ATG16L1

ATG16L1
التراكيب المتوفرة بنك بيانات البروتين Ortholog search: PDBe RCSB قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين 4GDK, 4GDL, 4NAW, 4TQ0, 5D7G
المعرفات
الأسماء المستعارة	ATG16L1, autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae), APG16L, ATG16A, ATG16L, IBD10, WDR30, autophagy related 16 like 1
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 610767 MGI: MGI:1924290 HomoloGene: 41786 GeneCards: 55054
علم الوجود الجيني الوظيفة الجزيئية • ubiquitin-like protein transferase activity • ‏GO:0001948 ربط بروتيني • identical protein binding • GTPase binding المكونات الخلوية • سيتوبلازم • autophagosome • ‏GO:0035085 خيط محوري • عصارة خلوية • pre-autophagosomal structure membrane • autophagosome membrane • غشاء العمليات الحيوية • protein transport • التهام ذاتي • negative stranded viral RNA replication • protein homooligomerization • macroautophagy • autophagosome assembly • protein localization to pre-autophagosomal structure • protein lipidation involved in autophagosome assembly • xenophagy • positive regulation of autophagy المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
الأنواع	الإنسان	الفأر
أنتريه	55054	77040
Ensembl	‏ENSG00000085978;db=core ENSG00000281089، ‏ENSG00000085978	ENSMUSG00000026289
يونيبروت	Q676U5 A0A024R494	Q8C0J2
RefSeq (مرسال ر.ن.ا.)	‏NM_001190267، ‏NM_017974، ‏NM_030803، ‏NM_198890، ‏XM_005246084، ‏XM_005246086، ‏XM_006712608، ‏XR_241242، ‏XR_001738801، ‏NM_001363742 NM_001190266، ‏NM_001190267، ‏NM_017974، ‏NM_030803، ‏NM_198890، ‏XM_005246084، ‏XM_005246086، ‏XM_006712608، ‏XR_241242، ‏XR_001738801، ‏NM_001363742	‏NM_001205392، ‏NM_029846، ‏XR_387198، ‏XR_003947274، ‏XR_003947275، ‏XR_003947276 NM_001205391، ‏NM_001205392، ‏NM_029846، ‏XR_387198، ‏XR_003947274، ‏XR_003947275، ‏XR_003947276
RefSeq (بروتين)	‏NP_001177196، ‏NP_060444، ‏NP_110430، ‏NP_942593، ‏XP_005246141، ‏XP_005246143، ‏XP_006712671، ‏NP_001350671 NP_001177195، ‏NP_001177196، ‏NP_060444، ‏NP_110430، ‏NP_942593، ‏XP_005246141، ‏XP_005246143، ‏XP_006712671، ‏NP_001350671 NP_060444.3	‏NP_001192321، ‏NP_084122 NP_001192320، ‏NP_001192321، ‏NP_084122
الموقع (UCSC	n/a	Chr 1: 87.76 – 87.79 Mb
بحث ببمد	[1]	[2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان اعرض/عدّل فأر

ATG16L1‏ (Autophagy related 16 like 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين ATG16L1 في الإنسان.

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل، ساهم بتحريره.

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل، ساهم بتحريره.

قراءة متعمقة

• Venter JC, Adams MD, Myers EW, et al. (2001). "The sequence of the human genome". Science. 291 (5507): 1304–51. doi:10.1126/science.1058040. PMID 11181995.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Mizushima N, Kuma A, Kobayashi Y, et al. (2004). "Mouse Apg16L, a novel WD-repeat protein, targets to the autophagic isolation membrane with the Apg12-Apg5 conjugate". J. Cell Sci. 116 (Pt 9): 1679–88. doi:10.1242/jcs.00381. PMID 12665549.
• Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). "The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment". Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). "A physical and functional map of the human TNF-alpha/NF-kappa B signal transduction pathway". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038/ncb1086. PMID 14743216.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Zheng H, Ji C, Li J, et al. (2005). "Cloning and analysis of human Apg16L". DNA Seq. 15 (4): 303–5. doi:10.1080/10425170400004104. PMID 15620219.
• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
• Hampe J, Franke A, Rosenstiel P, et al. (2007). "A genome-wide association scan of nonsynonymous SNPs identifies a susceptibility variant for Crohn disease in ATG16L1". Nat. Genet. 39 (2): 207–11. doi:10.1038/ng1954. PMID 17200669.
• Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
• Prescott NJ, Fisher SA, Franke A, et al. (2007). "A nonsynonymous SNP in ATG16L1 predisposes to ileal Crohn's disease and is independent of CARD15 and IBD5". Gastroenterology. 132 (5): 1665–71. doi:10.1053/j.gastro.2007.03.034. PMID 17484864.
• Yamazaki K, Onouchi Y, Takazoe M, et al. (2007). "Association analysis of genetic variants in IL23R, ATG16L1 and 5p13.1 loci with Crohn's disease in Japanese patients". J. Hum. Genet. 52 (7): 575–83. doi:10.1007/s10038-007-0156-z. PMID 17534574.
• Baldassano RN, Bradfield JP, Monos DS, et al. (2007). "Association of the T300A non‐synonymous variant of the ATG16L1 gene with susceptibility to paediatric Crohn's disease". Gut. 56 (8): 1171–3. doi:10.1136/gut.2007.122747. PMC 1955510. PMID 17625155.

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 2 بحاجة للتوسيع. شارك في تحريرها.