بروتياز الأسبارتيك
 | هذه مقالة غير مراجعة. (ديسمبر 2020) |
| بروتياز الأسبارتيل حقيقي النواة | |
|---|---|
| |
| هيكل الأنزيم البروتيني الأسبارتيك ، بروتياز فيروس نقص المناعة البشرية (HIV) باللونين الأبيض والرمادي ، مع الركيزة الببتيدية باللون الأسود والسلاسل الجانبية النشطة للأسبارتات باللون الأحمر. (PDB: 1KJF) | |
| معرف | |
| رمز | Asp |
| قاعدة بيانات عوائل البروتينات | PF00026 |
| إنتربرو | IPR001461 |
| بروسايت | PDOC00128 |
| قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات | 1mpp |
| قاعدة بيانات توجهات البروتينات في الأغشية | 100 |
| قاعدة بيانات توجهات البروتينات في الأغشية | 1lyb |
بروتياز الأسبارتيك: هو نوع محفز من إنزيمات البروتياز ,و التي تستخدم جزيء ماء منشط مرتبط بواحدة أو أكثر من بقايا الأسبارتات لتحفيز ركائزها الببتيدية. بالإضافة إلى هذا، لديهم اثنين من الأسبارتات المحفوظة بشكل كبير في الموقع النشط وتنشط على النحو الأمثل في درجة الحموضة (pH) الحمضية. بالرغم من هذا يتم تثبيط جميع البروتياز الأسبارتيل المعروفة تقريبًا بواسطة البيبستاتين . [1]
الأسبارتيك ( ر.ت.إ 3.4.23. ) من أصل فقاري وفطري وفيروسي. [2] في الآونة الأخيرة، تم ربط الأسبارتيك بمعالجة نوع البكتيريا 4 prepilin [3] و archaean preflagellin. [4] [5]
يحتوي بروتياز الأسبارتيك حقيقي النواة على البيبسين والكثيبسين والرينين. يحتوي بروتايز الاسبارتيك على بنية ذات قسمين Retroviral وretrotransposon protease. من المحتمل أن يكون أحد الاقسام قد تطور من الآخر من خلال حدث ازدواج جيني في الماضي البعيد.
في الإنزيمات الحديثة، على الرغم من أن الهياكل ثلاثية الأبعاد متشابهة جدًا، إلا أن تسلسل الأحماض الأمينية أكثر اختلافا، باستثناء شكل موقع التحفيز، والذي لا يتغير كثيرا.
آلية التحفيز
[عدل]
بروتياز الأسبارتيل هو عائلة واحدة محددة للغاية من البروتياز - تميل إلى شق روابط ثنائية الببتيد التي تحتوي على بقايا كارهة للماء(hydrophobic) بالإضافة إلى، مجموعة بيتا ميثيلين. على عكس البروتياز السيرين أو السيستين ، فإن هذه البروتياز لا يشكل وسيطًا تساهميًا أثناء الانقسام. لهذا السبب يحدث تحلل البروتين في خطوة واحدة فقط.
تم اقتراح عدد من الآليات المختلفة لبروتياز الأسبارتيل، ولكن الطريقة الأكثر قبولًا هي آلية القاعدة والحمض العامة التي تتضمن تناسق جزيء الماء بين اثنين من بقايا الأسبارتات المحفوظة للغاية. [6] [7] يقوم أحد انزيمات الأسبارتات بتنشيط الماء عن طريق استخلاص البروتون، مما يمكّن الماء من تنفيذ هجوم محب للنيوكليوفيليك على كربون الكربونيل المركزي، مما يؤدي إلى توليد وسيط أكسانيون رباعي الهيدرالية يستقر عن طريق الرابطة الهيدروجينية مع حمض الأسبارتيك الثاني.
تثبيط
[عدل]البيبستاتين هو مثبط لبروتياز الأسبارتات. [1]
التصنيف
[عدل]هناك خمس عائلات كبيرة معروفة من بروتياز الأسبارتيك، كل من هده العائلات يمثل تطورًا مستقلاً لنفس الموقع والآليات النشطة . تحتوي كل عائلة كبيرة على عدة عائلات ذات تسلسلات متشابهة. يقوم تصنيف MEROPS بتسمية هذه العائلات أبجديًا. كما هو موجود في الاسفل:
- عائلة AA (على سبيل المثال عائلة البيبسين )
- عائلة AC (على سبيل المثال عائلة Signal peptidase II )
- عائلة AD (على سبيل المثال عائلة بريسينلين )
- عائلة AE (على سبيل المثال عائلة GPR إندوبيبتيداز )
- عائلة AF (على سبيل المثال عائلة Omptin )
بروبيبتيد
[عدل]| A1_بروبتيد | |
|---|---|
| |
| الهياكل البلورية والجزيئية للبروجاستريسين البشري بدقة 1.62 أنجستروم | |
| معرف | |
| رمز | A1_بروبتيد |
| قاعدة بيانات عوائل البروتينات | PF07966 |
| إنتربرو | IPR012848 |
يتم تصنيع العديد من endopeptidases الاسبارتيك حقيقية النواة (عائلة MEROPS peptidase A1)يتم تصنيعها مع الإشارة والبروببتيدات . تشكل بروبتيدات إندوبيبتيداز الشبيهة بالبيبسين عائلة متميزة من البروببتيدات، والتي تحتوي على نموذج محفوظ يبلغ طوله حوالي 30 بقايا. في الببسينوجين A ، يتم تبديل أول 11 بقايا من تسلسل البيبسين الناضج بواسطة بقايا البروببتيد. والبروببتيد يحتوي على اثنين من اللوالب الحلزونية التي تعمل على تثبيط الموقع النشط cleft.
أمثلة
[عدل]بشري
[عدل]- BACE1 ، BACE2
- كاثيبسين د
- كاثيبسين إي
- الكيموسين (أو "رينين")
- نابسين أ
- نيبينثيسين
- بيبسين
- بريسنيلين
- رينين
البروتينات البشرية التي تحتوي على هذا المجال
[عدل]هناك العديد من الامثلة مثل ؛ CTSD . CTSE ؛. PGA5 ؛ PGC . REN ؛BACE1، نابسا , BACE2
كائنات أخرى
[عدل]- بروتياز HIV-1 - هدف دوائي رئيسي لعلاج فيروس نقص المناعة البشرية
- Plasmepsin - وجدت مجموعة من البروتياز aspartyl في الملاريا -causing طفيل البلازموديوم
انظر أيضًا
[عدل]- البروتياز الجلوتاميك
- خريطة تحلل البروتين
المراجع
[عدل]- ^ ا ب "Chapter 8 - Cathepsin D". Handbook of Proteolytic Enzymes (بالإنجليزية) (Third ed.). Academic Press. 1 Jan 2013. pp. 54–63. DOI:10.1016/b978-0-12-382219-2.00008-9. ISBN:978-0-12-382219-2.
- ^ "The aspartic proteases". Scandinavian Journal of Clinical and Laboratory Investigation. Supplementum. ج. 210: 5–22. 1992. DOI:10.3109/00365519209104650. PMID:1455179.
- ^ "The type 4 prepilin peptidases comprise a novel family of aspartic acid proteases". The Journal of Biological Chemistry. ج. 275 ع. 2: 1502–10. يناير 2000. DOI:10.1074/jbc.275.2.1502. PMID:10625704.
{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link) - ^ "Archaeal flagella, bacterial flagella and type IV pili: a comparison of genes and posttranslational modifications". Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. ج. 11 ع. 3–5: 167–91. 2006. DOI:10.1159/000094053. PMID:16983194.
- ^ "Cleavage of preflagellins by an aspartic acid signal peptidase is essential for flagellation in the archaeon Methanococcus voltae". Molecular Microbiology. ج. 50 ع. 4: 1339–47. نوفمبر 2003. DOI:10.1046/j.1365-2958.2003.03758.x. PMID:14622420.
- ^ ا ب "Binding of a reduced peptide inhibitor to the aspartic proteinase from Rhizopus chinensis: implications for a mechanism of action". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 84 ع. 20: 7009–13. أكتوبر 1987. Bibcode:1987PNAS...84.7009S. DOI:10.1073/pnas.84.20.7009. PMC:299218. PMID:3313384.
- ^ "HIV-1 protease: mechanism and drug discovery". Organic & Biomolecular Chemistry. ج. 1 ع. 1: 5–14. يناير 2003. DOI:10.1039/b208248a. PMID:12929379.
روابط خارجية
[عدل]- قاعدة بيانات MEROPS على الإنترنت للببتيدات ومثبطاتها: Aspartic Peptidases
- Aspartic+Endopeptidases في المكتبة الوطنية الأمريكية للطب نظام فهرسة المواضيع الطبية (MeSH).
- عائلة MEROPS A1
- هذه المَقالة تَشتمل على نَص من المِلكية العامة لِـ بفام وَإنتربرو IPR000036.
- هذه المَقالة تَشتمل على نَص من المِلكية العامة لِـ بفام وَإنتربرو IPR012848.
