انتقل إلى المحتوى

الساعه الفوق جينية: الفرق بين النسختين

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
[مراجعة غير مفحوصة][مراجعة غير مفحوصة]
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
JarBot (نقاش | مساهمات)
ط بوت:إزالة/إصلاح عنوان مرجع غير موجود (1)
سطر 4: سطر 4:


== التاريخ ==
== التاريخ ==
وقد عرفت التأثيرات القوية للعمر على مستويات مثيلية [[الحمض النووي]] منذ أواخر الستينات. <ref name="Berdyshev1967"/> وصفات واسعة تصف مجموعات من CpGs التي تربط مستويات مثيلية الحمض النووي مع العمر، على سبيل المثال <ref name="Rakyan2010"/><ref name="Teschendorff2010"/><ref name="Koch2011"/><ref name="Horvath2012"/><ref name="Bell2012"/> أول دليل قوي على أن مستويات المثيلة للحمض النووي في [[اللعاب]] يمكن أن تولد تنبؤات دقيقة للعمر تم نشره من قبل فريق UCLA بما في ذلك ستيف هورفاث في عام 2011 (Bocklandt et al 2011).<ref name="Forbes"/><ref name="Bocklandt2011" /> نشرت مختبرات [[تيري ادكير]](Trey Ideker) و Kang Zhang في [[جامعة كاليفورنيا]] في [[سان دييغو]] [[ساعة الهجن الوراثي]] (Hannum 2013) ، <ref name="Hannum2013" /> والتي تتكون من 71 علامة تحدد بدقة العمر بناءً على مستويات مثيلية الدم. أول ساعة جينية متعددة الأنسجة، هي ساعة هفث الجينية، طورها [[ستيف هورفاث]]، أستاذ [[علم الوراثة البشرية]] وعلم الإحصاء الحيوي في [[جامعة كاليفورنيا]] (Horvath 2013). <ref name="Horvath2013"/><ref name="ScienceDaily"/> قضى هورفاث أكثر من 4 سنوات في جمع البيانات الخاصة بالميثيلين الحمضي DNA المتاحة للجمهور وتحديد الطرق الإحصائية المناسبة. <ref name="Biome2013"/> القصة الشخصية وراء الاكتشاف ظهرت في الطبيعة. <ref name="Gibbs2014"/> تم تطوير مقدار العمر باستخدام 8000 عينة من 82 مجموعة من صفات مجموعة ميثيلنة DNA المميتة ، والتي تضم 51 نسيج ونمط خلوي سليم. يكمن الابتكار الرئيسي لساعة هفوث الفوق جينية في قابليتها للتطبيق: المجموعة نفسها من 353 CpGs ونفس خوارزمية التنبؤ تستخدم بغض النظر عن مصدر [[حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين]] في الكائن الحي، أي أنها لا تتطلب أي تعديلات أو تعويضات. <ref name="Gibbs2014"/> تسمح هذه الخاصية لشخص بمقارنة أعمار مناطق مختلفة من جسم الإنسان باستخدام نفس الساعة العجوز.
وقد عرفت التأثيرات القوية للعمر على مستويات مثيلية [[الحمض النووي]] منذ أواخر الستينات. <ref name="Berdyshev1967">{{cite journal | last1 = Berdyshev | first1 = G | last2 = Korotaev | first2 = G | last3 = Boiarskikh | first3 = G | last4 = Vaniushin | first4 = B | year = 1967 | title = Nucleotide composition of DNA and RNA from somatic tissues of humpback and its changes during spawning | url = | journal = Biokhimiia | volume = 31 | issue = | pages = 988–993 }}</ref> وصفات واسعة تصف مجموعات من CpGs التي تربط مستويات مثيلية الحمض النووي مع العمر، على سبيل المثال <ref name="Rakyan2010">{{cite journal | last1 = Rakyan | first1 = VK | last2 = Down | first2 = TA | last3 = Maslau | first3 = S | last4 = Andrew | first4 = T | last5 = Yang | first5 = TP | last6 = Beyan | first6 = H | last7 = Whittaker | first7 = P | last8 = McCann | first8 = OT | last9 = Finer | first9 = S | last10 = Valdes | first10 = AM | last11 = Leslie | first11 = RD | last12 = Deloukas | first12 = P | last13 = Spector | first13 = TD | year = 2010 | title = Human aging-associated DNA hypermethylation occurs preferentially at bivalent chromatin domains | journal = Genome Res | volume = 20 | issue = 4| pages = 434–439 | doi=10.1101/gr.103101.109 | pmid=20219945 | pmc=2847746}}</ref><ref name="Teschendorff2010">{{cite journal | last1 = Teschendorff | first1 = AE | last2 = Menon | first2 = U | last3 = Gentry-Maharaj | first3 = A | last4 = Ramus | first4 = SJ | last5 = Weisenberger | first5 = DJ | last6 = Shen | first6 = H | last7 = Campan | first7 = M | last8 = Noushmehr | first8 = H | last9 = Bell | first9 = CG | last10 = Maxwell | first10 = AP | last11 = Savage | first11 = DA | last12 = Mueller-Holzner | first12 = E | last13 = Marth | first13 = C | last14 = Kocjan | first14 = G | last15 = Gayther | first15 = SA | last16 = Jones | first16 = A | last17 = Beck | first17 = S | last18 = Wagner | first18 = W | last19 = Laird | first19 = PW | last20 = Jacobs | first20 = IJ | last21 = Widschwendter | first21 = M | year = 2010 | title = Age-dependent DNA methylation of genes that are suppressed in stem cells is a hallmark of cancer | journal = Genome Res | volume = 20 | issue = 4| pages = 440–446 | doi=10.1101/gr.103606.109 | pmid=20219944 | pmc=2847747}}</ref><ref name="Koch2011">{{cite journal | last1 = Koch | first1 = CM | last2 = Wagner | first2 = W | date = Oct 2011 | title = Epigenetic-aging-signature to determine age in different tissues | url = | journal = Aging | volume = 3 | issue = 10| pages = 1018–27 | pmid = 22067257 | pmc = 3229965 | doi = 10.18632/aging.100395 }}</ref><ref name="Horvath2012">{{cite journal | last1 = Horvath | first1 = S | last2 = Zhang | first2 = Y | last3 = Langfelder | first3 = P | last4 = Kahn | first4 = R | last5 = Boks | first5 = M | last6 = van Eijk | first6 = K | last7 = van den Berg | first7 = L | last8 = Ophoff | first8 = RA | year = 2012 | title = Aging effects on DNA methylation modules in human brain and blood tissue | journal = Genome Biol | volume = 13 | issue = 10| page = R97 | doi = 10.1186/gb-2012-13-10-r97 | pmid=23034122 | pmc=4053733}}</ref><ref name="Bell2012">{{cite journal | last1 = Bell | first1 = JT | last2 = Tsai | first2 = PC | last3 = Yang | first3 = TP | last4 = Pidsley | first4 = R | last5 = Nisbet | first5 = J | last6 = Glass | first6 = D | last7 = Mangino | first7 = M | last8 = Zhai | first8 = G | last9 = Zhang | first9 = F | last10 = Valdes | first10 = A | last11 = Shin | first11 = SY | last12 = Dempster | first12 = EL | last13 = Murray | first13 = RM | last14 = Grundberg | first14 = E | last15 = Hedman | first15 = AK | last16 = Nica | first16 = A | last17 = Small | first17 = KS | last18 = Dermitzakis | first18 = ET | last19 = McCarthy | first19 = MI | last20 = Mill | first20 = J | last21 = Spector | first21 = TD | last22 = Deloukas | first22 = P | year = 2012 | title = Epigenome-wide scans identify differentially methylated regions for age and age-related phenotypes in a healthy ageing population | url = | journal = PLoS Genet | volume = 8 | issue = 4| page = e1002629 | doi=10.1371/journal.pgen.1002629| pmid = 22532803 | pmc = 3330116 }}</ref> أول دليل قوي على أن مستويات المثيلة للحمض النووي في [[اللعاب]] يمكن أن تولد تنبؤات دقيقة للعمر تم نشره من قبل فريق UCLA بما في ذلك ستيف هورفاث في عام 2011 (Bocklandt et al 2011).<ref name="Forbes">{{cite web|last=University of California, Los Angeles (UCLA), Health Sciences|title=Scientists discover new biological clock with age-measuring potential|url=https://www.forbes.com/sites/melaniehaiken/2013/10/21/scientists-discover-new-biological-clock-that-measures-aging/|publisher=Forbes|accessdate=21 October 2013|date=21 October 2013}}</ref><ref name="Bocklandt2011">{{cite journal | last1 = Bocklandt | first1 = S | last2 = Lin | first2 = W | last3 = Sehl | first3 = ME | last4 = Sánchez | first4 = FJ | last5 = Sinsheimer | first5 = JS | last6 = Horvath | first6 = S | last7 = Vilain | first7 = E | year = 2011 | title = Epigenetic Predictor of Age | journal = PLoS ONE | volume = 6 | issue = 6| page = e14821 | pmid = 21731603 | doi=10.1371/journal.pone.0014821 | pmc=3120753}}</ref> نشرت مختبرات [[تيري ادكير]](Trey Ideker) و Kang Zhang في [[جامعة كاليفورنيا]] في [[سان دييغو]] [[ساعة الهجن الوراثي]] (Hannum 2013) ، <ref name="Hannum2013">{{cite journal | last1 = Hannum | first1 = G | last2 = Guinney | first2 = J | last3 = Zhao | first3 = L | last4 = Zhang | first4 = L | last5 = Hughes | first5 = G | last6 = Sadda | first6 = S | last7 = Klotzle | first7 = B | last8 = Bibikova | first8 = M | last9 = Fan | first9 = JB | last10 = Gao | first10 = Y | last11 = Deconde | first11 = R | last12 = Chen | first12 = M | last13 = Rajapakse | first13 = I | last14 = Friend | first14 = S | last15 = Ideker | first15 = T | last16 = Zhang | first16 = K | year = 2013 | title = Genome-wide methylation profiles reveal quantitative views of human aging rates | journal = Mol Cell | volume = 49 | issue = 2| pages = 359–367 | doi=10.1016/j.molcel.2012.10.016 | pmid=23177740 | pmc=3780611}}</ref> والتي تتكون من 71 علامة تحدد بدقة العمر بناءً على مستويات مثيلية الدم. أول ساعة جينية متعددة الأنسجة، هي ساعة هفث الجينية، طورها [[ستيف هورفاث]]، أستاذ [[علم الوراثة البشرية]] وعلم الإحصاء الحيوي في [[جامعة كاليفورنيا]] (Horvath 2013). <ref name="Horvath2013">{{cite journal | last1 = Horvath | first1 = S | year = 2013 | title = DNA methylation age of human tissues and cell types | url = | journal = Genome Biology | volume = 14| issue = 10 | page = R115 | doi = 10.1186/gb-2013-14-10-r115 | pmid=24138928 | pmc=4015143}}</ref><ref name="ScienceDaily">{{cite web|last=University of California, Los Angeles (UCLA), Health Sciences|title=Scientist uncovers internal clock able to measure age of most human tissues; Women's breast tissue ages faster than rest of body|url=https://www.sciencedaily.com/releases/2013/10/131020203006.htm|publisher=ScienceDaily|accessdate=22 October 2013|date=20 October 2013}}</ref> قضى هورفاث أكثر من 4 سنوات في جمع البيانات الخاصة بالميثيلين الحمضي DNA المتاحة للجمهور وتحديد الطرق الإحصائية المناسبة. <ref name="Biome2013">[http://www.biomedcentral.com/biome/novel-epigenetic-clock-predicts-tissue-age/ Biome on 21st October 2013 Novel epigenetic clock predicts tissue age]</ref> القصة الشخصية وراء الاكتشاف ظهرت في الطبيعة. <ref name="Gibbs2014">{{cite journal | last1 = Gibbs | first1 = WT | year = 2014 | title = Biomarkers and ageing: The clock-watcher | url = | journal = Nature | volume = 508 | issue = 7495| pages = 168–170 | doi = 10.1038/508168a | pmid=24717494}}</ref> تم تطوير مقدار العمر باستخدام 8000 عينة من 82 مجموعة من صفات مجموعة ميثيلنة DNA المميتة ، والتي تضم 51 نسيج ونمط خلوي سليم. يكمن الابتكار الرئيسي لساعة هفوث الفوق جينية في قابليتها للتطبيق: المجموعة نفسها من 353 CpGs ونفس خوارزمية التنبؤ تستخدم بغض النظر عن مصدر [[حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين]] في الكائن الحي، أي أنها لا تتطلب أي تعديلات أو تعويضات. <ref name="Gibbs2014">{{cite journal | last1 = Gibbs | first1 = WT | year = 2014 | title = Biomarkers and ageing: The clock-watcher | url = | journal = Nature | volume = 508 | issue = 7495| pages = 168–170 | doi = 10.1038/508168a | pmid=24717494}}</ref> تسمح هذه الخاصية لشخص بمقارنة أعمار مناطق مختلفة من جسم الإنسان باستخدام نفس الساعة العجوز.


== العلاقة مع سبب الشيخوخة البيولوجية ==
== العلاقة مع سبب الشيخوخة البيولوجية ==
لم يعرف بعد ما الذي يتم قياسه بالضبط بعمر مثيلة [[الحمض النووي]]. افترض هورفاث أن عمر مثيلة الحمض النووي يقيس التأثير التراكمي لنظام الصيانة الوراثي ولكن التفاصيل غير معروفة. حقيقة أن عمر الحمض النووي للمثيلة للدم يتنبأ بجميع أسباب الوفاة في الحياة اللاحقة <ref name="Chen2016"/><ref name="Marioni2015mortality"/><ref name="Christiansen2015"/><ref name="Horvath2015centenarian"/> يشير بقوة إلى أنه يرتبط بعملية تسبب الشيخوخة. <ref>{{Cite journal|last=|first=|date=2016|title=DNA methylation-based measures of biological age: meta-analysis predicting time to death|url=http://www.aging-us.com/article/101020|journal=Aging|volume=8|pages=1844–1865|doi=10.18632/aging.101020|pmc=5076441|pmid=27690265|via=|doi-access=Free|vauthors=Chen B, Marioni R, Colicino E, Peters M, Ward-Caviness C, Tsai P, Roetker N, Just A, Demerath E, Guan W|displayauthors=etal}}</ref> ومع ذلك، فمن غير المرجح أن تكون ساعة CpG ذات 353 ساعة خاصة أو تلعب دورًا سببيًا مباشرًا في عملية الشيخوخة. <ref name="Horvath2013"/> بدلا من ذلك، يلتقط الساعة اللاجينية خاصية طارئة لفوق [[جينوم]].
لم يعرف بعد ما الذي يتم قياسه بالضبط بعمر مثيلة [[الحمض النووي]]. افترض هورفاث أن عمر مثيلة الحمض النووي يقيس التأثير التراكمي لنظام الصيانة الوراثي ولكن التفاصيل غير معروفة. حقيقة أن عمر الحمض النووي للمثيلة للدم يتنبأ بجميع أسباب الوفاة في الحياة اللاحقة <ref name="Chen2016">{{cite journal | last1 = Chen | first1 = B | last2 = Marioni | first2 = ME | year = 2016 | title = DNA methylation-based measures of biological age: meta-analysis predicting time to death. | journal = Aging | volume = 8 | issue =9 | pages = 1844–1865 | doi= 10.18632/aging.101020 | pmid = 27690265 | pmc=5076441}}</ref><ref name="Marioni2015mortality">{{cite journal | last1 = Marioni | first1 = R | last2 = Shah | first2 = S | last3 = McRae | first3 = A | last4 = Chen | first4 = B | last5 = Colicino | first5 = E | last6 = Harris | first6 = S | last7 = Gibson | first7 = J | last8 = Henders | first8 = A | last9 = Redmond | first9 = P | last10 = Cox | first10 = S | last11 = Pattie | first11 = A | last12 = Corley | first12 = J | last13 = Murphy | first13 = L | last14 = Martin | first14 = N | last15 = Montgomery | first15 = G | last16 = Feinberg | first16 = A | last17 = Fallin | first17 = M | last18 = Multhaup | first18 = M | last19 = Jaffe | first19 = A | last20 = Joehanes | first20 = R | last21 = Schwartz | first21 = J | last22 = Just | first22 = A | last23 = Lunetta | first23 = K | last24 = Murabito | first24 = JM | last25 = Starr | first25 = J | last26 = Horvath | first26 = S | last27 = Baccarelli | first27 = A | last28 = Levy | first28 = D | last29 = Visscher | first29 = P | last30 = Wray | first30 = N | last31 = Deary | first31 = I | year = 2015 | title = DNA methylation age of blood predicts all-cause mortality in later life | journal = Genome Biology | volume = 16 | issue = 1| page = 25 | doi = 10.1186/s13059-015-0584-6 | pmid=25633388 | pmc=4350614}}</ref><ref name="Christiansen2015">{{cite journal | last1 = Christiansen | first1 = L | date = 2015 | title = DNA methylation age is associated with mortality in a longitudinal Danish twin study| journal = Aging Cell | volume =15 | issue =1| pages = 149–154| doi=10.1111/acel.12421 | pmid=26594032 | pmc=4717264}}</ref><ref name="Horvath2015centenarian">{{cite journal | last1 = Horvath | first1 = S | date = 2015 | title = Decreased epigenetic age of PBMCs from Italian semi-supercentenarians and their offspring.| url =
http://www.impactaging.com/papers/v7/n12/full/100861.html| journal = Aging | volume = | issue = Dec| pages =}}</ref> يشير بقوة إلى أنه يرتبط بعملية تسبب الشيخوخة. <ref>{{Cite journal|last=|first=|date=2016|title=DNA methylation-based measures of biological age: meta-analysis predicting time to death|url=http://www.aging-us.com/article/101020|journal=Aging|volume=8|pages=1844–1865|doi=10.18632/aging.101020|pmc=5076441|pmid=27690265|via=|doi-access=Free|vauthors=Chen B, Marioni R, Colicino E, Peters M, Ward-Caviness C, Tsai P, Roetker N, Just A, Demerath E, Guan W|displayauthors=etal}}</ref> ومع ذلك، فمن غير المرجح أن تكون ساعة CpG ذات 353 ساعة خاصة أو تلعب دورًا سببيًا مباشرًا في عملية الشيخوخة. <ref name="Horvath2013">{{cite journal | last1 = Horvath | first1 = S | year = 2013 | title = DNA methylation age of human tissues and cell types | url = | journal = Genome Biology | volume = 14| issue = 10 | page = R115 | doi = 10.1186/gb-2013-14-10-r115 | pmid=24138928 | pmc=4015143}}</ref> بدلا من ذلك، يلتقط الساعة اللاجينية خاصية طارئة لفوق [[جينوم]].


=== نظرية الساعة اللاجينية للشيخوخة ===
=== نظرية الساعة اللاجينية للشيخوخة ===
اقترح كل من هورفاث وراج <ref name="HorvathRaj2018"/> نظرية الساعة الجينية للشيخوخة مع المعتقدات التالية:
اقترح كل من هورفاث وراج <ref name="HorvathRaj2018">Horvath, S., & Raj, K. (2018). [https://www.nature.com/articles/s41576-018-0004-3 DNA methylation-based biomarkers and the epigenetic clock theory of ageing]. Nature Reviews Genetics, {{doi|10.1038/s41576-018-0004-3}}</ref> نظرية الساعة الجينية للشيخوخة مع المعتقدات التالية:
* تؤدي نتائج الشيخوخة البيولوجية إلى نتائج غير مقصودة لكل من برامج التطوير وبرنامج الصيانة ، حيث ينتج عن آثار الأقدام الجزيئية مقدرات سن الحامض النووي.
* تؤدي نتائج الشيخوخة البيولوجية إلى نتائج غير مقصودة لكل من برامج التطوير وبرنامج الصيانة ، حيث ينتج عن آثار الأقدام الجزيئية مقدرات سن الحامض النووي.
* الآليات الدقيقة التي تربط بين العمليات الجزيئية الفطرية (العمر الدناوي الكامن) إلى الانخفاض في وظيفة الأنسجة ربما ترتبط بالتغيرات داخل الخلايا (مما يؤدي إلى فقدان الهوية الخلوية) والتغيرات الطفيفة في تكوين الخلية ، على سبيل المثال ، الخلايا الجذعية الجسدية العاملة بشكل كامل .
* الآليات الدقيقة التي تربط بين العمليات الجزيئية الفطرية (العمر الدناوي الكامن) إلى الانخفاض في وظيفة الأنسجة ربما ترتبط بالتغيرات داخل الخلايا (مما يؤدي إلى فقدان الهوية الخلوية) والتغيرات الطفيفة في تكوين الخلية ، على سبيل المثال ، الخلايا الجذعية الجسدية العاملة بشكل كامل .

نسخة 22:52، 16 يونيو 2019

الساعة الفوق جينية هي مصطلح يستخدم لوصف الاختبار البيوكيميائي الذي يمكن استخدامه لقياس العمر. يعتمد الاختبار على مستويات مثيلية الحمض النووي.

التاريخ

وقد عرفت التأثيرات القوية للعمر على مستويات مثيلية الحمض النووي منذ أواخر الستينات. [1] وصفات واسعة تصف مجموعات من CpGs التي تربط مستويات مثيلية الحمض النووي مع العمر، على سبيل المثال [2][3][4][5][6] أول دليل قوي على أن مستويات المثيلة للحمض النووي في اللعاب يمكن أن تولد تنبؤات دقيقة للعمر تم نشره من قبل فريق UCLA بما في ذلك ستيف هورفاث في عام 2011 (Bocklandt et al 2011).[7][8] نشرت مختبرات تيري ادكير(Trey Ideker) و Kang Zhang في جامعة كاليفورنيا في سان دييغو ساعة الهجن الوراثي (Hannum 2013) ، [9] والتي تتكون من 71 علامة تحدد بدقة العمر بناءً على مستويات مثيلية الدم. أول ساعة جينية متعددة الأنسجة، هي ساعة هفث الجينية، طورها ستيف هورفاث، أستاذ علم الوراثة البشرية وعلم الإحصاء الحيوي في جامعة كاليفورنيا (Horvath 2013). [10][11] قضى هورفاث أكثر من 4 سنوات في جمع البيانات الخاصة بالميثيلين الحمضي DNA المتاحة للجمهور وتحديد الطرق الإحصائية المناسبة. [12] القصة الشخصية وراء الاكتشاف ظهرت في الطبيعة. [13] تم تطوير مقدار العمر باستخدام 8000 عينة من 82 مجموعة من صفات مجموعة ميثيلنة DNA المميتة ، والتي تضم 51 نسيج ونمط خلوي سليم. يكمن الابتكار الرئيسي لساعة هفوث الفوق جينية في قابليتها للتطبيق: المجموعة نفسها من 353 CpGs ونفس خوارزمية التنبؤ تستخدم بغض النظر عن مصدر حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين في الكائن الحي، أي أنها لا تتطلب أي تعديلات أو تعويضات. [13] تسمح هذه الخاصية لشخص بمقارنة أعمار مناطق مختلفة من جسم الإنسان باستخدام نفس الساعة العجوز.

العلاقة مع سبب الشيخوخة البيولوجية

لم يعرف بعد ما الذي يتم قياسه بالضبط بعمر مثيلة الحمض النووي. افترض هورفاث أن عمر مثيلة الحمض النووي يقيس التأثير التراكمي لنظام الصيانة الوراثي ولكن التفاصيل غير معروفة. حقيقة أن عمر الحمض النووي للمثيلة للدم يتنبأ بجميع أسباب الوفاة في الحياة اللاحقة [14][15][16][17] يشير بقوة إلى أنه يرتبط بعملية تسبب الشيخوخة. [18] ومع ذلك، فمن غير المرجح أن تكون ساعة CpG ذات 353 ساعة خاصة أو تلعب دورًا سببيًا مباشرًا في عملية الشيخوخة. [10] بدلا من ذلك، يلتقط الساعة اللاجينية خاصية طارئة لفوق جينوم.

نظرية الساعة اللاجينية للشيخوخة

اقترح كل من هورفاث وراج [19] نظرية الساعة الجينية للشيخوخة مع المعتقدات التالية:

  • تؤدي نتائج الشيخوخة البيولوجية إلى نتائج غير مقصودة لكل من برامج التطوير وبرنامج الصيانة ، حيث ينتج عن آثار الأقدام الجزيئية مقدرات سن الحامض النووي.
  • الآليات الدقيقة التي تربط بين العمليات الجزيئية الفطرية (العمر الدناوي الكامن) إلى الانخفاض في وظيفة الأنسجة ربما ترتبط بالتغيرات داخل الخلايا (مما يؤدي إلى فقدان الهوية الخلوية) والتغيرات الطفيفة في تكوين الخلية ، على سبيل المثال ، الخلايا الجذعية الجسدية العاملة بشكل كامل .
  • على المستوى الجزيئي ، عمر DNAm هو قراءات قريبة لمجموعة من عمليات الشيخوخة الفطرية التي تتآمر مع غيرها من الأسباب الجذرية المستقلة للشيخوخة على حساب وظيفة الأنسجة.

مراجع

  1. ^ Berdyshev، G؛ Korotaev، G؛ Boiarskikh، G؛ Vaniushin، B (1967). "Nucleotide composition of DNA and RNA from somatic tissues of humpback and its changes during spawning". Biokhimiia. ج. 31: 988–993.
  2. ^ Rakyan، VK؛ Down، TA؛ Maslau، S؛ Andrew، T؛ Yang، TP؛ Beyan، H؛ Whittaker، P؛ McCann، OT؛ Finer، S؛ Valdes، AM؛ Leslie، RD؛ Deloukas، P؛ Spector، TD (2010). "Human aging-associated DNA hypermethylation occurs preferentially at bivalent chromatin domains". Genome Res. ج. 20 ع. 4: 434–439. DOI:10.1101/gr.103101.109. PMC:2847746. PMID:20219945.
  3. ^ Teschendorff، AE؛ Menon، U؛ Gentry-Maharaj، A؛ Ramus، SJ؛ Weisenberger، DJ؛ Shen، H؛ Campan، M؛ Noushmehr، H؛ Bell، CG؛ Maxwell، AP؛ Savage، DA؛ Mueller-Holzner، E؛ Marth، C؛ Kocjan، G؛ Gayther، SA؛ Jones، A؛ Beck، S؛ Wagner، W؛ Laird، PW؛ Jacobs، IJ؛ Widschwendter، M (2010). "Age-dependent DNA methylation of genes that are suppressed in stem cells is a hallmark of cancer". Genome Res. ج. 20 ع. 4: 440–446. DOI:10.1101/gr.103606.109. PMC:2847747. PMID:20219944.
  4. ^ Koch، CM؛ Wagner، W (أكتوبر 2011). "Epigenetic-aging-signature to determine age in different tissues". Aging. ج. 3 ع. 10: 1018–27. DOI:10.18632/aging.100395. PMC:3229965. PMID:22067257.
  5. ^ Horvath، S؛ Zhang، Y؛ Langfelder، P؛ Kahn، R؛ Boks، M؛ van Eijk، K؛ van den Berg، L؛ Ophoff، RA (2012). "Aging effects on DNA methylation modules in human brain and blood tissue". Genome Biol. ج. 13 ع. 10: R97. DOI:10.1186/gb-2012-13-10-r97. PMC:4053733. PMID:23034122.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  6. ^ Bell، JT؛ Tsai، PC؛ Yang، TP؛ Pidsley، R؛ Nisbet، J؛ Glass، D؛ Mangino، M؛ Zhai، G؛ Zhang، F؛ Valdes، A؛ Shin، SY؛ Dempster، EL؛ Murray، RM؛ Grundberg، E؛ Hedman، AK؛ Nica، A؛ Small، KS؛ Dermitzakis، ET؛ McCarthy، MI؛ Mill، J؛ Spector، TD؛ Deloukas، P (2012). "Epigenome-wide scans identify differentially methylated regions for age and age-related phenotypes in a healthy ageing population". PLoS Genet. ج. 8 ع. 4: e1002629. DOI:10.1371/journal.pgen.1002629. PMC:3330116. PMID:22532803.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  7. ^ University of California, Los Angeles (UCLA), Health Sciences (21 أكتوبر 2013). "Scientists discover new biological clock with age-measuring potential". Forbes. اطلع عليه بتاريخ 2013-10-21.{{استشهاد ويب}}: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
  8. ^ Bocklandt، S؛ Lin، W؛ Sehl، ME؛ Sánchez، FJ؛ Sinsheimer، JS؛ Horvath، S؛ Vilain، E (2011). "Epigenetic Predictor of Age". PLoS ONE. ج. 6 ع. 6: e14821. DOI:10.1371/journal.pone.0014821. PMC:3120753. PMID:21731603.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  9. ^ Hannum، G؛ Guinney، J؛ Zhao، L؛ Zhang، L؛ Hughes، G؛ Sadda، S؛ Klotzle، B؛ Bibikova، M؛ Fan، JB؛ Gao، Y؛ Deconde، R؛ Chen، M؛ Rajapakse، I؛ Friend، S؛ Ideker، T؛ Zhang، K (2013). "Genome-wide methylation profiles reveal quantitative views of human aging rates". Mol Cell. ج. 49 ع. 2: 359–367. DOI:10.1016/j.molcel.2012.10.016. PMC:3780611. PMID:23177740.
  10. ^ ا ب Horvath، S (2013). "DNA methylation age of human tissues and cell types". Genome Biology. ج. 14 ع. 10: R115. DOI:10.1186/gb-2013-14-10-r115. PMC:4015143. PMID:24138928.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  11. ^ University of California, Los Angeles (UCLA), Health Sciences (20 أكتوبر 2013). "Scientist uncovers internal clock able to measure age of most human tissues; Women's breast tissue ages faster than rest of body". ScienceDaily. اطلع عليه بتاريخ 2013-10-22.{{استشهاد ويب}}: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
  12. ^ Biome on 21st October 2013 Novel epigenetic clock predicts tissue age
  13. ^ ا ب Gibbs، WT (2014). "Biomarkers and ageing: The clock-watcher". Nature. ج. 508 ع. 7495: 168–170. DOI:10.1038/508168a. PMID:24717494.
  14. ^ Chen، B؛ Marioni، ME (2016). "DNA methylation-based measures of biological age: meta-analysis predicting time to death". Aging. ج. 8 ع. 9: 1844–1865. DOI:10.18632/aging.101020. PMC:5076441. PMID:27690265.
  15. ^ Marioni، R؛ Shah، S؛ McRae، A؛ Chen، B؛ Colicino، E؛ Harris، S؛ Gibson، J؛ Henders، A؛ Redmond، P؛ Cox، S؛ Pattie، A؛ Corley، J؛ Murphy، L؛ Martin، N؛ Montgomery، G؛ Feinberg، A؛ Fallin، M؛ Multhaup، M؛ Jaffe، A؛ Joehanes، R؛ Schwartz، J؛ Just، A؛ Lunetta، K؛ Murabito، JM؛ Starr، J؛ Horvath، S؛ Baccarelli، A؛ Levy، D؛ Visscher، P؛ Wray، N؛ Deary، I (2015). "DNA methylation age of blood predicts all-cause mortality in later life". Genome Biology. ج. 16 ع. 1: 25. DOI:10.1186/s13059-015-0584-6. PMC:4350614. PMID:25633388.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  16. ^ Christiansen، L (2015). "DNA methylation age is associated with mortality in a longitudinal Danish twin study". Aging Cell. ج. 15 ع. 1: 149–154. DOI:10.1111/acel.12421. PMC:4717264. PMID:26594032.
  17. ^ Horvath، S (2015). "Decreased epigenetic age of PBMCs from Italian semi-supercentenarians and their offspring". Aging ع. Dec.
  18. ^ Chen B، Marioni R، Colicino E، Peters M، Ward-Caviness C، Tsai P، Roetker N، Just A، Demerath E، Guan W (2016). "DNA methylation-based measures of biological age: meta-analysis predicting time to death". Aging. ج. 8: 1844–1865. DOI:10.18632/aging.101020. PMC:5076441. PMID:27690265. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |doi-access=Free غير صالح (مساعدة) والوسيط غير المعروف |displayauthors= تم تجاهله يقترح استخدام |إظهار المؤلفين= (مساعدة)
  19. ^ Horvath, S., & Raj, K. (2018). DNA methylation-based biomarkers and the epigenetic clock theory of ageing. Nature Reviews Genetics, دُوِي:10.1038/s41576-018-0004-3