تعمل المنظمة في إطار مناهضة التعذيب وسائر ضروب المعاملة القاسية واللاإنسانية أو المهينة.
تتركز الأمانة العامة للمنظمة في العاصمة السويسرية جنيف، وتعنى بتوفير المساعدة لضحايا التعذيب على المستوى القانوني والنفسي والطبي إلى غير ذلك، هذا فضلا عن كونها تنسق بين مختلف الناشطين في مختلف أنحاء العالم وذلك بهدف التدخل السريع لحماية المواطنين ومكافحة الإفلات من العقاب، كما توفر برامج دعم خاصة لبعض الفئات المستضعفة مثل النساء والأطفال، ومن جهة ثانية تعمل على تقديم البلاغات الخاصة وتوجيه التقارير البديلة للأمم المتحدة عبر مشاركتها في جلسات مجلس حقوق الإنسان والهيئات المنبثقة عنها، كما تحرص على المشاركة الفعالة في تطوير المعايير الدولية لحماية حقوق الإنسان.
المنظمة الدولية لمناهضة التعذيب تتمتع بالمركز الاستشاري لدى المؤسسات التالية: المجلس الاقتصادي والاجتماعي للأمم المتحدة، منظمة العمل الدولية، اللجنة الأفريقية لحقوق الإنسان والشعوب، المنظمة الدولية للفرنكوفونيةومجلس أوروبا.
