مثنوي البيريميدين

من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
تكون رابطة مثنويات الثايمين في الدنا، يسبب الفوتون ترابط قاعدتين متجاورتين في سلسلة دنا واحدة مدمرا الترابط القاعدي العادي بين السلسلتين في تلك المنطقة.

مثنوي البيريميدين هي روابط جزيئية تتشكل بين قواعد الثايمين أو السايتوسين المتجاورة نتيجة تفاعلات كيمياء ضوئية [1][2]، حيث تسبب الأشعة فوق البنفسجية تشكل روابط تساهمية بتفاعلات تحدث في الروابط C=C المزدوجة.[3] يمكن أن تتراكم مثنويات اليوراسيل في الرنا مزدوج السلاسل كنتيجة لإشعاعات فوق بنفسجية، ناتِجا الأشعة فوق البنفسجية الأكثر شيوعا هما: مثنويات البيريميدين حلقي البوتان (CPDs)، بما في ذلك مثنويات الثيميدين) والمنتجات الضوئية (4,6). تغير هذه الروابط المطفرة بنية الدنا وكنتيجة لذلك تمنع البوليميرازات من العمل وتعطل التضاعف، يمكن ترميم المثنويات بواسطة الاستنشاط الضوئي أو ترميم استئصال النوكليوتيد، لكن المثنويات غير المرممة مطفِّرة. مثنويات البيريميدين هي السبب الرئيسي للميلانوما لدى البشر.

أنواع المثنويات[عدل]

مثال على مثنوي الثايمين المنتج بفعل الضوء، ناتج 4,6 (يسار)، وحلقي البوتان (يمين).

مثنوي البيريميدين حلقي البوتان (CPD) يحتوي حلقة رباعية الذرات تنتج من تزواج رابطتي C=C مزدوجتين للبيريميدَيْن [4][5][6]، هذه المثنويات تتدخل في ترابط القواعد أثناء تضاعف الدنا مسببة طفرات.

المنتجات الضوئية (4,6)، أو 4,6 بيريميدين-بيريميدونات تظهر بمعدل ثلث ظهور مثنويات البيريميدين حلقي البوتان لكنها أكثر تطفيرا.[7] يقدم لياز بوغ الناتج الضوئي مسارا إنزيميا لترميم مثنويات الثايمين المنتجة بفعل الضوء.[8]

تطفير[عدل]

تُحدِث بوليمرازات الترجمة بشكل شائع طفرات عند مثنويات البيريميدين، لدى كل من بدائيات (استجابة SOS) وحقيقيات النوى. كون مثنويات البيريميدين حلقي البوتان ثايمين-ثايمين (مثنويات الثايمين) هي الروابط الأكثر تواترا التي تسببها الأشعة فوق البنفسجية فإن بوليمرازات الترجمة منحازة نحو تقديم جزيئات أدينين، لكي تتم مضاعفة مثنويات TT بشكل صحيح، لكن من جهة أخرى أي تواجد لمثنويات السايتوسين يعرضها لنزع الأمين وهذا يسبب انتقال C إلى T.[9]

ترميم الدنا[عدل]

الميلانوما نوع من سرطان الجلد.

تسبب مثنويات البيريميدين تغيرات محلية في بنية الدنا، وهذا يسمح لإنزيمات الترميم بالتعرف على على الروابط وإصلاحها.[10] يمكن لدى معظم الكائنات (باستثناء المشيميات مثل الإنسان) ترميم المثنويات بواسطة الاستنشاط الضوئي [11]، وهي عملية تقوم فيها إنزيمات لياز الضوء (فوتولياز) بعكس مثنويات البيريميدين حلقي البوتان مباشرة عبر تفاعلات كيمياء ضوئية، حيث تتعرف هذه الإنزيمات على الروابط، ويتبع ذلك امتصاص لأمواج الضوء > 300 نانومتر (كمثال الفلورية، أشعة الشمس)، يمكِّن هذا الامتصاص تفاعلات الضوء الكيميائية من الحدوث ما ينتج عنه إزالة لمثنويات البيريميدين وإعادتها إلى حالتها الأصلية.[12]

ترميم استئصال النوكليوتيد هي آلية أكثر عمومية لإصلاح الروابط، حيث تقوم الآلية بإزالة مثنويات البيريميدين واصطناع دنا جديد لاستبداله في المنطقة المتضررة بالجزيء.[12] جفاف الجلد المصطبغ هو مرض جيني لدى البشر تتسبب فيه قلة أو انعدام ترميم استئصال النوكليوتيد وينتج عنه تغير في لون الجلد والعديد من الأورام عند التعرض للأشعة فوق البنفسجية. مثنويات البيريميدين غير المرممة تسبب الميلانوما لدى البشر.[13]

مراجع[عدل]

  1. ^ David S. Goodsell (2001). "The Molecular Perspective: Ultraviolet Light and Pyrimidine Dimers". The Oncologist. ج. 6 ع. 3: 298–299. DOI:10.1634/theoncologist.6-3-298. PMID:11423677. مؤرشف من الأصل في 2009-04-30.
  2. ^ E. C. Friedberg؛ G. C. Walker؛ W. Siede؛ R. D. Wood؛ R. A. Schultz؛ T. Ellenberger (2006). DNA repair and mutagenesis. Washington: ASM Press. ص. 1118. ISBN:978-1-55581-319-2. {{استشهاد بكتاب}}: الوسيط غير المعروف |last-author-amp= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  3. ^ S. E. Whitmore؛ C. S. Potten؛ C. A. Chadwick؛ P. T. Strickland؛ W. L. Morison (2001). "Effect of photoreactivating light on UV radiation-induced alterations in human skin". Photodermatol. Photoimmunol. Photomed. ج. 17 ع. 5: 213–217. DOI:10.1034/j.1600-0781.2001.170502.x. PMID:11555330.
  4. ^ R. B. Setlow (1966). "Cyclobutane-Type Pyrimidine Dimers in Polynucleotides". Science. ج. 153 ع. 3734: 379–386. DOI:10.1126/science.153.3734.379. PMID:5328566.
  5. ^ Expert reviews in molecular medicine (2 ديسمبر 2002). "Structure of the major UV-induced photoproducts in DNA" (PDF). Cambridge University Press. مؤرشف من الأصل (PDF) في 2005-03-21.
  6. ^ Christopher Mathews؛ K.E. Van Holde (1990). Biochemistry (ط. 2nd). Benjamin Cummings Publication. ص. 1168. ISBN:978-0-8053-5015-9. مؤرشف من الأصل في 2019-12-17. {{استشهاد بكتاب}}: الوسيط غير المعروف |last-author-amp= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  7. ^ Van Holde, K. E.؛ Mathews, Christopher K. (1990). Biochemistry. Menlo Park, Calif: Benjamin/Cummings Pub. Co. ISBN:0-8053-5015-2. مؤرشف من الأصل في 2019-12-17.
  8. ^ Jeffrey M. Buis؛ Jennifer Cheek؛ Efthalia Kalliri؛ Joan B. Broderick (2006). "Characterization of an Active Spore Photoproduct Lyase, a DNA Repair Enzyme in the Radical S-Adenosylmethionine Superfamily". Journal of Biological Chemistry. ج. 281 ع. 36: 25994–26003. DOI:10.1074/jbc.M603931200. PMID:16829680. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |last-author-amp= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  9. ^ J. H. Choi؛ A. Besaratinia؛ D. H. Lee؛ C. S. Lee؛ G. P. Pfeifer (2006). "The role of DNA polymerase iota in UV mutational spectra". Mutat. Res. ج. 599 ع. 1–2: 58–65. DOI:10.1016/j.mrfmmm.2006.01.003. PMID:16472831.
  10. ^ Kemmink Johan؛ Boelens Rolf؛ Koning Thea M.G.؛ Kaptein Robert؛ Van, der Morel Gijs A.؛ Van Boom Jacques H. (1987). "Conformational Changes in the oligonucleotide duplex d(GCGTTGCG)•d(GCGAAGCG) induced by formation of a cissyn thymine dimer". European Journal of Biochemistry. ج. 162: 31–43. DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb10538.x. PMID:3028790.
  11. ^ Essen LO، Klar T (2006). "Light-driven DNA repair by photolyases". Cell Mol Life Sci. ج. 63 ع. 11: 1266–77. DOI:10.1007/s00018-005-5447-y. PMID:16699813.
  12. ^ أ ب Friedberg, Errol C. (23 January 2003) "DNA Damage and Repair". Nature 421, 436-439. دُوِي:10.1038/nature01408
  13. ^ Vink Arie A.؛ Roza Len (2001). "Biological consequences of cyclobutane pyrimidine dimers". Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology. ج. 65 ع. 2–3: 101–104. DOI:10.1016/S1011-1344(01)00245-7.