هيستون أوكتامر: الفرق بين النسختين

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
[مراجعة غير مفحوصة][مراجعة غير مفحوصة]
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
تعديل وصلات من English الى عربي
وسمان: تعديلات طويلة تحرير مرئي
modifying links
وسمان: تعديلات طويلة تحرير مرئي
سطر 5: سطر 5:


== تاريخ البحث ==
== تاريخ البحث ==
تم تحديد تعديلات [[هستون|هيستون]] بعد [[تعديل ما بعد الترجمة]] وإدراجها على أنها لها دور تنظيمي محتمل في تركيب الحمض النووي [[حمض نووي ريبوزي|RNA]] في عام 1964. <ref>{{استشهاد ويب
تم تحديد تعديلات [[هستون|هيستون]] بعد [[تعديل ما بعد الترجمة]] وإدراجها على أنها لها دور تنظيمي محتمل في تركيب الحمض النووي [[حمض نووي ريبوزي|RNA]] في عام 1964.<ref name="allfrey2">{{cite journal
| last = Allfrey
| مسار = Allfrey, VG; Mirsky, AE (May 1, 1964). "Structural Modifications of Histones and their Possible Role in the Regulation of RNA Synthesis". Science. 144 (3618): 559. doi:10.1126/science.144.3618.559. PMID 17836360.
| عنوان =
| first = VG
| author2 = Mirsky, AE
}}</ref>منذ ذلك الحين، على مدى عدة عقود، تطورت نظرية [[كروماتين|الكروماتين]]. تم إنشاء نماذج الوحدات الفرعية للكروماتين بالإضافة إلى فكرة النوكليوسوم في عامي 1973 و 1974 على التوالي. <ref>{{استشهاد ويب
| title = Structural Modifications of Histones and their Possible Role in the Regulation of RNA Synthesis.
| مسار = Burgoyne, Hewish (1973). "Chromatin sub-structure. The digestion of chromatin DNA at regularly spaced sites by a nuclear deoxyribonuclease". Biochem. Biophys. Res. Commun. 52 (2): 504–510. doi:10.1016/0006-291x(73)90740-7. PMID 4711166.
| عنوان =
| journal = Science
| date = May 1, 1964
}}</ref> تمكن ريتشموند ومجموعته البحثية من توضيح التركيب البلوري لأوكتامر هيستون مع الحمض النووي الملفوف حوله بدقة 7 Å في عام 1984. <ref>{{استشهاد ويب
| volume = 144
| مسار = Klug; Richmond (1984). "Structure of the nucleosome core particle at 7 Å resolution". Nature. 311 (5986): 532–537. Bibcode:1984Natur.311..532R. doi:10.1038/311532a0. PMID 6482966. S2CID 4355982.
| عنوان =
| issue = 3618
| pages = 559
}}</ref> تمت إعادة النظر في بنية معقد اللب الثماني بعد سبع سنوات وتم توضيح دقة 3.1 Å لبلورته عند تركيز عالٍ من الملح. على الرغم من أن تشابه التسلسل منخفض بين الهستونات الأساسية، فإن كل واحد من الأربعة يحتوي على عنصر متكرر يتكون من اللولب حلقة الحلزون يسمى عنصر [[:en:Histone_fold|هيستون المطوي]]. <ref>{{استشهاد ويب
| pmid = 17836360
| مسار = Arents; Burlingame (1991). "The nucleosomal core histone octamer at 3.1 ˚A resolution: a tripartite protein assembly and a left-handed superhelix". PNAS. 88 (22): 10148–52. doi:10.1073/pnas.88.22.10148. PMC 52885. PMID 1946434.
| doi = 10.1126/science.144.3618.559
| عنوان =
}}</ref>منذ ذلك الحين، على مدى عدة عقود، تطورت نظرية [[كروماتين|الكروماتين]]. تم إنشاء نماذج الوحدات الفرعية للكروماتين بالإضافة إلى فكرة النوكليوسوم في عامي 1973 و 1974 على التوالي.<ref name="history 2">{{cite journal
}}</ref> علاوة على ذلك، تم ضبط تفاصيل تفاعلات بروتين-البروتين والبروتين-الحمض النووي من خلال دراسات علم البلورات بالأشعة السينية عند 2.8 و 1.9 Å، على التوالي، في العقد الأول من القرن الحادي والعشرين.<ref>{{استشهاد ويب
| last = Burgoyne
| مسار = Davey, Curt A.; Sargent, David F.; Luger, Karolin; Maeder, Armin W.; Richmond, Timothy J. (June 2002). "Solvent Mediated Interactions in the Structure of the Nucleosome Core Particle at 1.9Å Resolution". Journal of Molecular Biology. 319 (5): 1097–1113. doi:10.1016/S0022-2836(02)00386-8. PMID 12079350.
| عنوان =
| first = Hewish
| title = Chromatin sub-structure. The digestion of chromatin DNA at regularly spaced sites by a nuclear deoxyribonuclease
| journal = Biochem. Biophys. Res. Commun.
| year = 1973
| volume = 52
| issue = 2
| pages = 504–510
| doi = 10.1016/0006-291x(73)90740-7
| pmid = 4711166
}}</ref> تمكن ريتشموند ومجموعته البحثية من توضيح التركيب البلوري لأوكتامر هيستون مع الحمض النووي الملفوف حوله بدقة 7 Å في عام 1984.<ref name="klug">{{cite journal
| last = Klug
| author2 = Richmond
| title = Structure of the nucleosome core particle at 7 Å resolution
| journal = Nature
| year = 1984
| volume = 311
| pages = 532–537
| doi = 10.1038/311532a0
| issue = 5986
| pmid = 6482966
| bibcode = 1984Natur.311..532R
| s2cid = 4355982
}}</ref> تمت إعادة النظر في بنية معقد اللب الثماني بعد سبع سنوات وتم توضيح دقة 3.1 Å لبلورته عند تركيز عالٍ من الملح. على الرغم من أن تشابه التسلسل منخفض بين الهستونات الأساسية، فإن كل واحد من الأربعة يحتوي على عنصر متكرر يتكون من اللولب حلقة الحلزون يسمى عنصر [[:en:Histone_fold|هيستون المطوي]].<ref name="arents">{{cite journal
| last = Arents
| author2 = Burlingame
| title = The nucleosomal core histone octamer at 3.1 ˚A resolution: a tripartite protein assembly and a left-handed superhelix
| journal = PNAS
| year = 1991
| volume = 88
| issue = 22
| pages = 10148–52
| doi = 10.1073/pnas.88.22.10148
| pmid = 1946434
| pmc = 52885
| doi-access = free
}}</ref> علاوة على ذلك، تم ضبط تفاصيل تفاعلات بروتين-البروتين والبروتين-الحمض النووي من خلال دراسات علم البلورات بالأشعة السينية عند 2.8 و 1.9 Å، على التوالي، في العقد الأول من القرن الحادي والعشرين.<ref name="Solvent Mediated Interactions in the Structure of the Nucleosome Core Particle at 1.9Å Resolution">{{cite journal
| last = Davey
| first = Curt A.
| author2 = Sargent, David F.
| author3 = Luger, Karolin
| author4 = Maeder, Armin W.
| author5 = Richmond, Timothy J.
| title = Solvent Mediated Interactions in the Structure of the Nucleosome Core Particle at 1.9Å Resolution
| journal = Journal of Molecular Biology
| date = June 2002
| volume = 319
| issue = 5
| pages = 1097–1113
| doi = 10.1016/S0022-2836(02)00386-8
| pmid = 12079350
}}</ref>
}}</ref>


== أوكتامر هيستون بالتفصيل الجزيئي ==
== أوكتامر هيستون بالتفصيل الجزيئي ==
[[هستون|الهستونات]] الأساسية هي أربعة [[بروتين|بروتينات]] تسمى H2A و H2B و H3 و H4 وتوجد جميعها في أجزاء متساوية في الخلية. تحتوي كل متواليات [[حمض أميني|الأحماض الأمينية]] الأربعة الأساسية للهيستون على ما بين 20 و 24٪ من [[لايسين|اللايسين]] والأرجينين ويتراوح حجم أو البروتين بين 11400 و 15400 دالتون ، مما يجعلها بروتينات صغيرة نسبيًا ولكنها ذات شحنة موجبة للغاية. <ref name=":0">{{استشهاد ويب
[[هستون|الهستونات]] الأساسية هي أربعة [[بروتين|بروتينات]] تسمى H2A و H2B و H3 و H4 وتوجد جميعها في أجزاء متساوية في الخلية. تحتوي كل متواليات [[حمض أميني|الأحماض الأمينية]] الأربعة الأساسية للهيستون على ما بين 20 و 24٪ من [[لايسين|اللايسين]] والأرجينين ويتراوح حجم أو البروتين بين 11400 و 15400 دالتون ، مما يجعلها بروتينات صغيرة نسبيًا ولكنها ذات شحنة موجبة للغاية.<ref name="watson">{{cite book
| title = Molecular biology of the gene
| مسار = School, James D. Watson, Cold Spring Harbor Laboratory, Tania A. Baker, Massachusetts Institute of Technology, Stephen P. Bell, Massachusetts Institute of Technology, Alexander Gann, Cold Spring Harbor Laboratory, Michael Levine, University of California, Berkeley, Richard Losik, Harvard University ; with Stephen C. Harrison, Harvard Medical (2014). Molecular biology of the gene (Seventh ed.). Boston: Benjamin-Cummings Publishing Company. p. 241. ISBN 978-0321762436.
| publisher = Benjamin-Cummings Publishing Company
| عنوان =Molecular biology of the gene<!-- عنوان مولد بالبوت -->
| year = 2014
|تاريخ الوصول=2022-01-16}}</ref> نسبة عالية من الأحماض الأمينية موجبة الشحنة تسمح لها بالارتباط الوثيق [[حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين|بالحمض النووي]] سالبة الشحنة. يتم تشكيل Heterodimers، أو هيستون فقط - وسيطة من مجالات هيستون (histone-fold). يستمر تكوين الهيستون فقط - وسيطة عندما يتم إقران الهستونات الأساسية في شكل الهلال المتشابك شبه المتماثل. يتكون كل مجال (histone-fold) هيستون من 3 [[لولب ألفا]] مفصولة بحلقات غير منتظمة. مجال طية هيستون مسؤول عن تكوين مغايرات من الرأس إلى الذيل لاثنين من الهيستونات: H2A-H2B و H3-H4. ومع ذلك، فإن الهيستونات H3 و H4 تشكل أولاً مغايرًا ثم يتناقص بدوره المغير المتغاير لتشكيل رباعي الأبعاد H32-H42. <ref>{{استشهاد ويب
| isbn = 978-0321762436
| مسار = Luger, Karolin (April 2003). "Structure and dynamic behavior of nucleosomes". Current Opinion in Genetics & Development. 13 (2): 127–135. doi:10.1016/S0959-437X(03)00026-1. PMID 12672489.
| عنوان =
| edition = Seventh
| page = 241
}}</ref> يعتمد تكوين المغير المتغاير على تفاعل تفاعلات بقايا الأحماض الأمينية الكارهة للماء بين البروتينين.
| location = Boston
| last = School
| first = James D. Watson, Cold Spring Harbor Laboratory, Tania A. Baker, Massachusetts Institute of Technology, Stephen P. Bell, Massachusetts Institute of Technology, Alexander Gann, Cold Spring Harbor Laboratory, Michael Levine, University of California, Berkeley, Richard Losik, Harvard University ; with Stephen C. Harrison, Harvard Medical
}}</ref> نسبة عالية من الأحماض الأمينية موجبة الشحنة تسمح لها بالارتباط الوثيق [[حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين|بالحمض النووي]] سالبة الشحنة. يتم تشكيل Heterodimers، أو هيستون فقط - وسيطة من مجالات هيستون (histone-fold). يستمر تكوين الهيستون فقط - وسيطة عندما يتم إقران الهستونات الأساسية في شكل الهلال المتشابك شبه المتماثل. يتكون كل مجال (histone-fold) هيستون من 3 [[لولب ألفا]] مفصولة بحلقات غير منتظمة. مجال طية هيستون مسؤول عن تكوين مغايرات من الرأس إلى الذيل لاثنين من الهيستونات: H2A-H2B و H3-H4. ومع ذلك، فإن الهيستونات H3 و H4 تشكل أولاً مغايرًا ثم يتناقص بدوره المغير المتغاير لتشكيل رباعي الأبعاد H32-H42.<ref name="Structure and dynamic behavior of nucleosomes">{{cite journal
| last = Luger
| first = Karolin
| title = Structure and dynamic behavior of nucleosomes
| journal = Current Opinion in Genetics & Development
| date = April 2003
| volume = 13
| issue = 2
| pages = 127–135
| doi = 10.1016/S0959-437X(03)00026-1
| pmid = 12672489
}}</ref> يعتمد تكوين المغير المتغاير على تفاعل تفاعلات بقايا الأحماض الأمينية الكارهة للماء بين البروتينين.<ref name="Structure and dynamic behavior of nucleosomes" />


يسمح شبه التناظر بتركيب المغير المتغاير على نفسه من خلال دوران 180 درجة حول محور التناظر هذا. نتيجة للدوران ، فإن طرفي الهيستونات المتضمنين في ربط الحمض النووي لشكل الهلال H3-H4 متكافئان ، ومع ذلك ينظمان امتدادات مختلفة من الحمض النووي. يتم طي ثنائي H2A-H2B أيضًا بشكل مشابه. يتم تغليف رباعي H32-H42 بحمض نووي حوله كخطوة أولى في تكوين الجسيمات النووية. ثم يتم توصيل اثنين من ثنائيات H2A-H2B بمركب DNA- H32-H42 لتكوين جسيم نووي.<ref>{{استشهاد ويب
يسمح شبه التناظر بتركيب المغير المتغاير على نفسه من خلال دوران 180 درجة حول محور التناظر هذا. نتيجة للدوران ، فإن طرفي الهيستونات المتضمنين في ربط الحمض النووي لشكل الهلال H3-H4 متكافئان ، ومع ذلك ينظمان امتدادات مختلفة من الحمض النووي. يتم طي ثنائي H2A-H2B أيضًا بشكل مشابه. يتم تغليف رباعي H32-H42 بحمض نووي حوله كخطوة أولى في تكوين الجسيمات النووية. ثم يتم توصيل اثنين من ثنائيات H2A-H2B بمركب DNA- H32-H42 لتكوين جسيم نووي.<ref name="H2A-H2B">{{cite journal
| last = D’Arcy
| مسار = D’Arcy, Sheena; Martin, Kyle W.; Panchenko, Tanya; Chen, Xu; Bergeron, Serge; Stargell, Laurie A.; Black, Ben E.; Luger, Karolin (September 2013). "Chaperone Nap1 Shields Histone Surfaces Used in a Nucleosome and Can Put H2A-H2B in an Unconventional Tetrameric Form". Molecular Cell. 51 (5): 662–677. doi:10.1016/j.molcel.2013.07.015. PMC 3878309. PMID 23973327.
| journal = Molecular Cell
| عنوان =
| pmid = 23973327
| doi = 10.1016/j.molcel.2013.07.015
| pages = 662–677
| issue = 5
| volume = 51
| date = September 2013
| title = Chaperone Nap1 Shields Histone Surfaces Used in a Nucleosome and Can Put H2A-H2B in an Unconventional Tetrameric Form
| first = Sheena
| author8 = Luger, Karolin
| author7 = Black, Ben E.
| author6 = Stargell, Laurie A.
| author5 = Bergeron, Serge
| author4 = Chen, Xu
| author3 = Panchenko, Tanya
| author2 = Martin, Kyle W.
| pmc = 3878309
}}</ref>
}}</ref>


يحتوي كل من الهستونات الأساسية الأربعة ، بالإضافة إلى نطاقات طيات هيستون(histone-fold) الخاصة بهم، أيضًا على امتدادات مرنة وغير منظمة تسمى "ذيول" [[هستون|هيستون]]. <ref>{{استشهاد ويب
يحتوي كل من الهستونات الأساسية الأربعة ، بالإضافة إلى نطاقات طيات هيستون(histone-fold) الخاصة بهم، أيضًا على امتدادات مرنة وغير منظمة تسمى "ذيول" [[هستون|هيستون]].<ref name="H1">{{cite journal
| last = Harshman
| مسار = Harshman, S. W.; Young, N. L.; Parthun, M. R.; Freitas, M. A. (14 August 2013). "H1 histones: current perspectives and challenges". Nucleic Acids Research. 41 (21): 9593–9609. doi:10.1093/nar/gkt700. PMC 3834806. PMID 23945933.
| عنوان =
| first = S. W.
| author2 = Young, N. L.
}}</ref> تشير معالجة النيوكليوسومات [[ببتيداز|بالبروتياز]] [[تربسن|التربسين]] إلى أنه بعد إزالة ذيول الهيستون، يمكن للحمض النووي أن يظل مرتبطًا بإحكام بالجسيم النووي. ذيول الهيستون تخضع لمجموعة واسعة من التعديلات التي تشمل [[فسفرة|الفسفرة]]، [[أستلة|والأستلة]]، [[مثيلة|والميثيل]] لمخلفات السيرين والليسين والأرجينين.
| author3 = Parthun, M. R.
| author4 = Freitas, M. A.
| title = H1 histones: current perspectives and challenges
| journal = Nucleic Acids Research
| date = 14 August 2013
| doi = 10.1093/nar/gkt700
| volume = 41
| issue = 21
| pages = 9593–9609
| pmid = 23945933
| pmc = 3834806
}}</ref> تشير معالجة النيوكليوسومات [[ببتيداز|بالبروتياز]] [[تربسن|التربسين]] إلى أنه بعد إزالة ذيول الهيستون، يمكن للحمض النووي أن يظل مرتبطًا بإحكام بالجسيم النووي.<ref name="watson" /> ذيول الهيستون تخضع لمجموعة واسعة من التعديلات التي تشمل [[فسفرة|الفسفرة]]، [[أستلة|والأستلة]]، [[مثيلة|والميثيل]] لمخلفات السيرين والليسين والأرجينين.<ref name="watson" />


== أوكتامر هيستون في النواة ==
== أوكتامر هيستون في النواة ==
''مزيد من المعلومات: [[جسيم نووي|نوكليوسوم]]''
''مزيد من المعلومات: [[جسيم نووي|نوكليوسوم]]''
[[ملف:Nucleosome structure.png|تصغير|يتجمع النوكليوسوم عندما يلتف الحمض النووي حول أوكتامر هيستون، اثنان من ثنائيات H2A-H2B مرتبطان برباعي H3-H4.]]
[[ملف:Nucleosome structure.png|تصغير|يتجمع النوكليوسوم عندما يلتف الحمض النووي حول أوكتامر هيستون، اثنان من ثنائيات H2A-H2B مرتبطان برباعي H3-H4.]]
الجسيم الأساسي للنيوكليوسوم هو الشكل الأساسي لضغط الحمض النووي في [[حقيقيات النوى]]. تتكون النيوكليوسومات من أوكتامر هيستون محاط بـ 146 زوجًا أساسيًا من الحمض النووي ملفوفًا بطريقة [[:en:Superhelix|حلزونية فائقة]]. <ref name=":1">{{استشهاد ويب
الجسيم الأساسي للنيوكليوسوم هو الشكل الأساسي لضغط الحمض النووي في [[حقيقيات النوى]]. تتكون النيوكليوسومات من أوكتامر هيستون محاط بـ 146 زوجًا أساسيًا من الحمض النووي ملفوفًا بطريقة [[:en:Superhelix|حلزونية فائقة]].<ref name="andrews">{{cite journal
| last = Andrews
| مسار = Andrews, Andrew J.; Luger, Karolin (9 June 2011). "Nucleosome Structure(s) and Stability: Variations on a Theme". Annual Review of Biophysics. 40 (1): 99–117. doi:10.1146/annurev-biophys-042910-155329. PMID 21332355.
| عنوان =
| first = Andrew J.
| author2 = Luger, Karolin
}}</ref> بالإضافة إلى ضغط الحمض النووي، يلعب أوكتامر الهيستون دورًا رئيسيًا في نسخ الحمض النووي المحيط به. يتفاعل أوكتامر هيستون مع الحمض النووي من خلال طيات هيستون (histone-fold) الأساسية وذيول N- الطرفية. تتفاعل طية الهيستون كيميائيًا وفيزيائيًا مع [[الحلزون المزدوج للحمض النووي|أخدود الحمض النووي الصغير]]. لقد وجدت الدراسات أن الهستونات تتفاعل بشكل أفضل مع المناطق المخصبة [[أدينين|A]]: [[ثايمين|T]] أكثر من المناطق المخصبة [[غوانين|G]]: [[سايتوسين|C]] في الأخاديد الصغيرة. لا تتفاعل ذيول N-الطرفية مع منطقة معينة من الحمض النووي، بل تستقر وتوجه الحمض النووي الملفوف حول الأوكتامر. ومع ذلك، فإن التفاعلات بين أوكتامر هيستون والحمض النووي ليست دائمة. يمكن فصل الاثنين بسهولة تامة وغالبًا ما يكونان أثناء [[تضاعف الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين|النسخ]] [[نسخ (وراثة)|وتكرار]]. تعمل بروتينات إعادة البناء المحددة على تغيير بنية الكروماتين باستمرار عن طريق كسر الروابط بين الحمض النووي والنيوكليوسوم.
| title = Nucleosome Structure(s) and Stability: Variations on a Theme
| journal = Annual Review of Biophysics
| date = 9 June 2011
| volume = 40
| issue = 1
| pages = 99–117
| doi = 10.1146/annurev-biophys-042910-155329
| pmid = 21332355
}}</ref> بالإضافة إلى ضغط الحمض النووي، يلعب أوكتامر الهيستون دورًا رئيسيًا في نسخ الحمض النووي المحيط به. يتفاعل أوكتامر هيستون مع الحمض النووي من خلال طيات هيستون (histone-fold) الأساسية وذيول N- الطرفية. تتفاعل طية الهيستون كيميائيًا وفيزيائيًا مع [[الحلزون المزدوج للحمض النووي|أخدود الحمض النووي الصغير]]. لقد وجدت الدراسات أن الهستونات تتفاعل بشكل أفضل مع المناطق المخصبة [[أدينين|A]]: [[ثايمين|T]] أكثر من المناطق المخصبة [[غوانين|G]]: [[سايتوسين|C]] في الأخاديد الصغيرة.<ref name="watson" /> لا تتفاعل ذيول N-الطرفية مع منطقة معينة من الحمض النووي، بل تستقر وتوجه الحمض النووي الملفوف حول الأوكتامر. ومع ذلك، فإن التفاعلات بين أوكتامر هيستون والحمض النووي ليست دائمة. يمكن فصل الاثنين بسهولة تامة وغالبًا ما يكونان أثناء [[تضاعف الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين|النسخ]] [[نسخ (وراثة)|وتكرار]]. تعمل بروتينات إعادة البناء المحددة على تغيير بنية الكروماتين باستمرار عن طريق كسر الروابط بين الحمض النووي والنيوكليوسوم.


=== تفاعلات هيستون / DNA ===
=== تفاعلات هيستون / DNA ===
تتكون الهيستونات في الغالب من بقايا أحماض أمينية موجبة الشحنة مثل [[لايسين|اللايسين]] [[أرجنين|والأرجينين]]. تسمح لهم الشحنات الموجبة بالارتباط الوثيق بالحمض النووي السالب الشحنة من خلال التفاعلات الكهروستاتيكية. إبطال مفعول الشحنات في الحمض النووي يسمح لها بأن تصبح أكثر إحكامًا. <ref name=":0" />
تتكون الهيستونات في الغالب من بقايا أحماض أمينية موجبة الشحنة مثل [[لايسين|اللايسين]] [[أرجنين|والأرجينين]]. تسمح لهم الشحنات الموجبة بالارتباط الوثيق بالحمض النووي السالب الشحنة من خلال التفاعلات الكهروستاتيكية. إبطال مفعول الشحنات في الحمض النووي يسمح لها بأن تصبح أكثر إحكامًا.<ref name="watson" />


==== التفاعلات مع الأخدود الطفيف ====
==== التفاعلات مع الأخدود الطفيف ====
يمثل تفاعل نطاقات هيستون- طَي (histone-fold) مع الأخدود الصغير في غالبية التفاعلات في النواة. <ref>{{استشهاد ويب
يمثل تفاعل نطاقات هيستون- طَي (histone-fold) مع الأخدود الصغير في غالبية التفاعلات في النواة.<ref name="luger">{{cite journal
| last = Richmond
| مسار = Richmond, Timothy J.; Luger, Karolin; Mäder, Armin W.; Richmond, Robin K.; Sargent, David F. (18 September 1997). "Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 A resolution". Nature. 389 (6648): 251–260. doi:10.1038/38444. PMID 9305837. S2CID 4328827.
| first = Timothy J.
| عنوان =
| author2 = Luger, Karolin
}}</ref> بينما يلتف الحمض النووي حول أوكتامر هيستون، فإنه يعرض أخدودها الصغير إلى أوكتامر هيستون في 14 موقعًا متميزًا. في هذه المواقع ، يتفاعل الاثنان من خلال سلسلة من الروابط الضعيفة غير التساهمية. المصدر الرئيسي للروابط يأتي من الروابط الهيدروجينية، المباشرة والمائية. <ref name=":1" /> روابط الهيدروجين المطوية بالهيستون مع كل من العمود الفقري للفوسفوديستر والقواعد الغنية A: T. في هذه التفاعلات، ترتبط طية الهيستون بذرات الأكسجين والسلاسل الجانبية [[مجموعة هيدروكسيل|للهيدروكسيل]]، على التوالي. تحتوي هذه المواقع معًا على ما مجموعه حوالي 40 رابطة هيدروجينية، معظمها من تفاعلات العمود الفقري. بالإضافة إلى ذلك، 10 من أصل 14 مرة يواجه فيها الأخدود الصغير طية الهيستون، يتم إدخال سلسلة جانبية أرجينين من طية هيستون في الأخدود الصغير. المرات الأربع الأخرى، يأتي الأرجينين من منطقة الذيل للهيستون.
| author3 = Mäder, Armin W.
| author4 = Richmond, Robin K.
| author5 = Sargent, David F.
| journal = Nature
| date = 18 September 1997
| volume = 389
| issue = 6648
| pages = 251–260
| doi = 10.1038/38444
| pmid = 9305837
| title = Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 A resolution
| s2cid = 4328827
}}</ref> بينما يلتف الحمض النووي حول أوكتامر هيستون، فإنه يعرض أخدودها الصغير إلى أوكتامر هيستون في 14 موقعًا متميزًا. في هذه المواقع ، يتفاعل الاثنان من خلال سلسلة من الروابط الضعيفة غير التساهمية. المصدر الرئيسي للروابط يأتي من الروابط الهيدروجينية، المباشرة والمائية.<ref name="andrews" /> روابط الهيدروجين المطوية بالهيستون مع كل من العمود الفقري للفوسفوديستر والقواعد الغنية A: T. في هذه التفاعلات، ترتبط طية الهيستون بذرات الأكسجين والسلاسل الجانبية [[مجموعة هيدروكسيل|للهيدروكسيل]]، على التوالي.<ref name="luger" /> تحتوي هذه المواقع معًا على ما مجموعه حوالي 40 رابطة هيدروجينية، معظمها من تفاعلات العمود الفقري.<ref name="watson" /> بالإضافة إلى ذلك، 10 من أصل 14 مرة يواجه فيها الأخدود الصغير طية الهيستون، يتم إدخال سلسلة جانبية أرجينين من طية هيستون في الأخدود الصغير. المرات الأربع الأخرى، يأتي الأرجينين من منطقة الذيل للهيستون.<ref name="luger" />


==== تفاعلات وتعديلات الذيل ====
==== تفاعلات وتعديلات الذيل ====
''مزيد من المعلومات: [[هستون|هيستون]]''
''مزيد من المعلومات: [[هستون|هيستون]]''


كما ذُكر أعلاه، فقد ثبت أن ذيول الهيستون تتفاعل مباشرة مع الحمض النووي للنيوكليوسوم. يحتوي كل هيستون في الأوكتامر على ذيل N- طرفي يبرز من قلب هيستون. تلعب الذيل أدوارًا في التفاعلات بين النواة وداخلها والتي تؤثر في النهاية على الوصول إلى الجينات. الهيستونات عبارة عن جزيئات موجبة الشحنة تسمح بربط أقوى بجزيء DNA سالب الشحنة. يقلل تقليل الشحنة الموجبة لبروتينات الهيستون من قوة الارتباط بين الهيستون والحمض النووي، مما يجعله أكثر انفتاحًا على النسخ الجيني (التعبير). <ref>{{استشهاد ويب
كما ذُكر أعلاه، فقد ثبت أن ذيول الهيستون تتفاعل مباشرة مع الحمض النووي للنيوكليوسوم. يحتوي كل هيستون في الأوكتامر على ذيل N- طرفي يبرز من قلب هيستون. تلعب الذيل أدوارًا في التفاعلات بين النواة وداخلها والتي تؤثر في النهاية على الوصول إلى الجينات.<ref name="biswas">{{cite journal
| last = Biswas
| مسار = Biswas, Mithun; Voltz, Karine; Smith, Jeremy C.; Langowski, Jörg (15 December 2011). "Role of Histone Tails in Structural Stability of the Nucleosome". PLOS Computational Biology. 7 (12): e1002279. Bibcode:2011PLSCB...7E2279B. doi:10.1371/journal.pcbi.1002279. PMC 3240580. PMID 22207822.
| عنوان =
| first = Mithun
| author2 = Voltz, Karine
}}</ref> علاوة على ذلك، توجه هذه الوحدات المرنة غلاف الحمض النووي بطريقة أعسر حول أوكتامر هيستون أثناء تكوين النواة. <ref name=":0" /> بمجرد ربط الحمض النووي، تستمر ذيول في التفاعل مع الحمض النووي. أجزاء الذيل الأقرب إلى الرابطة الهيدروجينية للحمض النووي وتقوي ارتباط الحمض النووي مع الأوكتامر؛ ومع ذلك، فإن أجزاء الذيل الأبعد عن الحمض النووي تعمل بطريقة مختلفة تمامًا. تعدل الإنزيمات الخلوية الأحماض الأمينية في الأجزاء البعيدة من الذيل للتأثير على إمكانية الوصول إلى الحمض النووي. وقد تضمنت الذيول أيضًا في تثبيت ألياف بقطر 30 نانومتر. أظهرت الأبحاث أن إزالة ذيول معينة يمنع النيوكليوسومات من التكون بشكل صحيح ويؤدي إلى فشل عام في إنتاج ألياف الكروماتين. بشكل عام، تحمي هذه الارتباطات الحمض النووي النووي من البيئة الخارجية ولكنها تقلل أيضًا من إمكانية الوصول إلى النسخ الخلوي وآلات النسخ.
| author3 = Smith, Jeremy C.
| author4 = Langowski, Jörg
| title = Role of Histone Tails in Structural Stability of the Nucleosome
| journal = PLOS Computational Biology
| date = 15 December 2011
| volume = 7
| issue = 12
| pages = e1002279
| doi = 10.1371/journal.pcbi.1002279
| pmid = 22207822
| pmc = 3240580
| bibcode = 2011PLSCB...7E2279B
}}</ref> الهيستونات عبارة عن جزيئات موجبة الشحنة تسمح بربط أقوى بجزيء DNA سالب الشحنة. يقلل تقليل الشحنة الموجبة لبروتينات الهيستون من قوة الارتباط بين الهيستون والحمض النووي، مما يجعله أكثر انفتاحًا على النسخ الجيني (التعبير).<ref name="biswas" /> علاوة على ذلك، توجه هذه الوحدات المرنة غلاف الحمض النووي بطريقة أعسر حول أوكتامر هيستون أثناء تكوين النواة.<ref name="watson" /> بمجرد ربط الحمض النووي، تستمر ذيول في التفاعل مع الحمض النووي. أجزاء الذيل الأقرب إلى الرابطة الهيدروجينية للحمض النووي وتقوي ارتباط الحمض النووي مع الأوكتامر؛ ومع ذلك، فإن أجزاء الذيل الأبعد عن الحمض النووي تعمل بطريقة مختلفة تمامًا. تعدل الإنزيمات الخلوية الأحماض الأمينية في الأجزاء البعيدة من الذيل للتأثير على إمكانية الوصول إلى الحمض النووي. وقد تضمنت الذيول أيضًا في تثبيت ألياف بقطر 30 نانومتر. أظهرت الأبحاث أن إزالة ذيول معينة يمنع النيوكليوسومات من التكون بشكل صحيح ويؤدي إلى فشل عام في إنتاج ألياف الكروماتين.<ref name="biswas" /> بشكل عام، تحمي هذه الارتباطات الحمض النووي النووي من البيئة الخارجية ولكنها تقلل أيضًا من إمكانية الوصول إلى النسخ الخلوي وآلات النسخ.


==== إعادة تشكيل وتفكيك النواة ====
==== إعادة تشكيل وتفكيك النواة ====
سطر 71: سطر 198:
من أجل الوصول إلى نووي DNA، يجب كسر الروابط بينه وبين أوكتامر هيستون. يحدث هذا التغيير بشكل دوري في الخلية حيث يتم نسخ مناطق محددة، ويحدث على مستوى الجينوم أثناء النسخ المتماثل. تعمل بروتينات إعادة النمذجة بثلاث طرق متميزة: يمكنها تحريك الحمض النووي على طول سطح الأوكتامر، أو استبدال ثنائى هيستون واحد بمتغير، أو إزالة أوكتامر هيستون بالكامل. بغض النظر عن الطريقة، من أجل تعديل النيوكليوسومات، تتطلب مجمعات إعادة التشكيل طاقة من التحلل المائي لـ ATP لتوجيه أفعالها.
من أجل الوصول إلى نووي DNA، يجب كسر الروابط بينه وبين أوكتامر هيستون. يحدث هذا التغيير بشكل دوري في الخلية حيث يتم نسخ مناطق محددة، ويحدث على مستوى الجينوم أثناء النسخ المتماثل. تعمل بروتينات إعادة النمذجة بثلاث طرق متميزة: يمكنها تحريك الحمض النووي على طول سطح الأوكتامر، أو استبدال ثنائى هيستون واحد بمتغير، أو إزالة أوكتامر هيستون بالكامل. بغض النظر عن الطريقة، من أجل تعديل النيوكليوسومات، تتطلب مجمعات إعادة التشكيل طاقة من التحلل المائي لـ ATP لتوجيه أفعالها.


من بين الأساليب الثلاثة، يعد الانزلاق هو الأكثر شيوعًا والأقل خطورة. <ref>{{استشهاد ويب
من بين الأساليب الثلاثة، يعد الانزلاق هو الأكثر شيوعًا والأقل خطورة.<ref>{{cite journal
| last = Becker
| مسار = Becker, P. B. (16 September 2002). "NEW EMBO MEMBER'S REVIEW: Nucleosome sliding: facts and fiction". The EMBO Journal. 21 (18): 4749–4753. doi:10.1093/emboj/cdf486. PMC 126283. PMID 12234915.
| عنوان =
| first = P. B.
| title = NEW EMBO MEMBER'S REVIEW: Nucleosome sliding: facts and fiction
}}</ref> الفرضية الأساسية لهذه التقنية هي تحرير منطقة من الحمض النووي التي عادة ما يرتبط بها أوكتامر هيستون بإحكام. في حين لم يتم تعريف التقنية بشكل جيد، فإن الفرضية الأبرز هي أن الانزلاق يتم بطريقة "الدودة". في هذه الطريقة، باستخدام ATP كمصدر للطاقة، يفصل مجال الترانزستور لمركب إعادة تشكيل النوكليوزوم منطقة صغيرة من الحمض النووي من أوكتامر هيستون. هذه "الموجة" من الحمض النووي، التي تنكسر تلقائيًا وتعيد تشكيل روابط الهيدروجين كما هي، ثم تنتشر أسفل الحمض النووي النووي حتى تصل إلى موقع الارتباط الأخير مع أوكتامر الهيستون. بمجرد أن تصل الموجة إلى نهاية ثماني هيستون، يتم تمديد الفائض الذي كان على الحافة مرة واحدة في منطقة الحمض النووي الرابط. إجمالاً، تقوم جولة واحدة من هذه الطريقة بتحريك أوكتامر هيستون عدة أزواج أساسية في اتجاه معين - بعيدًا عن الاتجاه الذي تنتشر فيه "الموجة". <ref name=":0" /><ref>{{استشهاد ويب
| journal = The EMBO Journal
| مسار = Fazzio, TG; Tsukiyama, T (November 2003). "Chromatin remodeling in vivo: evidence for a nucleosome sliding mechanism". Molecular Cell. 12 (5): 1333–40. doi:10.1016/s1097-2765(03)00436-2. PMID 14636590.
| date = 16 September 2002
| عنوان =
| volume = 21
}}</ref>
| issue = 18
| pages = 4749–4753
| doi = 10.1093/emboj/cdf486
| pmid = 12234915
| pmc = 126283
}}</ref> الفرضية الأساسية لهذه التقنية هي تحرير منطقة من الحمض النووي التي عادة ما يرتبط بها أوكتامر هيستون بإحكام. في حين لم يتم تعريف التقنية بشكل جيد، فإن الفرضية الأبرز هي أن الانزلاق يتم بطريقة "الدودة". في هذه الطريقة، باستخدام ATP كمصدر للطاقة، يفصل مجال الترانزستور لمركب إعادة تشكيل النوكليوزوم منطقة صغيرة من الحمض النووي من أوكتامر هيستون. هذه "الموجة" من الحمض النووي، التي تنكسر تلقائيًا وتعيد تشكيل روابط الهيدروجين كما هي، ثم تنتشر أسفل الحمض النووي النووي حتى تصل إلى موقع الارتباط الأخير مع أوكتامر الهيستون. بمجرد أن تصل الموجة إلى نهاية ثماني هيستون، يتم تمديد الفائض الذي كان على الحافة مرة واحدة في منطقة الحمض النووي الرابط. إجمالاً، تقوم جولة واحدة من هذه الطريقة بتحريك أوكتامر هيستون عدة أزواج أساسية في اتجاه معين - بعيدًا عن الاتجاه الذي تنتشر فيه "الموجة".<ref>{{cite journal
| last = Fazzio
| first = TG
| author2 = Tsukiyama, T
| title = Chromatin remodeling in vivo: evidence for a nucleosome sliding mechanism.
| journal = Molecular Cell
| date = November 2003
| volume = 12
| issue = 5
| pages = 1333–40
| pmid = 14636590
| doi = 10.1016/s1097-2765(03)00436-2
| doi-access = free
}}</ref><ref name="watson" />


=== أهمية سريرية ===
=== أهمية سريرية ===
تشير العديد من التقارير إلى وجود صلة بين الأمراض المرتبطة بالعمر والعيوب الخلقية وأنواع عديدة من السرطان مع تعطيل بعض تعديلات هيستون بعد الترجمة. لقد حددت الدراسات أن ذيول N و C هي أهداف رئيسية للأستلة، والميثلة، والتواجد في كل مكان، والفسفرة. <ref>{{استشهاد ويب
تشير العديد من التقارير إلى وجود صلة بين الأمراض المرتبطة بالعمر والعيوب الخلقية وأنواع عديدة من السرطان مع تعطيل بعض تعديلات هيستون بعد الترجمة. لقد حددت الدراسات أن ذيول N و C هي أهداف رئيسية للأستلة، والميثلة، والتواجد في كل مكان، والفسفرة.<ref name="Translating the histone code">{{cite journal
| last = Jenuwein
| مسار = Jenuwein, T; Allis, CD (Aug 10, 2001). "Translating the histone code". Science. 293 (5532): 1074–80. CiteSeerX 10.1.1.453.900. doi:10.1126/science.1063127. PMID 11498575. S2CID 1883924.
| عنوان =
| first = T
| author2 = Allis, CD
}}</ref> تشير الأدلة الجديدة إلى العديد من التعديلات داخل قلب هيستون. يتجه البحث نحو فك رموز دور هذه التعديلات الأساسية للهيستون في واجهة هيستون DNA في الكروماتين. يمتلك بروتين ربط عنصر الاستجابة [[:en:P300-CBP_coactivator_family|p300]] و cAMP ([[:en:Calcium-binding_protein|CBP]]) نشاط هيستون [[:en:Acetyltransferase|أسيتيل ترانسفيراز]]. إن p300 و CBP هما أكثر إنزيمات هيستون أسيتيل ترانسفيراز مختلطة والتي تعمل على استيل جميع الهستونات الأساسية الأربعة على بقايا متعددة. <ref>{{استشهاد ويب
| title = Translating the histone code
| مسار = Schiltz, RL; Mizzen, CA; Vassilev, A; Cook, RG; Allis, CD; Nakatani, Y (Jan 15, 1999). "Overlapping but distinct patterns of histone acetylation by the human coactivators p300 and PCAF within nucleosomal substrates". The Journal of Biological Chemistry. 274 (3): 1189–92. doi:10.1074/jbc.274.3.1189. PMID 9880483.
| عنوان =
| journal = Science
| date = Aug 10, 2001
}}</ref> كان Lysine 18 و Lysine 27 على H3 هما موقعي أستلة الهيستون الوحيدان اللذان تم تقليلهما عند استنفاد CBP و p300 في الخلايا الليفية الجنينية للفأر. <ref>{{استشهاد ويب
| volume = 293
| مسار = Jin, Q; Yu, LR; Wang, L; Zhang, Z; Kasper, LH; Lee, JE; Wang, C; Brindle, PK; Dent, SY; Ge, K (Jan 19, 2011). "Distinct roles of GCN5/PCAF-mediated H3K9ac and CBP/p300-mediated H3K18/27ac in nuclear receptor transactivation". The EMBO Journal. 30 (2): 249–62. doi:10.1038/emboj.2010.318. PMC 3025463. PMID 21131905.
| عنوان =
| issue = 5532
| pages = 1074–80
}}</ref> كما أن الفئران التي خرجت من جهاز CBP و p300 لديها عيب في الأنبوب العصبي المفتوح، وبالتالي تموت قبل الولادة. p300 - / - تظهر الأجنة خلل في نمو القلب. يظهر CBP +/− الفئران تأخرًا في النمو، تشوهات قحفية وجهية، أورام خبيثة دموية، والتي لم يتم ملاحظتها في الفئران مع p300 +/−. <ref>{{استشهاد ويب
| pmid = 11498575
| مسار = Yao, TP; Oh, SP; Fuchs, M; Zhou, ND; Ch'ng, LE; Newsome, D; Bronson, RT; Li, E; Livingston, DM; Eckner, R (May 1, 1998). "Gene dosage-dependent embryonic development and proliferation defects in mice lacking the transcriptional integrator p300". Cell. 93 (3): 361–72. doi:10.1016/S0092-8674(00)81165-4. PMID 9590171. S2CID 620460.
| doi = 10.1126/science.1063127
| عنوان =
| citeseerx = 10.1.1.453.900
| s2cid = 1883924
}}</ref> تشير الأدلة الجديدة إلى العديد من التعديلات داخل قلب هيستون. يتجه البحث نحو فك رموز دور هذه التعديلات الأساسية للهيستون في واجهة هيستون DNA في الكروماتين. يمتلك بروتين ربط عنصر الاستجابة [[:en:P300-CBP_coactivator_family|p300]] و cAMP ([[:en:Calcium-binding_protein|CBP]]) نشاط هيستون [[:en:Acetyltransferase|أسيتيل ترانسفيراز]]. إن p300 و CBP هما أكثر إنزيمات هيستون أسيتيل ترانسفيراز مختلطة والتي تعمل على استيل جميع الهستونات الأساسية الأربعة على بقايا متعددة.<ref name="Overlapping but distinct patterns of histone acetylation by the human coactivators p300 and PCAF within nucleosomal substrates.">{{cite journal
| last = Schiltz
| first = RL
| author2 = Mizzen, CA
| author3 = Vassilev, A
| author4 = Cook, RG
| author5 = Allis, CD
| author6 = Nakatani, Y
| title = Overlapping but distinct patterns of histone acetylation by the human coactivators p300 and PCAF within nucleosomal substrates.
| journal = The Journal of Biological Chemistry
| date = Jan 15, 1999
| volume = 274
| issue = 3
| pages = 1189–92
| pmid = 9880483
| doi = 10.1074/jbc.274.3.1189
| doi-access = free
}}</ref> كان Lysine 18 و Lysine 27 على H3 هما موقعي أستلة الهيستون الوحيدان اللذان تم تقليلهما عند استنفاد CBP و p300 في الخلايا الليفية الجنينية للفأر.<ref name="Distinct roles of GCN5/PCAF-mediated H3K9ac and CBP/p300-mediated H3K18/27ac in nuclear receptor transactivation.">{{cite journal
| last = Jin
| title = Distinct roles of GCN5/PCAF-mediated H3K9ac and CBP/p300-mediated H3K18/27ac in nuclear receptor transactivation.
| doi = 10.1038/emboj.2010.318
| pmid = 21131905
| pages = 249–62
| issue = 2
| volume = 30
| date = Jan 19, 2011
| journal = The EMBO Journal
| author10 = Ge, K
| first = Q
| author9 = Dent, SY
| author8 = Brindle, PK
| author7 = Wang, C
| author6 = Lee, JE
| author5 = Kasper, LH
| author4 = Zhang, Z
| author3 = Wang, L
| author2 = Yu, LR
| pmc = 3025463
}}</ref> كما أن الفئران التي خرجت من جهاز CBP و p300 لديها عيب في الأنبوب العصبي المفتوح، وبالتالي تموت قبل الولادة. p300 - / - تظهر الأجنة خلل في نمو القلب. يظهر CBP +/− الفئران تأخرًا في النمو، تشوهات قحفية وجهية، أورام خبيثة دموية، والتي لم يتم ملاحظتها في الفئران مع p300 +/−. <ref name="Gene dosage-dependent embryonic development and proliferation defects in mice lacking the transcriptional integrator p300.">{{cite journal
| last = Yao
| title = Gene dosage-dependent embryonic development and proliferation defects in mice lacking the transcriptional integrator p300.
| s2cid = 620460
| doi = 10.1016/S0092-8674(00)81165-4
| pmid = 9590171
| pages = 361–72
| issue = 3
| volume = 93
| date = May 1, 1998
| journal = Cell
| author10 = Eckner, R
| first = TP
| author9 = Livingston, DM
| author8 = Li, E
| author7 = Bronson, RT
| author6 = Newsome, D
| author5 = Ch'ng, LE
| author4 = Zhou, ND
| author3 = Fuchs, M
| author2 = Oh, SP
| doi-access = free
}}</ref> تم الإبلاغ عن طفرات لكل من p300 في أورام بشرية مثل سرطان القولون والمستقيم والمعدة والثدي والمبيض والرئة والبنكرياس. أيضًا، يمكن أن يكون تنشيط أو توطين اثنين من هيستون أسيتيل ترانسفيرازات مسرطنة.
}}</ref> تم الإبلاغ عن طفرات لكل من p300 في أورام بشرية مثل سرطان القولون والمستقيم والمعدة والثدي والمبيض والرئة والبنكرياس. أيضًا، يمكن أن يكون تنشيط أو توطين اثنين من هيستون أسيتيل ترانسفيرازات مسرطنة.



نسخة 17:10، 20 يناير 2022

الوحدات الأساسية لهيكل الكروماتين

هيستون أوكتامر هو مركب البروتين الثمانية الموجود في مركز جسيم النواة الأساسي. يتكون من نسختين من كل من بروتينات هيستون الأساسية الأربعة (H2A وH2B وH3 وH4). يتجمع الثماني عندما يتجمع رباعي ، يحتوي على نسختين من كل من H3 و H4 ، مع اثنين من ثنائيات H2A / H2B. يحتوي كل هيستون على ذيل N- طرفي وطي (histone-fold) هيستون طرفية C. يتفاعل كلا المكونين الرئيسيين مع الحمض النووي بطريقتهما الخاصة من خلال سلسلة من التفاعلات الضعيفة، بما في ذلك الروابط الهيدروجينية وجسور الملح. تحافظ هذه التفاعلات على ارتباط الحمض النووي وثوكتامين هيستون بشكل فضفاض وتسمح في النهاية بإعادة وضعهما أو الانفصال كليًا.

تاريخ البحث

تم تحديد تعديلات هيستون بعد تعديل ما بعد الترجمة وإدراجها على أنها لها دور تنظيمي محتمل في تركيب الحمض النووي RNA في عام 1964.[1]منذ ذلك الحين، على مدى عدة عقود، تطورت نظرية الكروماتين. تم إنشاء نماذج الوحدات الفرعية للكروماتين بالإضافة إلى فكرة النوكليوسوم في عامي 1973 و 1974 على التوالي.[2] تمكن ريتشموند ومجموعته البحثية من توضيح التركيب البلوري لأوكتامر هيستون مع الحمض النووي الملفوف حوله بدقة 7 Å في عام 1984.[3] تمت إعادة النظر في بنية معقد اللب الثماني بعد سبع سنوات وتم توضيح دقة 3.1 Å لبلورته عند تركيز عالٍ من الملح. على الرغم من أن تشابه التسلسل منخفض بين الهستونات الأساسية، فإن كل واحد من الأربعة يحتوي على عنصر متكرر يتكون من اللولب حلقة الحلزون يسمى عنصر هيستون المطوي.[4] علاوة على ذلك، تم ضبط تفاصيل تفاعلات بروتين-البروتين والبروتين-الحمض النووي من خلال دراسات علم البلورات بالأشعة السينية عند 2.8 و 1.9 Å، على التوالي، في العقد الأول من القرن الحادي والعشرين.[5]

أوكتامر هيستون بالتفصيل الجزيئي

الهستونات الأساسية هي أربعة بروتينات تسمى H2A و H2B و H3 و H4 وتوجد جميعها في أجزاء متساوية في الخلية. تحتوي كل متواليات الأحماض الأمينية الأربعة الأساسية للهيستون على ما بين 20 و 24٪ من اللايسين والأرجينين ويتراوح حجم أو البروتين بين 11400 و 15400 دالتون ، مما يجعلها بروتينات صغيرة نسبيًا ولكنها ذات شحنة موجبة للغاية.[6] نسبة عالية من الأحماض الأمينية موجبة الشحنة تسمح لها بالارتباط الوثيق بالحمض النووي سالبة الشحنة. يتم تشكيل Heterodimers، أو هيستون فقط - وسيطة من مجالات هيستون (histone-fold). يستمر تكوين الهيستون فقط - وسيطة عندما يتم إقران الهستونات الأساسية في شكل الهلال المتشابك شبه المتماثل. يتكون كل مجال (histone-fold) هيستون من 3 لولب ألفا مفصولة بحلقات غير منتظمة. مجال طية هيستون مسؤول عن تكوين مغايرات من الرأس إلى الذيل لاثنين من الهيستونات: H2A-H2B و H3-H4. ومع ذلك، فإن الهيستونات H3 و H4 تشكل أولاً مغايرًا ثم يتناقص بدوره المغير المتغاير لتشكيل رباعي الأبعاد H32-H42.[7] يعتمد تكوين المغير المتغاير على تفاعل تفاعلات بقايا الأحماض الأمينية الكارهة للماء بين البروتينين.[7]

يسمح شبه التناظر بتركيب المغير المتغاير على نفسه من خلال دوران 180 درجة حول محور التناظر هذا. نتيجة للدوران ، فإن طرفي الهيستونات المتضمنين في ربط الحمض النووي لشكل الهلال H3-H4 متكافئان ، ومع ذلك ينظمان امتدادات مختلفة من الحمض النووي. يتم طي ثنائي H2A-H2B أيضًا بشكل مشابه. يتم تغليف رباعي H32-H42 بحمض نووي حوله كخطوة أولى في تكوين الجسيمات النووية. ثم يتم توصيل اثنين من ثنائيات H2A-H2B بمركب DNA- H32-H42 لتكوين جسيم نووي.[8]

يحتوي كل من الهستونات الأساسية الأربعة ، بالإضافة إلى نطاقات طيات هيستون(histone-fold) الخاصة بهم، أيضًا على امتدادات مرنة وغير منظمة تسمى "ذيول" هيستون.[9] تشير معالجة النيوكليوسومات بالبروتياز التربسين إلى أنه بعد إزالة ذيول الهيستون، يمكن للحمض النووي أن يظل مرتبطًا بإحكام بالجسيم النووي.[6] ذيول الهيستون تخضع لمجموعة واسعة من التعديلات التي تشمل الفسفرة، والأستلة، والميثيل لمخلفات السيرين والليسين والأرجينين.[6]

أوكتامر هيستون في النواة

مزيد من المعلومات: نوكليوسوم

يتجمع النوكليوسوم عندما يلتف الحمض النووي حول أوكتامر هيستون، اثنان من ثنائيات H2A-H2B مرتبطان برباعي H3-H4.

الجسيم الأساسي للنيوكليوسوم هو الشكل الأساسي لضغط الحمض النووي في حقيقيات النوى. تتكون النيوكليوسومات من أوكتامر هيستون محاط بـ 146 زوجًا أساسيًا من الحمض النووي ملفوفًا بطريقة حلزونية فائقة.[10] بالإضافة إلى ضغط الحمض النووي، يلعب أوكتامر الهيستون دورًا رئيسيًا في نسخ الحمض النووي المحيط به. يتفاعل أوكتامر هيستون مع الحمض النووي من خلال طيات هيستون (histone-fold) الأساسية وذيول N- الطرفية. تتفاعل طية الهيستون كيميائيًا وفيزيائيًا مع أخدود الحمض النووي الصغير. لقد وجدت الدراسات أن الهستونات تتفاعل بشكل أفضل مع المناطق المخصبة A: T أكثر من المناطق المخصبة G: C في الأخاديد الصغيرة.[6] لا تتفاعل ذيول N-الطرفية مع منطقة معينة من الحمض النووي، بل تستقر وتوجه الحمض النووي الملفوف حول الأوكتامر. ومع ذلك، فإن التفاعلات بين أوكتامر هيستون والحمض النووي ليست دائمة. يمكن فصل الاثنين بسهولة تامة وغالبًا ما يكونان أثناء النسخ وتكرار. تعمل بروتينات إعادة البناء المحددة على تغيير بنية الكروماتين باستمرار عن طريق كسر الروابط بين الحمض النووي والنيوكليوسوم.

تفاعلات هيستون / DNA

تتكون الهيستونات في الغالب من بقايا أحماض أمينية موجبة الشحنة مثل اللايسين والأرجينين. تسمح لهم الشحنات الموجبة بالارتباط الوثيق بالحمض النووي السالب الشحنة من خلال التفاعلات الكهروستاتيكية. إبطال مفعول الشحنات في الحمض النووي يسمح لها بأن تصبح أكثر إحكامًا.[6]

التفاعلات مع الأخدود الطفيف

يمثل تفاعل نطاقات هيستون- طَي (histone-fold) مع الأخدود الصغير في غالبية التفاعلات في النواة.[11] بينما يلتف الحمض النووي حول أوكتامر هيستون، فإنه يعرض أخدودها الصغير إلى أوكتامر هيستون في 14 موقعًا متميزًا. في هذه المواقع ، يتفاعل الاثنان من خلال سلسلة من الروابط الضعيفة غير التساهمية. المصدر الرئيسي للروابط يأتي من الروابط الهيدروجينية، المباشرة والمائية.[10] روابط الهيدروجين المطوية بالهيستون مع كل من العمود الفقري للفوسفوديستر والقواعد الغنية A: T. في هذه التفاعلات، ترتبط طية الهيستون بذرات الأكسجين والسلاسل الجانبية للهيدروكسيل، على التوالي.[11] تحتوي هذه المواقع معًا على ما مجموعه حوالي 40 رابطة هيدروجينية، معظمها من تفاعلات العمود الفقري.[6] بالإضافة إلى ذلك، 10 من أصل 14 مرة يواجه فيها الأخدود الصغير طية الهيستون، يتم إدخال سلسلة جانبية أرجينين من طية هيستون في الأخدود الصغير. المرات الأربع الأخرى، يأتي الأرجينين من منطقة الذيل للهيستون.[11]

تفاعلات وتعديلات الذيل

مزيد من المعلومات: هيستون

كما ذُكر أعلاه، فقد ثبت أن ذيول الهيستون تتفاعل مباشرة مع الحمض النووي للنيوكليوسوم. يحتوي كل هيستون في الأوكتامر على ذيل N- طرفي يبرز من قلب هيستون. تلعب الذيل أدوارًا في التفاعلات بين النواة وداخلها والتي تؤثر في النهاية على الوصول إلى الجينات.[12] الهيستونات عبارة عن جزيئات موجبة الشحنة تسمح بربط أقوى بجزيء DNA سالب الشحنة. يقلل تقليل الشحنة الموجبة لبروتينات الهيستون من قوة الارتباط بين الهيستون والحمض النووي، مما يجعله أكثر انفتاحًا على النسخ الجيني (التعبير).[12] علاوة على ذلك، توجه هذه الوحدات المرنة غلاف الحمض النووي بطريقة أعسر حول أوكتامر هيستون أثناء تكوين النواة.[6] بمجرد ربط الحمض النووي، تستمر ذيول في التفاعل مع الحمض النووي. أجزاء الذيل الأقرب إلى الرابطة الهيدروجينية للحمض النووي وتقوي ارتباط الحمض النووي مع الأوكتامر؛ ومع ذلك، فإن أجزاء الذيل الأبعد عن الحمض النووي تعمل بطريقة مختلفة تمامًا. تعدل الإنزيمات الخلوية الأحماض الأمينية في الأجزاء البعيدة من الذيل للتأثير على إمكانية الوصول إلى الحمض النووي. وقد تضمنت الذيول أيضًا في تثبيت ألياف بقطر 30 نانومتر. أظهرت الأبحاث أن إزالة ذيول معينة يمنع النيوكليوسومات من التكون بشكل صحيح ويؤدي إلى فشل عام في إنتاج ألياف الكروماتين.[12] بشكل عام، تحمي هذه الارتباطات الحمض النووي النووي من البيئة الخارجية ولكنها تقلل أيضًا من إمكانية الوصول إلى النسخ الخلوي وآلات النسخ.

إعادة تشكيل وتفكيك النواة

مزيد من المعلومات: إعادة عرض الكروماتين

من أجل الوصول إلى نووي DNA، يجب كسر الروابط بينه وبين أوكتامر هيستون. يحدث هذا التغيير بشكل دوري في الخلية حيث يتم نسخ مناطق محددة، ويحدث على مستوى الجينوم أثناء النسخ المتماثل. تعمل بروتينات إعادة النمذجة بثلاث طرق متميزة: يمكنها تحريك الحمض النووي على طول سطح الأوكتامر، أو استبدال ثنائى هيستون واحد بمتغير، أو إزالة أوكتامر هيستون بالكامل. بغض النظر عن الطريقة، من أجل تعديل النيوكليوسومات، تتطلب مجمعات إعادة التشكيل طاقة من التحلل المائي لـ ATP لتوجيه أفعالها.

من بين الأساليب الثلاثة، يعد الانزلاق هو الأكثر شيوعًا والأقل خطورة.[13] الفرضية الأساسية لهذه التقنية هي تحرير منطقة من الحمض النووي التي عادة ما يرتبط بها أوكتامر هيستون بإحكام. في حين لم يتم تعريف التقنية بشكل جيد، فإن الفرضية الأبرز هي أن الانزلاق يتم بطريقة "الدودة". في هذه الطريقة، باستخدام ATP كمصدر للطاقة، يفصل مجال الترانزستور لمركب إعادة تشكيل النوكليوزوم منطقة صغيرة من الحمض النووي من أوكتامر هيستون. هذه "الموجة" من الحمض النووي، التي تنكسر تلقائيًا وتعيد تشكيل روابط الهيدروجين كما هي، ثم تنتشر أسفل الحمض النووي النووي حتى تصل إلى موقع الارتباط الأخير مع أوكتامر الهيستون. بمجرد أن تصل الموجة إلى نهاية ثماني هيستون، يتم تمديد الفائض الذي كان على الحافة مرة واحدة في منطقة الحمض النووي الرابط. إجمالاً، تقوم جولة واحدة من هذه الطريقة بتحريك أوكتامر هيستون عدة أزواج أساسية في اتجاه معين - بعيدًا عن الاتجاه الذي تنتشر فيه "الموجة".[14][6]

أهمية سريرية

تشير العديد من التقارير إلى وجود صلة بين الأمراض المرتبطة بالعمر والعيوب الخلقية وأنواع عديدة من السرطان مع تعطيل بعض تعديلات هيستون بعد الترجمة. لقد حددت الدراسات أن ذيول N و C هي أهداف رئيسية للأستلة، والميثلة، والتواجد في كل مكان، والفسفرة.[15] تشير الأدلة الجديدة إلى العديد من التعديلات داخل قلب هيستون. يتجه البحث نحو فك رموز دور هذه التعديلات الأساسية للهيستون في واجهة هيستون DNA في الكروماتين. يمتلك بروتين ربط عنصر الاستجابة p300 و cAMP (CBP) نشاط هيستون أسيتيل ترانسفيراز. إن p300 و CBP هما أكثر إنزيمات هيستون أسيتيل ترانسفيراز مختلطة والتي تعمل على استيل جميع الهستونات الأساسية الأربعة على بقايا متعددة.[16] كان Lysine 18 و Lysine 27 على H3 هما موقعي أستلة الهيستون الوحيدان اللذان تم تقليلهما عند استنفاد CBP و p300 في الخلايا الليفية الجنينية للفأر.[17] كما أن الفئران التي خرجت من جهاز CBP و p300 لديها عيب في الأنبوب العصبي المفتوح، وبالتالي تموت قبل الولادة. p300 - / - تظهر الأجنة خلل في نمو القلب. يظهر CBP +/− الفئران تأخرًا في النمو، تشوهات قحفية وجهية، أورام خبيثة دموية، والتي لم يتم ملاحظتها في الفئران مع p300 +/−. [18] تم الإبلاغ عن طفرات لكل من p300 في أورام بشرية مثل سرطان القولون والمستقيم والمعدة والثدي والمبيض والرئة والبنكرياس. أيضًا، يمكن أن يكون تنشيط أو توطين اثنين من هيستون أسيتيل ترانسفيرازات مسرطنة.

انظر أيضا

المراجع

  1. ^ Allfrey، VG؛ Mirsky, AE (1 مايو 1964). "Structural Modifications of Histones and their Possible Role in the Regulation of RNA Synthesis". Science. ج. 144 ع. 3618: 559. DOI:10.1126/science.144.3618.559. PMID:17836360.
  2. ^ Burgoyne، Hewish (1973). "Chromatin sub-structure. The digestion of chromatin DNA at regularly spaced sites by a nuclear deoxyribonuclease". Biochem. Biophys. Res. Commun. ج. 52 ع. 2: 504–510. DOI:10.1016/0006-291x(73)90740-7. PMID:4711166.
  3. ^ Klug؛ Richmond (1984). "Structure of the nucleosome core particle at 7 Å resolution". Nature. ج. 311 ع. 5986: 532–537. Bibcode:1984Natur.311..532R. DOI:10.1038/311532a0. PMID:6482966. S2CID:4355982.
  4. ^ Arents؛ Burlingame (1991). "The nucleosomal core histone octamer at 3.1 ˚A resolution: a tripartite protein assembly and a left-handed superhelix". PNAS. ج. 88 ع. 22: 10148–52. DOI:10.1073/pnas.88.22.10148. PMC:52885. PMID:1946434.
  5. ^ Davey، Curt A.؛ Sargent, David F.؛ Luger, Karolin؛ Maeder, Armin W.؛ Richmond, Timothy J. (يونيو 2002). "Solvent Mediated Interactions in the Structure of the Nucleosome Core Particle at 1.9Å Resolution". Journal of Molecular Biology. ج. 319 ع. 5: 1097–1113. DOI:10.1016/S0022-2836(02)00386-8. PMID:12079350.
  6. ^ أ ب ت ث ج ح خ د School، James D. Watson, Cold Spring Harbor Laboratory, Tania A. Baker, Massachusetts Institute of Technology, Stephen P. Bell, Massachusetts Institute of Technology, Alexander Gann, Cold Spring Harbor Laboratory, Michael Levine, University of California, Berkeley, Richard Losik, Harvard University ; with Stephen C. Harrison, Harvard Medical (2014). Molecular biology of the gene (ط. Seventh). Boston: Benjamin-Cummings Publishing Company. ص. 241. ISBN:978-0321762436.{{استشهاد بكتاب}}: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
  7. ^ أ ب Luger، Karolin (أبريل 2003). "Structure and dynamic behavior of nucleosomes". Current Opinion in Genetics & Development. ج. 13 ع. 2: 127–135. DOI:10.1016/S0959-437X(03)00026-1. PMID:12672489.
  8. ^ D’Arcy، Sheena؛ Martin, Kyle W.؛ Panchenko, Tanya؛ Chen, Xu؛ Bergeron, Serge؛ Stargell, Laurie A.؛ Black, Ben E.؛ Luger, Karolin (سبتمبر 2013). "Chaperone Nap1 Shields Histone Surfaces Used in a Nucleosome and Can Put H2A-H2B in an Unconventional Tetrameric Form". Molecular Cell. ج. 51 ع. 5: 662–677. DOI:10.1016/j.molcel.2013.07.015. PMC:3878309. PMID:23973327.
  9. ^ Harshman، S. W.؛ Young, N. L.؛ Parthun, M. R.؛ Freitas, M. A. (14 أغسطس 2013). "H1 histones: current perspectives and challenges". Nucleic Acids Research. ج. 41 ع. 21: 9593–9609. DOI:10.1093/nar/gkt700. PMC:3834806. PMID:23945933.
  10. ^ أ ب Andrews، Andrew J.؛ Luger, Karolin (9 يونيو 2011). "Nucleosome Structure(s) and Stability: Variations on a Theme". Annual Review of Biophysics. ج. 40 ع. 1: 99–117. DOI:10.1146/annurev-biophys-042910-155329. PMID:21332355.
  11. ^ أ ب ت Richmond، Timothy J.؛ Luger, Karolin؛ Mäder, Armin W.؛ Richmond, Robin K.؛ Sargent, David F. (18 سبتمبر 1997). "Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 A resolution". Nature. ج. 389 ع. 6648: 251–260. DOI:10.1038/38444. PMID:9305837. S2CID:4328827.
  12. ^ أ ب ت Biswas، Mithun؛ Voltz, Karine؛ Smith, Jeremy C.؛ Langowski, Jörg (15 ديسمبر 2011). "Role of Histone Tails in Structural Stability of the Nucleosome". PLOS Computational Biology. ج. 7 ع. 12: e1002279. Bibcode:2011PLSCB...7E2279B. DOI:10.1371/journal.pcbi.1002279. PMC:3240580. PMID:22207822.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  13. ^ Becker، P. B. (16 سبتمبر 2002). "NEW EMBO MEMBER'S REVIEW: Nucleosome sliding: facts and fiction". The EMBO Journal. ج. 21 ع. 18: 4749–4753. DOI:10.1093/emboj/cdf486. PMC:126283. PMID:12234915.
  14. ^ Fazzio، TG؛ Tsukiyama, T (نوفمبر 2003). "Chromatin remodeling in vivo: evidence for a nucleosome sliding mechanism". Molecular Cell. ج. 12 ع. 5: 1333–40. DOI:10.1016/s1097-2765(03)00436-2. PMID:14636590.
  15. ^ Jenuwein، T؛ Allis, CD (10 أغسطس 2001). "Translating the histone code". Science. ج. 293 ع. 5532: 1074–80. CiteSeerX:10.1.1.453.900. DOI:10.1126/science.1063127. PMID:11498575. S2CID:1883924.
  16. ^ Schiltz، RL؛ Mizzen, CA؛ Vassilev, A؛ Cook, RG؛ Allis, CD؛ Nakatani, Y (15 يناير 1999). "Overlapping but distinct patterns of histone acetylation by the human coactivators p300 and PCAF within nucleosomal substrates". The Journal of Biological Chemistry. ج. 274 ع. 3: 1189–92. DOI:10.1074/jbc.274.3.1189. PMID:9880483.
  17. ^ Jin، Q؛ Yu, LR؛ Wang, L؛ Zhang, Z؛ Kasper, LH؛ Lee, JE؛ Wang, C؛ Brindle, PK؛ Dent, SY؛ Ge, K (19 يناير 2011). "Distinct roles of GCN5/PCAF-mediated H3K9ac and CBP/p300-mediated H3K18/27ac in nuclear receptor transactivation". The EMBO Journal. ج. 30 ع. 2: 249–62. DOI:10.1038/emboj.2010.318. PMC:3025463. PMID:21131905.
  18. ^ Yao، TP؛ Oh, SP؛ Fuchs, M؛ Zhou, ND؛ Ch'ng, LE؛ Newsome, D؛ Bronson, RT؛ Li, E؛ Livingston, DM؛ Eckner, R (1 مايو 1998). "Gene dosage-dependent embryonic development and proliferation defects in mice lacking the transcriptional integrator p300". Cell. ج. 93 ع. 3: 361–72. DOI:10.1016/S0092-8674(00)81165-4. PMID:9590171. S2CID:620460.

قراءة معمقة

  1. Allfrey, VG; Mirsky, AE (May 1, 1964). "Structural Modifications of Histones and their Possible Role in the Regulation of RNA Synthesis". Science. 144 (3618): 559. doi:10.1126/science.144.3618.559. PMID 17836360.
  2. Burgoyne, Hewish (1973). "Chromatin sub-structure. The digestion of chromatin DNA at regularly spaced sites by a nuclear deoxyribonuclease". Biochem. Biophys. Res. Commun. 52 (2): 504–510. doi:10.1016/0006-291x(73)90740-7. PMID 4711166.
  3. Klug; Richmond (1984). "Structure of the nucleosome core particle at 7 Å resolution". Nature. 311 (5986): 532–537. Bibcode:1984Natur.311..532R. doi:10.1038/311532a0. PMID 6482966. S2CID 4355982.
  4. Arents; Burlingame (1991). "The nucleosomal core histone octamer at 3.1 ˚A resolution: a tripartite protein assembly and a left-handed superhelix". PNAS. 88 (22): 10148–52. doi:10.1073/pnas.88.22.10148. PMC 52885. PMID 1946434.
  5. Davey, Curt A.; Sargent, David F.; Luger, Karolin; Maeder, Armin W.; Richmond, Timothy J. (June 2002). "Solvent Mediated Interactions in the Structure of the Nucleosome Core Particle at 1.9Å Resolution". Journal of Molecular Biology. 319 (5): 1097–1113. doi:10.1016/S0022-2836(02)00386-8. PMID 12079350.
  6. School, James D. Watson, Cold Spring Harbor Laboratory, Tania A. Baker, Massachusetts Institute of Technology, Stephen P. Bell, Massachusetts Institute of Technology, Alexander Gann, Cold Spring Harbor Laboratory, Michael Levine, University of California, Berkeley, Richard Losik, Harvard University ; with Stephen C. Harrison, Harvard Medical (2014). Molecular biology of the gene (Seventh ed.). Boston: Benjamin-Cummings Publishing Company. p. 241. ISBN 978-0321762436.
  7. Luger, Karolin (April 2003). "Structure and dynamic behavior of nucleosomes". Current Opinion in Genetics & Development. 13 (2): 127–135. doi:10.1016/S0959-437X(03)00026-1. PMID 12672489.
  8. D’Arcy, Sheena; Martin, Kyle W.; Panchenko, Tanya; Chen, Xu; Bergeron, Serge; Stargell, Laurie A.; Black, Ben E.; Luger, Karolin (September 2013). "Chaperone Nap1 Shields Histone Surfaces Used in a Nucleosome and Can Put H2A-H2B in an Unconventional Tetrameric Form". Molecular Cell. 51 (5): 662–677. doi:10.1016/j.molcel.2013.07.015. PMC 3878309. PMID 23973327.
  9. Harshman, S. W.; Young, N. L.; Parthun, M. R.; Freitas, M. A. (14 August 2013). "H1 histones: current perspectives and challenges". Nucleic Acids Research. 41 (21): 9593–9609. doi:10.1093/nar/gkt700. PMC 3834806. PMID 23945933.
  10. Andrews, Andrew J.; Luger, Karolin (9 June 2011). "Nucleosome Structure(s) and Stability: Variations on a Theme". Annual Review of Biophysics. 40 (1): 99–117. doi:10.1146/annurev-biophys-042910-155329. PMID 21332355.
  11. Richmond, Timothy J.; Luger, Karolin; Mäder, Armin W.; Richmond, Robin K.; Sargent, David F. (18 September 1997). "Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 A resolution". Nature. 389 (6648): 251–260. doi:10.1038/38444. PMID 9305837. S2CID 4328827.
  12. Biswas, Mithun; Voltz, Karine; Smith, Jeremy C.; Langowski, Jörg (15 December 2011). "Role of Histone Tails in Structural Stability of the Nucleosome". PLOS Computational Biology. 7 (12): e1002279. Bibcode:2011PLSCB...7E2279B. doi:10.1371/journal.pcbi.1002279. PMC 3240580. PMID 22207822.
  13. Becker, P. B. (16 September 2002). "NEW EMBO MEMBER'S REVIEW: Nucleosome sliding: facts and fiction". The EMBO Journal. 21 (18): 4749–4753. doi:10.1093/emboj/cdf486. PMC 126283. PMID 12234915.
  14. Fazzio, TG; Tsukiyama, T (November 2003). "Chromatin remodeling in vivo: evidence for a nucleosome sliding mechanism". Molecular Cell. 12 (5): 1333–40. doi:10.1016/s1097-2765(03)00436-2. PMID 14636590.
  15. Jenuwein, T; Allis, CD (Aug 10, 2001). "Translating the histone code". Science. 293 (5532): 1074–80. CiteSeerX 10.1.1.453.900. doi:10.1126/science.1063127. PMID 11498575. S2CID 1883924.
  16. Schiltz, RL; Mizzen, CA; Vassilev, A; Cook, RG; Allis, CD; Nakatani, Y (Jan 15, 1999). "Overlapping but distinct patterns of histone acetylation by the human coactivators p300 and PCAF within nucleosomal substrates". The Journal of Biological Chemistry. 274 (3): 1189–92. doi:10.1074/jbc.274.3.1189. PMID 9880483.
  17. Jin, Q; Yu, LR; Wang, L; Zhang, Z; Kasper, LH; Lee, JE; Wang, C; Brindle, PK; Dent, SY; Ge, K (Jan 19, 2011). "Distinct roles of GCN5/PCAF-mediated H3K9ac and CBP/p300-mediated H3K18/27ac in nuclear receptor transactivation". The EMBO Journal. 30 (2): 249–62. doi:10.1038/emboj.2010.318. PMC 3025463. PMID 21131905.
  18. Yao, TP; Oh, SP; Fuchs, M; Zhou, ND; Ch'ng, LE; Newsome, D; Bronson, RT; Li, E; Livingston, DM; Eckner, R (May 1, 1998). "Gene dosage-dependent embryonic development and proliferation defects in mice lacking the transcriptional integrator p300". Cell. 93 (3): 361–72. doi:10.1016/S0092-8674(00)81165-4. PMID 9590171. S2CID 620460.