هذه المقالة يتيمة. ساعد بإضافة وصلة إليها في مقالة متعلقة بها
يرجى مراجعة هذه المقالة وإزالة وسم المقالات غير المراجعة، ووسمها بوسوم الصيانة المناسبة.

تنوع النوكليوتيد

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
اذهب إلى التنقل اذهب إلى البحث
N write.svg
هذه مقالة غير مراجعة. ينبغي أن يزال هذا القالب بعد أن يراجعها محرر ما عدا الذي أنشأها؛ إذا لزم الأمر فيجب أن توسم المقالة بقوالب الصيانة المناسبة. (مارس 2011)

تنوع النوكليوتيد (بالإنجليزية: Nucleotide diversity) هو مصطلح في علم الوراثة الجزيئي، يستخدم لقياس درجة تعدد الأشكال لدى السكان.[1][2][3]

في سنة 1979، قام ني ولي، باقتراح أول مقياس يستخدم في قياس هذا التنوع، ويتم تعريف هذا الإجراء بأنه متوسط عدد اختلافات (فروقات) النوكليوتيدات، لكل موقع يوجد بين أي اثنين من سلاسل الحمض النووي تم اختيارها عشوائيا من عينة السكان، ويرمز لها ب π.

يمثل الرمز الأول والثاني التكرارات على التتابع، ويمثل n اختلافات (فروقات) النوكليوتيدات لكل موقع يوجد بين أي اثنين من سلاسل الحمض النووي، ويتم إجراء الجمع على كل الأزواج المنفصلة دون تكرار.

ويمكن استخدام هذه الإحصائية في لرصد التنوع داخل أو بين التجمعات الإيكولوجية، لدراسة التباين الوراثي في المحاصيل والأنواع ذات الصلة، أو لتحديد العلاقات التطورية.

تنوع النوكليوتيدات، هو على قدر من الاختلاف الجيني. ويرتبط عادة مع المقاييس الإحصائية الأخرى لتنوع السكان، وهو مشابه لتغاير الزيجوت المتوقع. ويمكن حساب تنوع النكليوتيد، من خلال دراسة تسلسل الحمض النووي مباشرة، أو يمكن تقديره باستخدام بيانات العلامة الجزيئية، مثل مؤشرات المكاثرة العشوائية لقطع الـحامض النووي المتباينة، تقنية تعدد الأشكال الطولي للقطع المضخمة.

البرمجيات

تسلسل الحمض النووي متعدد الأشكال، هو مجموعة من البرامج لتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات، الخاصة بانحياز لبيانات تسلسل الحمض النووي. ميجا، وهو تحليل علم الوراثة الجزيئي التطوري، هو مجموعة من البرامج المستخدمة لتقدير معدلات التطور الجزيئي، فضلا عن توليد شجرة المَحْتِد، والتوفيق بين تسلسل الحمض النووي. يمكن استخدام هذا البرنامج على كل من نظامي تشغيل ا لويندوز ولينوكس.

Arlequin3 ويمكن استخدام البرنامج لإجراء العمليات الحسابية لتنوع النوكليوتيدات، ومجموعة متنوعة من الاختبارات الإحصائية الأخرى، لما بين السكان، داخل السكان. متاح على نظام ويندوز.

مراجع[عدل]

  1. ^ Kilian, B؛ Ozkan H؛ Walther A؛ Kohl J؛ Dagan T؛ Salamini F؛ Martin W (December 2007). "Molecular diversity at 18 loci in 321 wild and 92 domesticate lines reveal no reduction of nucleotide diversity during Triticum monococcum (Einkorn) domestication: implications for the origin of agriculture". Molecular Biology and Evolution. 24 (12): 2657–68. PMID 17898361. doi:10.1093/molbev/msm192. 
  2. ^ Yu, N.؛ Jensen-Seaman MI؛ Chemnick L؛ Ryder O؛ Li WH (March 2004). "Nucleotide diversity in gorillas". Genetics. 166 (3): 1375–83. PMC 1470796Freely accessible. PMID 15082556. doi:10.1534/genetics.166.3.1375. 
  3. ^ Nei, M.؛ Masatoshi Nei؛ Wen-Hsiung Li (October 1, 1979). "Mathematical Model for Studying Genetic Variation in Terms of Restriction Endonucleases". PNAS. 76 (10): 5269–73. PMC 413122Freely accessible. PMID 291943. doi:10.1073/pnas.76.10.5269.