Genes & Development. ج. 21 ع. 8: 997–1004. DOI:10.1101/gad.1506607. ISSN:0890-9369. PMID:17438002. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)
  3. ^ Brickner، Donna Garvey؛ Cajigas، Ivelisse؛ Fondufe-Mittendorf، Yvonne؛ Ahmed، Sara؛ Lee، Pei-Chih؛ Widom، Jonathan؛ Brickner، Jason H (أبريل 2007). "H2A.Z-Mediated Localization of Genes at the Nuclear Periphery Confers Epigenetic Memory of Previous Transcriptional State". PLOS Biology. ج. 5 ع. 4: e81. DOI:10.1371/journal.pbio.0050081. ISSN:1544-9173. PMID:17373856. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  4. ^ Ding، Yong؛ Fromm، Michael؛ Avramova، Zoya (يناير 2012). "Multiple exposures to drought 'train' transcriptional responses in Arabidopsis". Nature Communications. ج. 3 ع. 1: 740. Bibcode:2012NatCo...3..740D. DOI:10.1038/ncomms1732. ISSN:2041-1723. PMID:22415831.
  5. ^ Ding، Yong؛ Liu، Ning؛ Virlouvet، Laetitia؛ Riethoven، Jean-Jack؛ Fromm، Michael؛ Avramova، Zoya (2013). "Four distinct types of dehydration stress memory genes in Arabidopsis thaliana". BMC Plant Biology. ج. 13 ع. 1: 229. DOI:10.1186/1471-2229-13-229. ISSN:1471-2229. PMID:24377444. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  6. ^ Sani، Emanuela؛ Herzyk، Pawel؛ Perrella، Giorgio؛ Colot، Vincent؛ Amtmann، Anna (يونيو 2013). "Hyperosmotic priming of Arabidopsis seedlings establishes a long-term somatic memory accompanied by specific changes of the epigenome". Genome Biology. ج. 14 ع. 6: R59. DOI:10.1186/gb-2013-14-6-r59. ISSN:1474-760X. PMID:23767915. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  7. ^ Foster، Simmie L.؛ Hargreaves، Diana C.؛ Medzhitov، Ruslan (30 مايو 2007). "Gene-specific control of inflammation by TLR-induced chromatin modifications". Nature. ج. 447 ع. 7147: 972–978. Bibcode:2007Natur.447..972F. DOI:10.1038/nature05836. ISSN:0028-0836. PMID:17538624.
  8. ^ أ ب Gialitakis، M.؛ Arampatzi، P.؛ Makatounakis، T.؛ Papamatheakis، J. (15 أبريل 2010). "Gamma Interferon-Dependent Transcriptional Memory via Relocalization of a Gene Locus to PML Nuclear Bodies". Molecular and Cellular Biology. ج. 30 ع. 8: 2046–2056. DOI:10.1128/MCB.00906-09. ISSN:0270-7306. PMID:20123968. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)
  9. ^ أ ب ت Light، William H.؛ Freaney، Jonathan؛ Sood، Varun؛ Thompson، Abbey؛ D'Urso، Agustina؛ Horvath، Curt M.؛ Brickner، Jason H. (26 مارس 2013). "A Conserved Role for Human Nup98 in Altering Chromatin Structure and Promoting Epigenetic Transcriptional Memory". PLOS Biology. ج. 11 ع. 3: e1001524. DOI:10.1371/journal.pbio.1001524. ISSN:1545-7885. PMID:23555195. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  10. ^ أ ب ت Kamada، Rui؛ Yang، Wenjing؛ Zhang، Yubo؛ Patel، Mira C.؛ Yang، Yanqin؛ Ouda، Ryota؛ Dey، Anup؛ Wakabayashi، Yoshiyuki؛ Sakaguchi، Kazuyasu (10 سبتمبر 2018). "Interferon stimulation creates chromatin marks and establishes transcriptional memory". Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 115 ع. 39: E9162–E9171. DOI:10.1073/pnas.1720930115. ISSN:0027-8424. PMID:30201712. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)
  11. ^ D'Urso، Agustina؛ Takahashi، Yoh-Hei؛ Xiong، Bin؛ Marone، Jessica؛ Coukos، Robert؛ Randise-Hinchliff، Carlo؛ Wang، Ji-Ping؛ Shilatifard، Ali؛ Brickner، Jason H. (23 يونيو 2016). "Set1/COMPASS and Mediator are repurposed to promote epigenetic transcriptional memory". eLife. ج. 5. DOI:10.7554/eLife.16691. ISSN:2050-084X. PMID:27336723. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  12. ^ Sood، Varun؛ Cajigas، Ivelisse؛ D'Urso، Agustina؛ Light، William H.؛ Brickner، Jason H. (أغسطس 2017). "Epigenetic Transcriptional Memory of GAL Genes Depends on Growth in Glucose and the Tup1 Transcription Factor in Saccharomyces cerevisiae". Genetics. ج. 206 ع. 4: 1895–1907. DOI:10.1534/genetics.117.201632. ISSN:1943-2631. PMID:28607146. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)
  13. ^ أ ب Lämke، Jörn؛ Brzezinka، Krzysztof؛ Altmann، Simone؛ Bäurle، Isabel (18 يناير 2016). "A hit-and-run heat shock factor governs sustained histone methylation and transcriptional stress memory". The EMBO Journal. ج. 35 ع. 2: 162–175. DOI:10.15252/embj.201592593. ISSN:1460-2075. PMID:26657708. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)
  14. ^ Pascual-Garcia، Pau؛ Debo، Brian؛ Aleman، Jennifer R.؛ Talamas، Jessica A.؛ Lan، Yemin؛ Nguyen، Nha H.؛ Won، Kyoung J.؛ Capelson، Maya (6 أبريل 2017). "Metazoan Nuclear Pores Provide a Scaffold for Poised Genes and Mediate Induced Enhancer-Promoter Contacts". Molecular Cell. ج. 66 ع. 1: 63–76.e6. DOI:10.1016/j.molcel.2017.02.020. ISSN:1097-4164. PMID:28366641. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)
  15. ^ Siwek، Wojciech؛ Tehrani، Sahar S.H.؛ Mata، João F.؛ Jansen، Lars E.T. (نوفمبر 2020). "Activation of Clustered IFNγ Target Genes Drives Cohesin-Controlled Transcriptional Memory". Molecular Cell. ج. 80 ع. 3: 396–409.e6. DOI:10.1016/j.molcel.2020.10.005. ISSN:1097-2765. PMID:33108759. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |PMCID= تم تجاهله يقترح استخدام |pmc= (مساعدة)