لجنة تسمية الجينات هيوغو
| المحتويات | |
|---|---|
| الوصف | HGNC مسؤولة على المصادقة على رموز فريدة وأسماء المواقع الصبغوية البشرية، بما فيها الجينات المرمِّزة للبروتين، جينات الرنا والجينات الزائفة، لتمكين التواصل غير المبهم بين العلماء. |
| نوع البيانات | تسمية الجينات [الإنجليزية] |
| الكائنات | الإنسان |
| العناوين | |
| مركز الأبحاث | EMBL-EBI, UK; |
| الوصول | |
| الموقع | www www |
| رابط التحميل | Statistics & Downloads Custom Downloads HGNC Biomart |
| خدمة ويب URL | rest |
| الأدوات | |
| ويب | HGNC Comparison of Orthology Predictions,[1][2] Search |
| متنوعات | |
| Curation policy | نعم |
لجنة تسمية الجينات هيوغو واختصارا (HGNC) هي لجنة تابعة لمنظمة الجينوم البشري (HUGO) تعمل على تحديد معايير تسمية الجينات [الإنجليزية] البشرية. تُصادق HGNC على اسم فريد ذو معنى لكل جين بشري معروف،[3][4] استنادا على استطلاع لرأي الخبراء. فضلا على الإسم الذي يكون عادة بطول كلمة إلى 10 كلمات، تعين اللجنة رمزا (مجموعة قصيرة من المحارف) لكل جين. كما هو الحال مع رموز نظام الوحدات الدولي، رمز الجين مثل الاختصار لكنه أزيد من ذلك ويمكن اعتباره اسما ثانيا فريدا يمكن استخدامه في حد ذاته كأنه بديل للاسم الطويل. رمز الجين ليس بالضرورة "نحطا" (Acronym) للحروف الأولى من كلمات الاسم الطويل، لكن العديد من رموز الجينات هي كذلك.
إرشادات التسمية[عدل]
نشرت لجنة HGNC أحدث إرشادات تسمية الجينات البشرية في 2020[4] ويمكن اختصارها كالتالي:[5]
- رموز الجينات يجب أن تكون فريدة.
- يجب أن لا تحتوي الرموز سوى على حروف لاتينية وأرقام عربية.
- يجب أن لا تحتوي الرموز على ترقيم أو "G" اختصار لـgene.
- يجب أن لا تحتوي الرموز على إشارات إلى الأنواع التي تُرمز فيها مثل "H/h" التي تشير إلى بشري human.
صرحت HGNC أن "تسمية الجينات يجب أن تتطور مع التكنولوجيا الجديدة بدل أن تكون مقيدة، كما يحدث في بعض الأحيان حين يُطبق نظامي تسمية واحد تاريخي والآخر نظام تسمية جين واحد."[6] أصدرت HGNC كذلك إرشادات لأنواع مخصصة من المواقع الصبغوية مثل المواقع الراجعة الذاتية،[7] المتغيرات البنيوية، والرنا غير المشفر.[8][9][10]
روابط خارجية[عدل]
مراجع[عدل]
- ^ Wright MW، Eyre TA، Lush MJ، Povey S، Bruford EA (نوفمبر 2005). "HCOP: the HGNC comparison of orthology predictions search tool". Mammalian Genome. ج. 16 ع. 11: 827–8. DOI:10.1007/s00335-005-0103-2. PMID:16284797. S2CID:1091618.
- ^ Eyre TA، Wright MW، Lush MJ، Bruford EA (يناير 2007). "HCOP: a searchable database of human orthology predictions". Briefings in Bioinformatics. ج. 8 ع. 1: 2–5. DOI:10.1093/bib/bbl030. PMID:16951416.
- ^ "About the HGNC | HUGO Gene Nomenclature Committee". مؤرشف من الأصل في 2023-03-26.
- ^ أ ب Bruford، Elspeth A.؛ Braschi، Bryony؛ Denny، Paul؛ Jones، Tamsin E. M.؛ Seal، Ruth L.؛ Tweedie، Susan (أغسطس 2020). "Guidelines for human gene nomenclature". Nature Genetics. ج. 52 ع. 8: 754–758. DOI:10.1038/s41588-020-0669-3. PMC:7494048. PMID:32747822.
- ^ "HGNC Guidelines | HUGO Gene Nomenclature Committee". www.genenames.org. مؤرشف من الأصل في 2023-05-12. اطلع عليه بتاريخ 2021-04-26.
- ^ Shows TB، McAlpine PJ، Boucheix C، Collins FS، Conneally PM، Frézal J، وآخرون (1987). "Guidelines for human gene nomenclature. An international system for human gene nomenclature (ISGN, 1987)" (PDF). Cytogenetics and Cell Genetics. ج. 46 ع. 1–4: 11–28. DOI:10.1159/000132471. PMC:7494048. PMID:3507270. مؤرشف من الأصل (PDF) في 2022-10-21.
- ^ Mayer J، Blomberg J، Seal RL (مايو 2011). "A revised nomenclature for transcribed human endogenous retroviral loci". Mobile DNA. ج. 2 ع. 1: 7. DOI:10.1186/1759-8753-2-7. PMC:3113919. PMID:21542922.
{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Wright MW، Bruford EA (يناير 2011). "Naming 'junk': human non-protein coding RNA (ncRNA) gene nomenclature". Human Genomics. ج. 5 ع. 2: 90–8. DOI:10.1186/1479-7364-5-2-90. PMC:3051107. PMID:21296742.
{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Wright MW (أبريل 2014). "A short guide to long non-coding RNA gene nomenclature". Human Genomics. ج. 8 ع. 1: 7. DOI:10.1186/1479-7364-8-7. PMC:4021045. PMID:24716852.
{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ Seal R، Chen L، Griffiths-Jones S، Lowe TM، Mathews MB، O'Reilly D، Pierce AJ، Stadler PF، Ulitsky I، Wolin SL، Bruford EA (فبراير 2020). "A guide to naming human non-coding RNA genes". EMBO J. ج. 39 ع. 6: e103777. DOI:10.15252/embj.2019103777. PMC:7073466. PMID:32090359.
