يتكون علم أرخبيل ماديرا من ثلاثة ألوان الرأسية أزرق-ذهبي-أزرق مع صليب المسيح الأبيض في المركز ويحده اللون الأحمر، في إشارة إلى أنه تم اكتشافها من قبل اثنين من فرسان هنري الملاح: جواو غونسالفيس زاركو وتريستاو فاز تيكسيرا؛ كرمز لاتصالها بالجمهورية البرتغالية. وقد زعم الكثيرون أن تصميمه مستوحى من علم جبهة تحرير أرخبيل ماديرا المنحلة الآن.
اُعتُمِد علم جزر ماديرا الحالي في 28 تموز - يوليو من سنة 1978.
1 كُلياً داخل آسيا، ولكن تاريخياً مصنفة كأوروبية. 2 جزئياً أو كل داخل آسيا، حسب الحدود. 3 معظم أراضيها في آسيا.
4 جغرافياً هي جزء من أفريقيا، ولكن تاريخياً مصنفة كأوروبية.
