انتقل إلى المحتوى

مستخدم:شذى فهد/ملعب

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة

إنزيمات كاذبة

[عدل]

تعتبر الإنزيمات الكاذبة من أنواع الإنزيمات الزائفة التي تعاني من نقص تحفيزي[1] من إنزيمات البروتين التي يتم تمثيلها في كل الكينومات عبر ممالك الحياة. تحتوي هذه الإنزيمات الكاذبة على وظائف فسيولوجية (نقل الإشارة) ووظائف فسيولوجية مَرضِية.[2][3][4][5][6][7][8]

التاريخ

[عدل]

تمت صياغة عبارة الإنزيمات الكاذبة لأول مرة في عام 2002.[9]. ثم تم تصنيفها لاحقًا إلى "فئات" مختلفة[10][11][12][13][14]. كما وتم العثور على العديد من العائلات التي تحتوي على الإنزيمات الكاذبة في الكينوم البشري، بما في ذلك قبائل من الإنزيمات الكاذبة، والتي تقع في الواجهة بين الكاينيز ويوبيكويتين اي 3 لايغيز.[15][16][17]

إن الإنزيمات البشرية (وأبناء عمومتها الفوسفات الكاذبة) متورطة في العديد من الأمراض[18][19]، وهذا جعلها هدفًا للأدوية والعقارات المضادة[20][21][22][23]. تتكون الإنزيمات الكاذبة من خليط تطوري من بروتين كاينيز حقيقي النواة (ePK) وبروتينات الإنزيم الكاذب غير المرتبطة ب (ePK) على سبيل المثال، فإن (FAM20A) الذي يقوم بربط الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP)[24] يعتبر من الإنزيمات الكاذبة بسبب مبادلة الجلوتمات المحفوظة بالجلوتامين في لولب ألفا سي[25]. كما أن (FAM20A) متورط في أمراض اللثة، ويعمل على التحكم في النشاط التحفيزي ل (FAM20C)، وهو إنزيم الكازين الفسيولوجي المهم حيث يتحكم في فسفرة البروتينات في جهاز جولجي المخصصة للإفراز[26]، مثل بروتين الحليب الكازين.

يؤكد التحليل التطوري الشامل أن الإنزيمات الكاذبة تتجمع في عائلات فرعية متعددة، وتوجد في الكينوم للكائنات الحية عبر ممالك الحياة، بما في ذلك بدائيات النوى، والعتائق وجميع الأنساب حقيقية النواة مع بروتين مشروح؛ هذه البيانات قابلة للبحث في ProKino (http://vulcan.cs.uga.edu/prokino/about/browser).

المراجع

[عدل]
  1. ^ Murphy JM، Farhan H، Eyers PA (أبريل 2017). "Bio-Zombie: the rise of pseudoenzymes in biology". Biochemical Society Transactions. ج. 45 ع. 2: 537–544. DOI:10.1042/BST20160400. PMID:28408493.
  2. ^ Jacobsen AV، Murphy JM (يونيو 2017). "The secret life of kinases: insights into non-catalytic signalling functions from pseudokinases". Biochemical Society Transactions. ج. 45 ع. 3: 665–681. DOI:10.1042/BST20160331. PMID:28620028.
  3. ^ Murphy JM، Zhang Q، Young SN، Reese ML، Bailey FP، Eyers PA، Ungureanu D، Hammaren H، Silvennoinen O، Varghese LN، Chen K، Tripaydonis A، Jura N، Fukuda K، Qin J، Nimchuk Z، Mudgett MB، Elowe S، Gee CL، Liu L، Daly RJ، Manning G، Babon JJ، Lucet IS (يناير 2014). "A robust methodology to subclassify pseudokinases based on their nucleotide-binding properties". The Biochemical Journal. ج. 457 ع. 2: 323–34. DOI:10.1042/BJ20131174. PMC:5679212. PMID:24107129.
  4. ^ Kannan N، Taylor SS (أبريل 2008). "Rethinking pseudokinases". Cell. ج. 133 ع. 2: 204–5. DOI:10.1016/j.cell.2008.04.005. PMC:6226312. PMID:18423189.
  5. ^ Mukherjee K، Sharma M، Urlaub H، Bourenkov GP، Jahn R، Südhof TC، Wahl MC (أبريل 2008). "CASK Functions as a Mg2+-independent neurexin kinase". Cell. ج. 133 ع. 2: 328–39. DOI:10.1016/j.cell.2008.02.036. PMC:3640377. PMID:18423203.
  6. ^ Bailey FP، Byrne DP، Oruganty K، Eyers CE، Novotny CJ، Shokat KM، Kannan N، Eyers PA (أبريل 2015). "The Tribbles 2 (TRB2) pseudokinase binds to ATP and autophosphorylates in a metal-independent manner". The Biochemical Journal. ج. 467 ع. 1: 47–62. DOI:10.1042/BJ20141441. PMC:4844368. PMID:25583260.
  7. ^ Shi F، Telesco SE، Liu Y، Radhakrishnan R، Lemmon MA (أبريل 2010). "ErbB3/HER3 intracellular domain is competent to bind ATP and catalyze autophosphorylation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 107 ع. 17: 7692–7. Bibcode:2010PNAS..107.7692S. DOI:10.1073/pnas.1002753107. PMC:2867849. PMID:20351256.
  8. ^ Zeqiraj E، Filippi BM، Deak M، Alessi DR، van Aalten DM (ديسمبر 2009). "Structure of the LKB1-STRAD-MO25 complex reveals an allosteric mechanism of kinase activation". Science. ج. 326 ع. 5960: 1707–11. Bibcode:2009Sci...326.1707Z. DOI:10.1126/science.1178377. PMC:3518268. PMID:19892943.
  9. ^ Manning G، Whyte DB، Martinez R، Hunter T، Sudarsanam S (ديسمبر 2002). "The protein kinase complement of the human genome". Science. ج. 298 ع. 5600: 1912–34. Bibcode:2002Sci...298.1912M. DOI:10.1126/science.1075762. PMID:12471243. S2CID:26554314.
  10. ^ Boudeau J، Miranda-Saavedra D، Barton GJ، Alessi DR (سبتمبر 2006). "Emerging roles of pseudokinases". Trends in Cell Biology. ج. 16 ع. 9: 443–52. DOI:10.1016/j.tcb.2006.07.003. PMID:16879967.
  11. ^ Zeqiraj E، Filippi BM، Deak M، Alessi DR، van Aalten DM (ديسمبر 2009). "Structure of the LKB1-STRAD-MO25 complex reveals an allosteric mechanism of kinase activation". Science. ج. 326 ع. 5960: 1707–11. Bibcode:2009Sci...326.1707Z. DOI:10.1126/science.1178377. PMC:3518268. PMID:19892943.
  12. ^ Zeqiraj E، van Aalten DM (ديسمبر 2010). "Pseudokinases-remnants of evolution or key allosteric regulators?". Current Opinion in Structural Biology. ج. 20 ع. 6: 772–81. DOI:10.1016/j.sbi.2010.10.001. PMC:3014569. PMID:21074407.
  13. ^ Scheeff ED، Eswaran J، Bunkoczi G، Knapp S، Manning G (يناير 2009). "Structure of the pseudokinase VRK3 reveals a degraded catalytic site, a highly conserved kinase fold, and a putative regulatory binding site". Structure. ج. 17 ع. 1: 128–38. DOI:10.1016/j.str.2008.10.018. PMC:2639636. PMID:19141289.
  14. ^ Eyers PA، Murphy JM (أغسطس 2013). "Dawn of the dead: protein pseudokinases signal new adventures in cell biology". Biochemical Society Transactions. ج. 41 ع. 4: 969–74. DOI:10.1042/BST20130115. PMID:23863165.
  15. ^ Eyers PA، Keeshan K، Kannan N (أبريل 2017). "Tribbles in the 21st Century: The Evolving Roles of Tribbles Pseudokinases in Biology and Disease". Trends in Cell Biology. ج. 27 ع. 4: 284–298. DOI:10.1016/j.tcb.2016.11.002. PMC:5382568. PMID:27908682.
  16. ^ Foulkes DM، Byrne DP، Yeung W، Shrestha S، Bailey FP، Ferries S، Eyers CE، Keeshan K، Wells C، Drewry DH، Zuercher WJ، Kannan N، Eyers PA (سبتمبر 2018). "Covalent inhibitors of EGFR family protein kinases induce degradation of human Tribbles 2 (TRIB2) pseudokinase in cancer cells". Science Signaling. ج. 11 ع. 549: eaat7951. DOI:10.1126/scisignal.aat7951. PMC:6553640. PMID:30254057.
  17. ^ Jamieson SA، Ruan Z، Burgess AE، Curry JR، McMillan HD، Brewster JL، Dunbier AK، Axtman AD، Kannan N، Mace PD (سبتمبر 2018). "Substrate binding allosterically relieves autoinhibition of the pseudokinase TRIB1". Science Signaling. ج. 11 ع. 549: eaau0597. DOI:10.1126/scisignal.aau0597. PMC:6553639. PMID:30254053.
  18. ^ Reiterer V، Eyers PA، Farhan H (سبتمبر 2014). "Day of the dead: pseudokinases and pseudophosphatases in physiology and disease". Trends in Cell Biology. ج. 24 ع. 9: 489–505. DOI:10.1016/j.tcb.2014.03.008. PMID:24818526.
  19. ^ Chen MJ، Dixon JE، Manning G (أبريل 2017). "Genomics and evolution of protein phosphatases". Science Signaling. ج. 10 ع. 474: eaag1796. DOI:10.1126/scisignal.aag1796. PMID:28400531. S2CID:41041971.
  20. ^ Byrne DP، Foulkes DM، Eyers PA (يناير 2017). "Pseudokinases: update on their functions and evaluation as new drug targets". Future Medicinal Chemistry. ج. 9 ع. 2: 245–265. DOI:10.4155/fmc-2016-0207. PMID:28097887.
  21. ^ Bailey FP، Byrne DP، McSkimming D، Kannan N، Eyers PA (يناير 2015). "Going for broke: targeting the human cancer pseudokinome". The Biochemical Journal. ج. 465 ع. 2: 195–211. DOI:10.1042/BJ20141060. PMID:25559089.
  22. ^ Cowan-Jacob SW، Jahnke W، Knapp S (أبريل 2014). "Novel approaches for targeting kinases: allosteric inhibition, allosteric activation and pseudokinases". Future Medicinal Chemistry. ج. 6 ع. 5: 541–61. DOI:10.4155/fmc.13.216. PMID:24649957.
  23. ^ Foulkes DM، Byrne DP، Bailey FP، Eyers PA (أكتوبر 2015). "Tribbles pseudokinases: novel targets for chemical biology and drug discovery?". Biochemical Society Transactions. ج. 43 ع. 5: 1095–103. DOI:10.1042/BST20150109. PMID:26517930.
  24. ^ Cui J، Zhu Q، Zhang H، Cianfrocco MA، Leschziner AE، Dixon JE، Xiao J (أبريل 2017). "Structure of Fam20A reveals a pseudokinase featuring a unique disulfide pattern and inverted ATP-binding". eLife. ج. 6. DOI:10.7554/eLife.23990. PMC:5413348. PMID:28432788.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  25. ^ Cui J، Xiao J، Tagliabracci VS، Wen J، Rahdar M، Dixon JE (مارس 2015). "A secretory kinase complex regulates extracellular protein phosphorylation". eLife. ج. 4: e06120. DOI:10.7554/eLife.06120. PMC:4421793. PMID:25789606.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  26. ^ Tagliabracci VS، Wiley SE، Guo X، Kinch LN، Durrant E، Wen J، Xiao J، Cui J، Nguyen KB، Engel JL، Coon JJ، Grishin N، Pinna LA، Pagliarini DJ، Dixon JE (يونيو 2015). "A Single Kinase Generates the Majority of the Secreted Phosphoproteome". Cell. ج. 161 ع. 7: 1619–32. DOI:10.1016/j.cell.2015.05.028. PMC:4963185. PMID:26091039.