LDB1

LDB1
التراكيب المتوفرة بنك بيانات البروتين Ortholog search: PDBe RCSB قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين 2XJY, 2XJZ, 2YPA
المعرفات
الأسماء المستعارة	LDB1, CLIM2, NLI, CLIM-2, LDB-1, LIM domain binding 1
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 603451 MGI: MGI:894762 HomoloGene: 2891 GeneCards: 8861
علم الوجود الجيني الوظيفة الجزيئية • ربط دي إن إي • protein homodimerization activity • ‏GO:0001106 transcription corepressor activity • LIM domain binding • chromatin binding • RNA polymerase II activating transcription factor binding • protein self-association • ‏GO:0001948 ربط بروتيني • ‏GO:0001158 core promoter proximal region sequence-specific DNA binding • enzyme binding • ‏GO:0001104 transcription coregulator activity المكونات الخلوية • transcription regulator complex • nuclear chromatin • نواة • cell leading edge • بلازم نووي • beta-catenin-TCF complex • macromolecular complex العمليات الحيوية • hair follicle development • transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • epithelial structure maintenance • ضبط نسخ الدنا • positive regulation of hemoglobin biosynthetic process • somatic stem cell population maintenance • ضبط النسخ انطلاقاً من محفز بوليميراز الرنا الثاني • gastrulation with mouth forming second • cerebellar Purkinje cell differentiation • regulation of DNA-templated transcription, elongation • head development • histone H3-K4 acetylation • بروتين دبيلو.أن.تي • transcription from RNA polymerase II promoter • نسخ الدنا • cerebellum development • negative regulation of erythrocyte differentiation • نمو متعدد الخلايا • neuron differentiation • anterior/posterior axis specification • cellular component assembly • negative regulation of transcription, DNA-templated • ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني • positive regulation of cell adhesion • regulation of focal adhesion assembly • regulation of cell migration • regulation of kinase activity • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
الأنواع	الإنسان	الفأر
أنتريه	8861	16825
Ensembl	ENSG00000198728	ENSMUSG00000025223
يونيبروت	Q86U70	P70662
RefSeq (مرسال ر.ن.ا.)	‏NM_003893، ‏NM_001321612، ‏XM_017016867، ‏XM_017016868، ‏XM_017016869، ‏XR_001747255 NM_001113407، ‏NM_003893، ‏NM_001321612، ‏XM_017016867، ‏XM_017016868، ‏XM_017016869، ‏XR_001747255	‏NM_010697، ‏XM_006526723، ‏NM_001360336، ‏XM_030250759، ‏XM_030250760 NM_001113408، ‏NM_010697، ‏XM_006526723، ‏NM_001360336، ‏XM_030250759، ‏XM_030250760
RefSeq (بروتين)	‏NP_001308541، ‏NP_003884، ‏XP_016872356، ‏XP_016872357، ‏XP_016872358 NP_001106878، ‏NP_001308541، ‏NP_003884، ‏XP_016872356، ‏XP_016872357، ‏XP_016872358	‏NP_034827، ‏XP_006526786، ‏NP_001347265، ‏XP_030106619، ‏XP_030106620 NP_001106879، ‏NP_034827، ‏XP_006526786، ‏NP_001347265، ‏XP_030106619، ‏XP_030106620
الموقع (UCSC	n/a	Chr 19: 46.03 – 46.05 Mb
بحث ببمد	[1]	[2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان اعرض/عدّل فأر

LDB1‏ (LIM domain binding 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين LDB1 في الإنسان.

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل، ساهم بتحريره.

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل، ساهم بتحريره.

قراءة متعمقة

• Osada H, Grutz GG, Axelson H, et al. (1997). "LIM-only protein Lmo2 forms a protein complex with erythroid transcription factor GATA-1". Leukemia. 11 Suppl 3: 307–12. PMID 9209374.
• Wadman IA, Osada H, Grütz GG, et al. (1997). "The LIM-only protein Lmo2 is a bridging molecule assembling an erythroid, DNA-binding complex which includes the TAL1, E47, GATA-1 and Ldb1/NLI proteins". EMBO J. 16 (11): 3145–57. doi:10.1093/emboj/16.11.3145. PMC 1169933. PMID 9214632.
• Jurata LW, Gill GN (1997). "Functional analysis of the nuclear LIM domain interactor NLI". Mol. Cell. Biol. 17 (10): 5688–98. PMC 232417. PMID 9315627.
• Visvader JE, Mao X, Fujiwara Y, et al. (1998). "The LIM-domain binding protein Ldb1 and its partner LMO2 act as negative regulators of erythroid differentiation". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (25): 13707–12. Bibcode:1997PNAS...9413707V. doi:10.1073/pnas.94.25.13707. PMC 28370. PMID 9391090.
• Jurata LW, Pfaff SL, Gill GN (1998). "The nuclear LIM domain interactor NLI mediates homo- and heterodimerization of LIM domain transcription factors". J. Biol. Chem. 273 (6): 3152–7. doi:10.1074/jbc.273.6.3152. PMID 9452425.
• Kenny DA, Jurata LW, Saga Y, Gill GN (1998). "Identification and characterization of LMO4, an LMO gene with a novel pattern of expression during embryogenesis". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (19): 11257–62. Bibcode:1998PNAS...9511257K. doi:10.1073/pnas.95.19.11257. PMC 21629. PMID 9736723.
• Valge-Archer V, Forster A, Rabbitts TH (1999). "The LMO1 and LDB1 proteins interact in human T cell acute leukaemia with the chromosomal translocation t(11;14)(p15;q11)". Oncogene. 17 (24): 3199–202. doi:10.1038/sj.onc.1202353. PMID 9872335.
• Ueki N, Seki N, Yano K, et al. (1999). "Isolation and chromosomal assignment of human genes encoding cofactor of LIM homeodomain proteins, CLIM1 and CLIM2". J. Hum. Genet. 44 (2): 112–5. doi:10.1007/s100380050120. PMID 10083735.
• Drechsler M, Schumacher V, Friedrich S, et al. (2000). "Genomic structure, alternative transcripts and chromosome location of the human LIM domain binding protein 1 gene LDB1". Cytogenet. Cell Genet. 87 (1–2): 119–24. doi:10.1159/000015377. PMID 10640831.
• Dreyer SD, Morello R, German MS, et al. (2000). "LMX1B transactivation and expression in nail-patella syndrome". Hum. Mol. Genet. 9 (7): 1067–74. doi:10.1093/hmg/9.7.1067. PMID 10767331.
• Sum EY, Peng B, Yu X, et al. (2002). "The LIM domain protein LMO4 interacts with the cofactor CtIP and the tumor suppressor BRCA1 and inhibits BRCA1 activity". J. Biol. Chem. 277 (10): 7849–56. doi:10.1074/jbc.M110603200. PMID 11751867.
• Ostendorff HP, Peirano RI, Peters MA, et al. (2002). "Ubiquitination-dependent cofactor exchange on LIM homeodomain transcription factors". Nature. 416 (6876): 99–103. Bibcode:2002Natur.416...99O. doi:10.1038/416099a. PMID 11882901.
• Deane JE, Visvader JE, Mackay JP, Matthew JM (2003). "1H, 15N and 13C assignments of FLIN4, an intramolecular LMO4:ldb1 complex". J. Biomol. NMR. 23 (2): 165–6. doi:10.1023/A:1016363414644. PMID 12153047.
• Chen L, Segal D, Hukriede NA, et al. (2002). "Ssdp proteins interact with the LIM-domain-binding protein Ldb1 to regulate development". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (22): 14320–5. Bibcode:2002PNAS...9914320C. doi:10.1073/pnas.212532399. PMC 137882. PMID 12381786.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• van Meyel DJ, Thomas JB, Agulnick AD (2003). "Ssdp proteins bind to LIM-interacting co-factors and regulate the activity of LIM-homeodomain protein complexes in vivo". Development. 130 (9): 1915–25. doi:10.1242/dev.00389. PMID 12642495.
• Deane JE, Mackay JP, Kwan AH, et al. (2003). "Structural basis for the recognition of ldb1 by the N-terminal LIM domains of LMO2 and LMO4". EMBO J. 22 (9): 2224–33. doi:10.1093/emboj/cdg196. PMC 156068. PMID 12727888.
• Marini M, Bongers EM, Cusano R, et al. (2004). "Confirmation of CLIM2/LMX1B interaction by yeast two-hybrid screening and analysis of its involvement in nail-patella syndrome". Int. J. Mol. Med. 12 (1): 79–82. doi:10.3892/ijmm.12.1.79. PMID 12792813.

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. شارك في تحريرها.