SMG5

SMG5
التراكيب المتوفرة بنك بيانات البروتين Ortholog search: PDBe RCSB قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين 2HWY
المعرفات
الأسماء المستعارة	SMG5, EST1B, LPTS-RP1, LPTSRP1, SMG-5, nonsense mediated mRNA decay factor, nonsense mediated mRNA decay factor
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 610962 MGI: MGI:2447364 HomoloGene: 9095 GeneCards: 23381
علم الوجود الجيني الوظيفة الجزيئية • protein phosphatase 2A binding • histone deacetylase binding • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني • telomeric DNA binding • ubiquitin protein ligase binding • ribonuclease activity • ribonucleoprotein complex binding • telomerase RNA binding المكونات الخلوية • سيتوبلازم • عصارة خلوية • نواة • telomerase holoenzyme complex العمليات الحيوية • regulation of dephosphorylation • تفكك متوسط بلا معنى • mRNA export from nucleus • regulation of telomere maintenance • regulation of telomere maintenance via telomerase • regulation of RNA stability • RNA phosphodiester bond hydrolysis • telomere maintenance via telomerase المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
الأنواع	الإنسان	الفأر
أنتريه	23381	229512
Ensembl	ENSG00000198952	ENSMUSG00000001415
يونيبروت	Q9UPR3	Q6ZPY2
RefSeq (مرسال ر.ن.ا.)	‏NM_001323614، ‏NM_001323615، ‏NM_001323616، ‏NM_001323617 NM_015327، ‏NM_001323614، ‏NM_001323615، ‏NM_001323616، ‏NM_001323617	‏NM_178246، ‏XM_006501343، ‏XM_006501345، ‏XM_011240087، ‏XM_036163049، ‏XM_036163050، ‏XR_004941306، ‏XR_004941307 NM_173188، ‏NM_178246، ‏XM_006501343، ‏XM_006501345، ‏XM_011240087، ‏XM_036163049، ‏XM_036163050، ‏XR_004941306، ‏XR_004941307
RefSeq (بروتين)	‏NP_001310544، ‏NP_001310545، ‏NP_001310546، ‏NP_056142 NP_001310543، ‏NP_001310544، ‏NP_001310545، ‏NP_001310546، ‏NP_056142	‏XP_006501406، ‏XP_006501408، ‏XP_011238389، ‏XP_036018942، ‏XP_036018943 NP_839977، ‏XP_006501406، ‏XP_006501408، ‏XP_011238389، ‏XP_036018942، ‏XP_036018943
الموقع (UCSC	n/a	Chr 3: 88.24 – 88.27 Mb
بحث ببمد	[1]	[2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان اعرض/عدّل فأر

SMG5‏ (SMG5, nonsense mediated mRNA decay factor) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SMG5 في الإنسان.

قراءة متعمقة

• Nakajima D، Okazaki N، Yamakawa H، وآخرون (2003). "Construction of expression-ready cDNA clones for KIAA genes: manual curation of 330 KIAA cDNA clones". DNA Res. ج. 9 ع. 3: 99–106. DOI:10.1093/dnares/9.3.99. PMID:12168954.
• Kikuno R، Nagase T، Ishikawa K، وآخرون (1999). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIV. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Res. ج. 6 ع. 3: 197–205. DOI:10.1093/dnares/6.3.197. PMID:10470851.
• Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
• Ohnishi T، Yamashita A، Kashima I، وآخرون (2004). "Phosphorylation of hUPF1 induces formation of mRNA surveillance complexes containing hSMG-5 and hSMG-7". Mol. Cell. ج. 12 ع. 5: 1187–200. DOI:10.1016/S1097-2765(03)00443-X. PMID:14636577.
• Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
• Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
• Unterholzner L، Izaurralde E (2005). "SMG7 acts as a molecular link between mRNA surveillance and mRNA decay". Mol. Cell. ج. 16 ع. 4: 587–96. DOI:10.1016/j.molcel.2004.10.013. PMID:15546618.
• Fukuhara N، Ebert J، Unterholzner L، وآخرون (2005). "SMG7 is a 14-3-3-like adaptor in the nonsense-mediated mRNA decay pathway". Mol. Cell. ج. 17 ع. 4: 537–47. DOI:10.1016/j.molcel.2005.01.010. PMID:15721257.
• Azzalin CM، Lingner J (2006). "The human RNA surveillance factor UPF1 is required for S phase progression and genome stability". Curr. Biol. ج. 16 ع. 4: 433–9. DOI:10.1016/j.cub.2006.01.018. PMID:16488880.
• Gregory SG، Barlow KF، McLay KE، وآخرون (2006). "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1". Nature. ج. 441 ع. 7091: 315–21. DOI:10.1038/nature04727. PMID:16710414.
• Lee H، Sengupta N، Villagra A، وآخرون (2006). "Histone deacetylase 8 safeguards the human ever-shorter telomeres 1B (hEST1B) protein from ubiquitin-mediated degradation". Mol. Cell. Biol. ج. 26 ع. 14: 5259–69. DOI:10.1128/MCB.01971-05. PMC:1592721. PMID:16809764.