ديوكسيريبونوكلياز 1: الفرق بين النسختين
[نسخة منشورة] | [نسخة منشورة] |
Mn-imhotep (نقاش | مساهمات) أُنشئَت بترجمة الصفحة "Deoxyribonuclease I" |
Mn-imhotep (نقاش | مساهمات) أُنشئَت بترجمة الصفحة "Deoxyribonuclease I" |
||
سطر 8: | سطر 8: | ||
== في علم الجينوم == |
== في علم الجينوم == |
||
في علم الجينوم، يُعتقد أن المواقع شديدة الحساسية لـدناز 1 تتميز بكروماتين مفتوح ويمكن الوصول إليه؛ ولذلك، فإن اختبار حساسية دناز 1 هو منهجية مستخدمة على نطاق واسع في علم الجينوم لتحديد مناطق الجينوم التي من المحتمل أن تحتوي على جينات نشطة <ref>{{استشهاد بدورية محكمة|title=High-resolution mapping and characterization of open chromatin across the genome|journal=Cell|volume=132|pages=311–322|year=2008|issue=2|DOI=10.1016/j.cell.2007.12.014|PMID=18243105|PMCID=2669738}}</ref> |
في علم الجينوم، يُعتقد أن المواقع شديدة الحساسية لـدناز 1 تتميز بكروماتين مفتوح ويمكن الوصول إليه؛ ولذلك، فإن اختبار حساسية دناز 1 هو منهجية مستخدمة على نطاق واسع في علم الجينوم لتحديد مناطق الجينوم التي من المحتمل أن تحتوي على جينات نشطة <ref>{{استشهاد بدورية محكمة|title=High-resolution mapping and characterization of open chromatin across the genome|journal=Cell|volume=132|pages=311–322|year=2008|issue=2|DOI=10.1016/j.cell.2007.12.014|PMID=18243105|PMCID=2669738}}</ref> |
||
== خصوصية تسلسل دناز 1 == |
|||
تم الإبلاغ مؤخرًا عن أن دناز 1 يُظهر بعض مستويات خصوصية التسلسل التي قد تعتمد على الظروف التجريبية. <ref>{{استشهاد بدورية محكمة|last=Koohy|first=Hashem|last2=Down, Thomas A.|last3=Hubbard, Tim J.|last4=Mariño-Ramírez, Leonardo|title=Chromatin Accessibility Data Sets Show Bias Due to Sequence Specificity of the DNase I Enzyme|journal=PLOS ONE|date=26 July 2013|volume=8|issue=7|pages=e69853|DOI=10.1371/journal.pone.0069853|PMID=23922824|PMCID=3724795|bibcode=2013PLoSO...869853K}}</ref> وعلى النقيض من الإنزيمات الأخرى التي تتمتع بخصوصية عالية للركيزة، فإن دناز 1 بالتأكيد لا يوصف بخصوصية تسلسل مطلقة. ومع ذلك فإن الانقسام في المواقع التي تحتوي على C أو G عند نهايتهما 3' يكون أقل كفاءة. |
|||
[[تصنيف:EC 3.1.21]] |
[[تصنيف:EC 3.1.21]] |
||
[[تصنيف:جينات على كروموسوم 16]] |
[[تصنيف:جينات على كروموسوم 16]] |
نسخة 09:08، 13 سبتمبر 2023
ديوكسيريبونوكلياز I (عادة ما يسمى DNase I )، هو نوكلياز داخلي لعائلة DNase مشفر بواسطة الجين البشري ديناز 1 . [1] DNase I هو نوكلياز يشق الحمض النووي بشكل تفضيلي عند روابط فوسفوديستر القريبة من موضع النيوكليوتيد بيريميدين ، مما ينتج عنه بولي نيوكليوتيدات منتهية بـ 5'-فوسفات مع مجموعة هيدروكسيل حرة في الموضع 3'، في المتوسط ينتج رباعي النوكليوتيدات. وهو يعمل على الحمض النووي المفرد السلسلة، والحمض النووي المزدوج، والكروماتين . بالإضافة إلى دوره كنوكلياز داخلي لإدارة النفايات، فقد اقترح أن يكون أحد نوكلياز الديوكسي ريبونوكلياز المسؤول عن تجزئة الحمض النووي أثناء موت الخلايا المبرمج . [2]
يرتبط الديناز I ببروتين الأكتين الهيكلي الخلوي . فهو يربط مونومرات الأكتين ذات الألفة العالية جدًا (شبه النانومولية) وبوليمرات الأكتين ذات الألفة الأقل. وظيفة هذا التفاعل غير واضحة. ومع ذلك، نظرًا لأن الدناز I المرتبط بالأكتين غير نشط إنزيميًا، فقد يكون "معقد دناز-أكتين" بمثابة شكل تخزين لدناز I الذي يمنع تلف المعلومات الوراثية. يتم تخزين هذا البروتين في حبيبات الزيموجين في الغلاف النووي ويعمل عن طريق شق الحمض النووي بطريقة التحلل الداخلي.
تم تمييز ما لا يقل عن ستة أليلات جسمية سائدة من الجين DNASE 1، DNASE1*1 حتى DNASE1*6، وتسلسل DNASE1*2 ممثل في هذا السجل. ارتبطت الطفرات في هذا الجين - بالإضافة إلى العامل المعطل لمنتج الإنزيم - بالذئبة الحمامية الجهازية ، وهو أحد أمراض المناعة الذاتية . [3] [4] يتم استخدام الشكل الدوائي من هذا البروتين لعلاج أحد أعراض التليف الكيسي عن طريق تحلل الحمض النووي خارج الخلية في البلغم وتقليل لزوجته. [5] تمت مشاهدة متغيرات متفرعة لهذا الجين ولكن لم يتم وصفها بدقة. [1]
في علم الجينوم
في علم الجينوم، يُعتقد أن المواقع شديدة الحساسية لـدناز 1 تتميز بكروماتين مفتوح ويمكن الوصول إليه؛ ولذلك، فإن اختبار حساسية دناز 1 هو منهجية مستخدمة على نطاق واسع في علم الجينوم لتحديد مناطق الجينوم التي من المحتمل أن تحتوي على جينات نشطة [6]
خصوصية تسلسل دناز 1
تم الإبلاغ مؤخرًا عن أن دناز 1 يُظهر بعض مستويات خصوصية التسلسل التي قد تعتمد على الظروف التجريبية. [7] وعلى النقيض من الإنزيمات الأخرى التي تتمتع بخصوصية عالية للركيزة، فإن دناز 1 بالتأكيد لا يوصف بخصوصية تسلسل مطلقة. ومع ذلك فإن الانقسام في المواقع التي تحتوي على C أو G عند نهايتهما 3' يكون أقل كفاءة.
- ^ ا ب "Entrez Gene: DNASE1 deoxyribonuclease I". وسم
<ref>
غير صالح؛ الاسم "entrez" معرف أكثر من مرة بمحتويات مختلفة. - ^ Samejima, K.؛ Earnshaw, W.C. (2005). "Trashing the genome: the role of nucleases during apoptosis". Nat Rev Mol Cell Biol. ج. 6 ع. 9: 677–88. DOI:10.1038/nrm1715. PMID:16103871.
- ^ "Impairment of neutrophil extracellular trap degradation is associated with lupus nephritis". Proc Natl Acad Sci U S A. ج. 107 ع. 21: 9813–8. 2010. Bibcode:2010PNAS..107.9813H. DOI:10.1073/pnas.0909927107. PMID:20439745.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: الوسيط غير المعروف|PMCID=
تم تجاهله يقترح استخدام|pmc=
(مساعدة) - ^ "Mutation of DNASE1 in people with systemic lupus erythematosus". Nat. Genet. ج. 28 ع. 4: 313–4. 2001. DOI:10.1038/91070. PMID:11479590.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: الوسيط غير المعروف|displayauthors=
تم تجاهله يقترح استخدام|إظهار المؤلفين=
(مساعدة) - ^ "Recombinant human DNase I reduces the viscosity of cystic fibrosis sputum". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 87 ع. 23: 9188–92. 1991. DOI:10.1073/pnas.87.23.9188. PMID:2251263.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: الوسيط غير المعروف|PMCID=
تم تجاهله يقترح استخدام|pmc=
(مساعدة) والوسيط غير المعروف|displayauthors=
تم تجاهله يقترح استخدام|إظهار المؤلفين=
(مساعدة) - ^ "High-resolution mapping and characterization of open chromatin across the genome". Cell. ج. 132 ع. 2: 311–322. 2008. DOI:10.1016/j.cell.2007.12.014. PMID:18243105.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: الوسيط غير المعروف|PMCID=
تم تجاهله يقترح استخدام|pmc=
(مساعدة) - ^ Koohy، Hashem؛ Down, Thomas A.؛ Hubbard, Tim J.؛ Mariño-Ramírez, Leonardo (26 يوليو 2013). "Chromatin Accessibility Data Sets Show Bias Due to Sequence Specificity of the DNase I Enzyme". PLOS ONE. ج. 8 ع. 7: e69853. Bibcode:2013PLoSO...869853K. DOI:10.1371/journal.pone.0069853. PMID:23922824.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: الوسيط غير المعروف|PMCID=
تم تجاهله يقترح استخدام|pmc=
(مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)